seq1 = pF1KE4583.tfa, 2520 bp
seq2 = pF1KE4583/gi568815592r_24329035.tfa (gi568815592r:24329035_24589511), 260477 bp

>pF1KE4583 2520
>gi568815592r:24329035_24589511 (Chr6)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-153  (103382-103437)   100% ->
154-232  (109553-109631)   100% ->
233-330  (113234-113331)   100% ->
331-441  (114281-114391)   100% ->
442-490  (115845-115893)   100% ->
491-545  (116876-116930)   100% ->
546-653  (122238-122345)   100% ->
654-681  (122573-122600)   100% ->
682-821  (122693-122832)   100% ->
822-887  (126717-126782)   100% ->
888-1008  (129113-129233)   100% ->
1009-1148  (132875-133014)   100% ->
1149-1335  (135311-135497)   100% ->
1336-1446  (139613-139723)   100% ->
1447-1521  (141304-141378)   100% ->
1522-1678  (141479-141635)   100% ->
1679-1820  (142533-142674)   100% ->
1821-1926  (143681-143786)   100% ->
1927-2020  (143873-143966)   100% ->
2021-2197  (152223-152399)   100% ->
2198-2358  (152776-152936)   100% ->
2359-2385  (156123-156149)   100% ->
2386-2436  (156275-156325)   100% ->
2437-2520  (160394-160477)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCTTTCAGGTTGTGGCCTGGCCTGCTGATCATGTTGGGTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCTTTCAGGTTGTGGCCTGGCCTGCTGATCATGTTGGGTTCTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCATAGAGGTTCACCGTGTGGCCTTTCAACACACGTAGAAATAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 CTGCCATAGAGGTTCACCGTGTGGCCTTTCAACACACGTAGAAATAGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       GACACAGAGCTCTGGAGTTTCTTCAGCTTCACAATGGGCGTGTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGGACACAGAGCTCTGGAGTTTCTTCAGCTTCACAATGGGCGTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTACAGAGAG         CTGTTACTAGAACACCAGGATGCGTATCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103426 AACTACAGAGAGGTA...CAGCTGTTACTAGAACACCAGGATGCGTATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCTGGAATCGTGTTTCCTGATTGTTTTTACCCTAGCATCTGCAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109582 GGCTGGAATCGTGTTTCCTGATTGTTTTTACCCTAGCATCTGCAAAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233          GAAAATTCCATGATGTGTCTGAGAGCACTCACTGGACTCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109632 GTA...CAGGAAAATTCCATGATGTGTCTGAGAGCACTCACTGGACTCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTCTTAATGCAAGCGTTCATTATATCCGAGAGAACTATCCCCTTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113275 TTTCTTAATGCAAGCGTTCATTATATCCGAGAGAACTATCCCCTTCCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAGAAG         GACACAGAGAAACTGGTAGCTTTCTTGTTTGGAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113325 GGAGAAGGTA...CAGGACACAGAGAAACTGGTAGCTTTCTTGTTTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTACTTCTCACATGGCGGCAGATGTCAGCTGGCATAGTCTGGGCCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114315 TTACTTCTCACATGGCGGCAGATGTCAGCTGGCATAGTCTGGGCCTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAAGGATTCCTTAGGACCATGGGAGCT         ATTGATTTTCACGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114365 CAAGGATTCCTTAGGACCATGGGAGCTGTG...TAGATTGATTTTCACGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTCCTATTCAGAGGCTCATTCGGCTGGTGATTTTG         GAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 115859 CTCCTATTCAGAGGCTCATTCGGCTGGTGATTTTGGTA...TAGGAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 ATGTGTTGAGCCAGTTTGAATTTAATTTTAATTACCTTGCACGACGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116882 ATGTGTTGAGCCAGTTTGAATTTAATTTTAATTACCTTGCACGACGCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    546         GTATGTGCCAGTCAAAGATCTACTGGGAATTTATGAGAAACT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116932 TA...CAGGTATGTGCCAGTCAAAGATCTACTGGGAATTTATGAGAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GTATGGTCGAAAAGTCATCACCGAAAATGTAATCGTTGATTGTTCACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122280 GTATGGTCGAAAAGTCATCACCGAAAATGTAATCGTTGATTGTTCACATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TCCAGTTCTTAGAAAT         GTATGGTGAGATGCTAGCTGTTTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122330 TCCAGTTCTTAGAAATGTA...CAGGTATGGTGAGATGCTAGCTGTTTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AAG         TTATATCCCACTTACTCTACAAAGTCCCCGTTTTTGGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122598 AAGGTA...TAGTTATATCCCACTTACTCTACAAAGTCCCCGTTTTTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GGAACAATTCCAAGAGTATTTTCTTGGAGGACTGGATGATATGGCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122731 GGAACAATTCCAAGAGTATTTTCTTGGAGGACTGGATGATATGGCATTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 GGTCCACTAATATTTACCATCTAACAAGCTTCATGTTGGAGAATGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122781 GGTCCACTAATATTTACCATCTAACAAGCTTCATGTTGGAGAATGGGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AG         TGACTGCAACCTGCCTGAGAACCCTCTGTTCATTGCATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122831 AGGTG...CAGTGACTGCAACCTGCCTGAGAACCCTCTGTTCATTGCATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGGCGGCCAGCAAAACCACACCCAGGG         CTCAAAAATGCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 126756 TGGCGGCCAGCAAAACCACACCCAGGGGTA...CAGCTCAAAAATGCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 AAAATGATTTTCACAGAAATTTGACTACATCCCTAACTGAAAGTGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129127 AAAATGATTTTCACAGAAATTTGACTACATCCCTAACTGAAAGTGTTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 AGGAATATAAACTATACTGAAAGAGGAGTGTTCTTTAGTGTAAATTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129177 AGGAATATAAACTATACTGAAAGAGGAGTGTTCTTTAGTGTAAATTCCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GACCCCG         GATTCCATGTCCTTTATCTACAAGGCTTTGGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129227 GACCCCGGTA...CAGGATTCCATGTCCTTTATCTACAAGGCTTTGGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 GGAACATAAGGACAATGTTCATAGGTGGCTCTCAGTTGTCACAAAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132909 GGAACATAAGGACAATGTTCATAGGTGGCTCTCAGTTGTCACAAAAGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 GTCTCCAGCCCCTTAGCATCTTACTTCTTGTCATTTCCTTATGCGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132959 GTCTCCAGCCCCTTAGCATCTTACTTCTTGTCATTTCCTTATGCGAGGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TGGCTG         GGCAATGACCTCAGCTGACCTCAACCAGGATGGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133009 TGGCTGGTA...AAGGGCAATGACCTCAGCTGACCTCAACCAGGATGGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 ACGGTGACCTCGTGGTGGGCGCACCAGGCTACAGCCGCCCCGGCCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135346 ACGGTGACCTCGTGGTGGGCGCACCAGGCTACAGCCGCCCCGGCCACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 CACATCGGGCGCGTGTACCTCATCTACGGCAATGACCTGGGCCTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135396 CACATCGGGCGCGTGTACCTCATCTACGGCAATGACCTGGGCCTGCCACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TGTTGACCTGGACCTGGACAAGGAGGCCCACAGGATCCTTGAAGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135446 TGTTGACCTGGACCTGGACAAGGAGGCCCACAGGATCCTTGAAGGCTTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AG         CCCTCAGGTCGGTTTGGCTCGGCCTTGGCTGTGTTGGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135496 AGGTG...CAGCCCTCAGGTCGGTTTGGCTCGGCCTTGGCTGTGTTGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 TTTAACGTGGACGGCGTGCCTGACCTGGCCGTGGGAGCTCCCTCGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139652 TTTAACGTGGACGGCGTGCCTGACCTGGCCGTGGGAGCTCCCTCGGTGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 CTCCGAGCAGCTCACCTACAAA         GGTGCCGTGTATGTCTACT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 139702 CTCCGAGCAGCTCACCTACAAAGTA...TAGGGTGCCGTGTATGTCTACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TTGGTTCCAAACAAGGAGGAATGTCTTCTTCCCCTAACATCACCATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141323 TTGGTTCCAAACAAGGAGGAATGTCTTCTTCCCCTAACATCACCATTTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 TGCCAG         GACATCTACTGTAACTTGGGCTGGACTCTCTTGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141373 TGCCAGGTA...AAGGACATCTACTGTAACTTGGGCTGGACTCTCTTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 TGCAGATGTGAATGGAGACAGTGAACCCGATCTGGTCATCGGCTCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141514 TGCAGATGTGAATGGAGACAGTGAACCCGATCTGGTCATCGGCTCCCCTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 TTGCACCAGGTGGAGGGAAGCAGAAGGGAATTGTGGCTGCGTTTTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141564 TTGCACCAGGTGGAGGGAAGCAGAAGGGAATTGTGGCTGCGTTTTATTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GGCCCCAGCCTGAGCGACAAAG         AAAAACTGAACGTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 141614 GGCCCCAGCCTGAGCGACAAAGGTA...TAGAAAAACTGAACGTGGAGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 AGCCAACTGGACGGTGAGAGGCGAGGAAGACTTCTCCTGGTTTGGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142552 AGCCAACTGGACGGTGAGAGGCGAGGAAGACTTCTCCTGGTTTGGATATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 CCCTTCACGGTGTCACTGTGGACAACAGAACCTTGCTGTTGGTTGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142602 CCCTTCACGGTGTCACTGTGGACAACAGAACCTTGCTGTTGGTTGGGAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 CCGACCTGGAAGAATGCCAGCAG         GCTGGGCCATTTGTTACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 142652 CCGACCTGGAAGAATGCCAGCAGGTG...TAGGCTGGGCCATTTGTTACA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CATCCGAGATGAGAAAAAGAGCCTTGGGAGGGTGTATGGCTACTTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143699 CATCCGAGATGAGAAAAAGAGCCTTGGGAGGGTGTATGGCTACTTCCCAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 CAAACGGCCAAAGCTGGTTTACCATTTCTGGAGACAAG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 143749 CAAACGGCCAAAGCTGGTTTACCATTTCTGGAGACAAGGTA...CAGGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 ATGGGGAAACTGGGTACTTCCCTTTCCAGTGGCCACGTACTGATGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143876 ATGGGGAAACTGGGTACTTCCCTTTCCAGTGGCCACGTACTGATGAATGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 GACTCTGAAACAAGTGCTGCTGGTTGGAGCCCCTACGTACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 143926 GACTCTGAAACAAGTGCTGCTGGTTGGAGCCCCTACGTACGGTA...CAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 ATGACGTGTCTAAGGTGGCATTCCTGACCGTGACCCTACACCAAGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152223 ATGACGTGTCTAAGGTGGCATTCCTGACCGTGACCCTACACCAAGGCGGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 GCCACTCGCATGTACGCACTCACATCTGACGCGCAGCCTCTGCTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152273 GCCACTCGCATGTACGCACTCACATCTGACGCGCAGCCTCTGCTGCTCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 CACCTTCAGCGGAGACCGCCGCTTCTCCCGATTTGGTGGCGTTCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152323 CACCTTCAGCGGAGACCGCCGCTTCTCCCGATTTGGTGGCGTTCTGCACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 TGAGTGACCTGGATGATGATGGCTTAG         ATGAAATCATCATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 152373 TGAGTGACCTGGATGATGATGGCTTAGGTA...CAGATGAAATCATCATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 GCAGCCCCCCTGAGGATAGCAGATGTAACCTCTGGACTGATTGGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152790 GCAGCCCCCCTGAGGATAGCAGATGTAACCTCTGGACTGATTGGGGGAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 AGACGGCCGAGTATATGTATATAATGGCAAAGAGACCACCCTTGGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152840 AGACGGCCGAGTATATGTATATAATGGCAAAGAGACCACCCTTGGTGACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 TGACTGGCAAATGCAAATCATGGATAACTCCATGTCCAGAAGAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 152890 TGACTGGCAAATGCAAATCATGGATAACTCCATGTCCAGAAGAAAAGGTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2359       GCCCAATATGTATTGATTTCTCCTGAA         GCCAGCTC
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 152940 ...CAGGCCCAATATGTATTGATTTCTCCTGAAGTA...CAGGCCAGCTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2394 AAGGTTTGGGAGCTCCCTCATCACCGTGAGGTCCAAGGCAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 156283 AAGGTTTGGGAGCTCCCTCATCACCGTGAGGTCCAAGGCAAAGGTG...C

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2437   AACCAAGTCGTCATTGCTGCTGGAAGGAGTTCTTTGGGAGCCCGACTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160392 AGAACCAAGTCGTCATTGCTGCTGGAAGGAGTTCTTTGGGAGCCCGACTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .
   2485 TCCGGGGCACTTCACGTCTATAGCCTTGGCTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160442 TCCGGGGCACTTCACGTCTATAGCCTTGGCTCAGAT