seq1 = pF1KE5187.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE5187/gi568815583r_30969836.tfa (gi568815583r:30969836_31170229), 200394 bp

>pF1KE5187 408
>gi568815583r:30969836_31170229 (Chr15)

(complement)

1-17  (93309-93325)   100% ->
18-408  (100004-100394)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGACTCTAACAG         GTGTTGCTGTGGCCAGTTCACCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  93309 ATGAAAGACTCTAACAGGTA...CAGGTGTTGCTGTGGCCAGTTCACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCAGCATATCCCCCCTCTGCCAAGTGCAACACCCAGCAAAAATGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 CCAGCATATCCCCCCTCTGCCAAGTGCAACACCCAGCAAAAATGAAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAACAAACAGGTGGAGACTCAGCCTGAGAAATGGTCTGTTGCCAAGCAC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 AAAGCAAACAGGTGGAGACTCAGCCTGAGAAATGGTCTGTTGCCAAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCAGAGCTACCCAACAGATTCCTATGGAGTTCTTGAATTCCAGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 ACCCAGAGCTACCCAACAGATTCCTATGGAGTTCTTGAATTCCAGGGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGATATTCCAATAAAGCCATGGTGAGAAAGGCATTCAGACATGGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100178 CGGATATTCCAATAAAGCCATGGTGAGAAAGGCATTCAGACATGGTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTAGGATCACAGCTTTCATTGGCGGCCAGTCTCCCAGCCCCAAACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100228 CTAGGATCACAGCTTTCATTGGCGGCCAGTCTCCCAGCCCCAAACTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATACCTGGTCTTCTTCATGGCTGTGGCTCAATCTTCCTAGATATTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100278 ATACCTGGTCTTCTTCATGGCTGTGGCTCAATCTTCCTAGATATTTCATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAAAACCAAGAGATATATCTGTGCACATGGCTTTTAGCCATGAGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100328 GAAAAACCAAGAGATATATCTGTGCACATGGCTTTTAGCCATGAGGCTTG

    400     .    :    .
    392 GAAACTGGACACCACTG
        |||||||||||||||||
 100378 GAAACTGGACACCACTG