seq1 = pF1KE5125.tfa, 294 bp
seq2 = pF1KE5125/gi568815577r_43674205.tfa (gi568815577r:43674205_43876269), 202065 bp

>pF1KE5125 294
>gi568815577r:43674205_43876269 (Chr21)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-168  (101511-101612)   100% ->
169-294  (101940-102065)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTGCGGGGCGCCCTCCGCCACGCAGCCGGCCACCGCCGAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTGCGGGGCGCCCTCCGCCACGCAGCCGGCCACCGCCGAGACCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACATCGCCGACCAG         GTGAGGTCCCAGCTTGAAGAGAAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACATCGCCGACCAGGTG...TAGGTGAGGTCCCAGCTTGAAGAGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAACAAGAAGTTCCCTGTGTTTAAGGCCGTGTCATTCAAGAGCCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101536 AAAACAAGAAGTTCCCTGTGTTTAAGGCCGTGTCATTCAAGAGCCAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCGCGGGGACAAACTACTTCATCAAG         GTGCACGTCGGCGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101586 GTCGCGGGGACAAACTACTTCATCAAGGTA...CAGGTGCACGTCGGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGAGGACTTCGTACACCTGCGAGTGTTCCAATCTCTCCCTCATGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101954 CGAGGACTTCGTACACCTGCGAGTGTTCCAATCTCTCCCTCATGAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCCCTTGACCTTATCTAACTACCAGACCAACAAAGCCAAGCATGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102004 AGCCCTTGACCTTATCTAACTACCAGACCAACAAAGCCAAGCATGATGAG

    300     .    :
    283 CTGACCTATTTC
        ||||||||||||
 102054 CTGACCTATTTC