seq1 = pF1KE5061.tfa, 1173 bp
seq2 = pF1KE5061/gi568815587r_128739128.tfa (gi568815587r:128739128_128940265), 201138 bp

>pF1KE5061 1173
>gi568815587r:128739128_128940265 (Chr11)

(complement)

1-36  (97849-97884)   100% ->
37-1173  (100002-101138)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGCTTCCAGTCGGAATGTGTTTGACACGTTG         ATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  97849 ATGAATGCTTCCAGTCGGAATGTGTTTGACACGTTGGTA...CAGATCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGTGTTGACAGAAAGTATGTTCAAACATCTTCGGAAATGGGTCGTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 GGTGTTGACAGAAAGTATGTTCAAACATCTTCGGAAATGGGTCGTCACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 GCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGTGCAACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100107 AGGTGCAACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTTGTGGACATCTGGACAACGGTACTTGACCTCAAGTGGAGATACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100157 CTTTGTGGACATCTGGACAACGGTACTTGACCTCAAGTGGAGATACAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100207 TGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGGTCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGTGGTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100257 CTGTGGTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCTGCCAATCACACTCCCTGTGTGGAGAATATTAATGGCTTGACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100307 TTCTGCCAATCACACTCCCTGTGTGGAGAATATTAATGGCTTGACCTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGATTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100357 CTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGATTCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGTGTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100407 TGTGTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TATACTTGGAGTTATAATCAATTCTTTCATGTGTGGGGCCATCTTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100457 TATACTTGGAGTTATAATCAATTCTTTCATGTGTGGGGCCATCTTAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCAGCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100507 AGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCAGCAAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100557 GCAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TAATCTCAGGAAGAGCCTTCTTATTGGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100607 TAATCTCAGGAAGAGCCTTCTTATTGGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTTGGACCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100657 TGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTTGGACCAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100707 AATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCCATTGACAATTTACCATGTCATTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100757 CCCATTGACAATTTACCATGTCATTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTAGTGGTGTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100807 TGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTAGTGGTGTTTTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100857 GATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGTCCCAGAGGAGGTGCTTTGGGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100907 TGTCCCAGAGGAGGTGCTTTGGGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATAACTTTAGCAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100957 AGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATAACTTTAGCAAGACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101007 GTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGTTAGAGCCAGGATGAAGAGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101057 TGTTAGAGCCAGGATGAAGAGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGT

   1150     .    :    .    :    .    :
   1142 CAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101107 CAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG