seq1 = pF1KE5173.tfa, 507 bp
seq2 = pF1KE5173/gi568815581r_1758042.tfa (gi568815581r:1758042_1958446), 200405 bp

>pF1KE5173 507
>gi568815581r:1758042_1958446 (Chr17)

(complement)

1-68  (100001-100068)   100% ==
171-507  (100069-100405)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGCTGTTGCTGAGACACGTTGGTCGTCATTGCCTCCGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCGCTGTTGCTGAGACACGTTGGTCGTCATTGCCTCCGAGCCCA

     50     .    :    .
     51 CTTTAGCCCTCAGCTCTG
        ||||||||||||||||||
 100051 CTTTAGCCCTCAGCTCTG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    171 TATC TACAGTTGGTCTCTTCCCATGGCGATGTCCATCTGCCACCGTGGC
        ||||- | |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 TATCAGAAA TTGGTCTCTTCCCATGGCGATGTCCATCTGCCACCGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    220 ACTGGTATTGCTTTGAGTGCAGGGGTCTCTCTTTTTGGCATGTCGGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100118 ACTGGTATTGCTTTGAGTGCAGGGGTCTCTCTTTTTGGCATGTCGGCCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    270 GTTACTCCCTGGGAACTTTGAGTCTTATTTGGAACTTGTGAAGTCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100168 GTTACTCCCTGGGAACTTTGAGTCTTATTTGGAACTTGTGAAGTCCCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    320 GTCTGGGGCCAGCACTGATCCACACAGCTAAGTTTGCACTTGTCTTCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100218 GTCTGGGGCCAGCACTGATCCACACAGCTAAGTTTGCACTCGTCTTCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370 CTCATGTATCATACCTGGAATGGGATCCGACACTTGATGTGGGACCTAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100268 CTCATGTATCATACCTGGAATGGGATCCGACACTTGATGTGGAACCTAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    420 AAAAGGCCTGAAGATTCCCCAGCTATACCAGTCTGGAGTGGTTGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100318 AAAAGGCCTGAAGATTCCCCAGCTATACCAGTCTGGAGTGGTTGTCCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .
    470 TTCTTACTGTGTTGTCCTCTATGGGGCTGGCAGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100368 TTCTTACTGTGTTGTCCTCTATGGGGCTGGCAGCCATG