seq1 = pF1KE5190.tfa, 396 bp
seq2 = pF1KE5190/gi568815578f_54974644.tfa (gi568815578f:54974644_55175137), 200494 bp

>pF1KE5190 396
>gi568815578f:54974644_55175137 (Chr20)

1-111  (100001-100110)   98% ->
112-396  (100210-100494)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCCGAAGTTCGACCCCAACGAGATCAAAGTCGTATACCTGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCCGAAGTTCGACCCCAACGAGATCAAAGTCGTATACCTGAGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGGAGGTGAAGTCGGTGCCACTTCTGCCCTGGCCCCCAAGATCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGGAGGTGAAGTCGGTGCCACTTCTGCCCTGGCCCCCAAGATCGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGGGTCTG         ATTGAGGTGGTGCCTTCTGCCTCTGCCCTG
        ||||| ||||->>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGTGTCT GTC...CAGATTGAGGTGGTGCCTTCTGCCTCTGCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCATCAAAGCCCTCAAGGAACCACCAAGAGACAGAAAGAAACAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100240 ATCATCAAAGCCCTCAAGGAACCACCAAGAGACAGAAAGAAACAGAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTAAACACAGTGGGAATATCACTTTTGATGAGATTGTCAACATTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100290 CATTAAACACAGTGGGAATATCACTTTTGATGAGATCGTCAACATTGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACAGATGCGGCACCGATCCTTAGCCAGAGAACTCTCTGGAACCATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100340 GACAGATGCGGCACCGATCCTTAGCCAGAGAACTCTCTGGAACCATTAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGATCCTGGGGACTGCCCAGTCAGTGGGCTGTAATGTTGATGGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100390 GAGATCCTGGGGACTGCCCAGTCTGTGGGCTGTAATGTTGATGGCCGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCTCATGACATCATCGATGACATCAACAGTGGTGCTGTGGAATGCCCAG
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100440 CCCTCATGACATCATAGATGACATCAACAGTGGTGCTGTGGAATGCCCAG

    400     .
    392 CCAGT
        |||||
 100490 CCAGT