seq1 = pF1KE5054.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KE5054/gi568815597f_84312426.tfa (gi568815597f:84312426_84514865), 202440 bp

>pF1KE5054 459
>gi568815597f:84312426_84514865 (Chr1)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-459  (102103-102440)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCAGCTGTGCACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCAGCTGTGCACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCACCACACTTCAGTCGGCCCAGGGACAAAAATTCCTCCATTTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCACCACACTTCAGTCGGCCCAGGGACAAAAATTCCTCCATTTTGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCGGATTCTTTTCTTGACG         ACATCTTTGCAGCCTGGATG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 AGTCGGATTCTTTTCTTGACGGTA...TAGACATCTTTGCAGCCTGGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTCAACGGCTGAAGACACACTTGTTAACAGAAACCTGGCAGCGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102123 GCTCAACGGCTGAAGACACACTTGTTAACAGAAACCTGGCAGCGAAAAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAAGAGCTTCCTTCAAACTGCTCCCTTCCTTACCATGTCTACAATATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102173 ACAAGAGCTTCCTTCAAACTGCTCCCTTCCTTACCATGTCTACAATATAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGCAATTAAATTATCACGACACTCTTATTTCAGTTCTTATCAAGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102223 AAGCAATTAAATTATCACGACACTCTTATTTCAGTTCTTATCAAGATCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCAAGTGGTGTATTTCCCAAAAGGGCACCAAAAATCGCTGGACATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102273 GCCAAGTGGTGTATTTCCCAAAAGGGCACCAAAAATCGCTGGACATGTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGAGACCTAAATCGGAGTCCACACCAAGCCTTCAGAAGTGGAGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102323 TGGAGACCTAAATCGGAGTCCACACCAAGCCTTCAGAAGTGGAGGATTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTGTACCCAGAATTGGCAAATTTACCAAGCATTTCAAGGATTAGTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102373 TTTGTACCCAGAATTGGCAAATTTACCAAGCATTTCAAGGATTAGTATTA

    450     .    :    .
    442 TACTATGAAAGCTGTAAG
        ||||||||||||||||||
 102423 TACTATGAAAGCTGTAAG