seq1 = pF1KE4578.tfa, 2322 bp
seq2 = pF1KE4578/gi568815590r_23198046.tfa (gi568815590r:23198046_23468351), 270306 bp

>pF1KE4578 2322
>gi568815590r:23198046_23468351 (Chr8)

(complement)

1-355  (100001-100355)   100% ->
356-531  (108087-108262)   100% ->
532-743  (127149-127360)   100% ->
744-966  (134729-134951)   99% ->
967-1150  (139787-139970)   99% ->
1151-1302  (146071-146222)   100% ->
1303-1470  (148300-148467)   100% ->
1471-1636  (151238-151403)   100% ->
1637-1880  (158441-158684)   99% ->
1881-1996  (164955-165070)   100% ->
1997-2133  (166189-166325)   100% ->
2134-2245  (169405-169516)   100% ->
2246-2322  (170230-170306)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGGCCTCTGTGCTCCCACCTCTGCAGCTGCCTGGCTATGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGGCCTCTGTGCTCCCACCTCTGCAGCTGCCTGGCTATGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCTGTCCCCCCTGAGCCTGGCACAGTATGACAGCTGGCCCCATTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCCTGTCCCCCCTGAGCCTGGCACAGTATGACAGCTGGCCCCATTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGTACTTCCAGCAACCGGCTCCTGAGTATCACCAGCCCCAGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAGTACTTCCAGCAACCGGCTCCTGAGTATCACCAGCCCCAGGCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAACGTGGCCAAGATTCAGCTGCGCCTGGCTGGGCAGAAGAGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAACGTGGCCAAGATTCAGCTGCGCCTGGCTGGGCAGAAGAGGAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCGAGGGCCGGGTGGAGGTGTACTATGATGGCCAGTGGGGCACCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCGAGGGCCGGGTGGAGGTGTACTATGATGGCCAGTGGGGCACCGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGATGACGACTTCTCCATCCACGCTGCCCACGTCGTCTGCCGGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGATGACGACTTCTCCATCCACGCTGCCCACGTCGTCTGCCGGGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTACGTGGAGGCCAAGTCCTGGACTGCCAGCTCCTCCTACGGCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTACGTGGAGGCCAAGTCCTGGACTGCCAGCTCCTCCTACGGCAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAAG         GGCCCATCTGGTTAGACAATCTCCACTGTACTGGCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAAGGTA...CAGGGCCCATCTGGTTAGACAATCTCCACTGTACTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGAGGCGACCCTTGCAGCATGCACCTCCAATGGCTGGGGCGTCACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108123 ACGAGGCGACCCTTGCAGCATGCACCTCCAATGGCTGGGGCGTCACTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCAAGCACACGGAGGATGTCGGTGTGGTGTGCAGCGACAAAAGGATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108173 TGCAAGCACACGGAGGATGTCGGTGTGGTGTGCAGCGACAAAAGGATTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGGTTCAAATTTGACAATTCGTTGATCAACCAGATAGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108223 TGGGTTCAAATTTGACAATTCGTTGATCAACCAGATAGAGGCA...CAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACCTGAATATCCAGGTGGAGGACATTCGGATTCGAGCCATCCTCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127150 ACCTGAATATCCAGGTGGAGGACATTCGGATTCGAGCCATCCTCTCAACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TACCGCAAGCGCACCCCAGTGATGGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127200 TACCGCAAGCGCACCCCAGTGATGGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAAGACCTGGAAGCAGATCTGTGACAAGCACTGGACGGCCAAGAATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127250 CAAGACCTGGAAGCAGATCTGTGACAAGCACTGGACGGCCAAGAATTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCGTGGTCTGCGGCATGTTTGGCTTCCCTGGGGAGAGGACATACAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127300 GCGTGGTCTGCGGCATGTTTGGCTTCCCTGGGGAGAGGACATACAATACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAAGTGTACAA         AATGTTTGCCTCACGGAGGAAGCAGCGCTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 127350 AAAGTGTACAAGTA...CAGAATGTTTGCCTCACGGAGGAAGCAGCGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGGCCATTCTCCATGGACTGCACCGGCACAGAGGCCCACATCTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134759 CTGGCCATTCTCCATGGACTGCACCGGCACAGAGGCCCACATCTCCAGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCAAGCTGGGCCCCCAGGTGTCACTGGACCCCATGAAGAATGTCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134809 GCAAGCTGGGCCCCCAGGTGTCACTGGACCCCATGAAGAATGTCACCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAGAATGGGCTACCGGCCGTGGTGAGTTGTGTGCCTGGGCAGGTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134859 GAGAATGGGCTACCGGCCGTGGTGAGTTGTGTGCCTGGGCAGGTCTTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCCTGACGGACCCTCGAGATTCCGGAAAGCGTACAAGCCAGAG       
        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 134909 CCCTGACGGACCCTCAAGATTCCGGAAAGCGTACAAGCCAGAGGTG...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    967   CAACCCCTGGTGCGACTGAGAGGCGGTGCCTACATCGGGGAGGGCCGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139785 AGCAACCCCTGGTGCGACTGAGAGGCGGTGCCTACATCGGGGAGGGCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTGGAGGTGCTCAAAAATGGAGAGTGGGGGACCGTCTGCGACGACAAGTG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 139835 GTGGAGGTGCTCAAAAATGGAGAATGGGGGACCGTCTGCGACGACAAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGACCTGGTGTCGGCCAGTGTGGTCTGCAGAGAGCTGGGCTTTGGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139885 GGACCTGGTGTCGGCCAGTGTGGTCTGCAGAGAGCTGGGCTTTGGGAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CCAAAGAGGCAGTCACTGGCTCCCGACTGGGGCAAG         GGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 139935 CCAAAGAGGCAGTCACTGGCTCCCGACTGGGGCAAGGTA...CAGGGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GGACCCATCCACCTCAACGAGATCCAGTGCACAGGCAATGAGAAGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146076 GGACCCATCCACCTCAACGAGATCCAGTGCACAGGCAATGAGAAGTCCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TATAGACTGCAAGTTCAATGCCGAGTCTCAGGGCTGCAACCACGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146126 TATAGACTGCAAGTTCAATGCCGAGTCTCAGGGCTGCAACCACGAGGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ATGCTGGTGTGAGATGCAACACCCCTGCCATGGGCTTGCAGAAGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 146176 ATGCTGGTGTGAGATGCAACACCCCTGCCATGGGCTTGCAGAAGAAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1303       CTGCGCCTGAACGGCGGCCGCAATCCCTACGAGGGCCGAGTGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146226 ...CAGCTGCGCCTGAACGGCGGCCGCAATCCCTACGAGGGCCGAGTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGTGCTGGTGGAGAGAAACGGGTCCCTTGTGTGGGGGATGGTGTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148344 GGTGCTGGTGGAGAGAAACGGGTCCCTTGTGTGGGGGATGGTGTGTGGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AAAACTGGGGCATCGTGGAGGCCATGGTGGTCTGCCGCCAGCTGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148394 AAAACTGGGGCATCGTGGAGGCCATGGTGGTCTGCCGCCAGCTGGGCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GGATTCGCCAGCAACGCCTTCCAG         GAGACCTGGTATTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 148444 GGATTCGCCAGCAACGCCTTCCAGGTG...CAGGAGACCTGGTATTGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CGGAGATGTCAACAGCAACAAAGTGGTCATGAGTGGAGTGAAGTGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151255 CGGAGATGTCAACAGCAACAAAGTGGTCATGAGTGGAGTGAAGTGCTCGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GAACGGAGCTGTCCCTGGCGCACTGCCGCCACGACGGGGAGGACGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151305 GAACGGAGCTGTCCCTGGCGCACTGCCGCCACGACGGGGAGGACGTGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TGCCCCCAGGGCGGAGTGCAGTACGGGGCCGGAGTTGCCTGCTCAGAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 151355 TGCCCCCAGGGCGGAGTGCAGTACGGGGCCGGAGTTGCCTGCTCAGAAAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1637         CCGCCCCTGACCTGGTCCTCAATGCGGAGATGGTGCAGCAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151405 TG...CAGCCGCCCCTGACCTGGTCCTCAATGCGGAGATGGTGCAGCAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 CCACCTACCTGGAGGACCGGCCCATGTTCCTGCTGCAGTGTGCCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 158483 CCACCTACCTGGAGGACCGGCCCATGTTCATGCTGCAGTGTGCCATGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GAGAACTGCCTCTCGGCCTCAGCCGCGCAGACCGACCCCACCACGGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158533 GAGAACTGCCTCTCGGCCTCAGCCGCGCAGACCGACCCCACCACGGGCTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CCGCCGGCTCCTGCGCTTCTCCTCCCAGATCCACAACAATGGCCAGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158583 CCGCCGGCTCCTGCGCTTCTCCTCCCAGATCCACAACAATGGCCAGTCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 ACTTCCGGCCCAAGAACGGCCGCCACGCGTGGATCTGGCACGACTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158633 ACTTCCGGCCCAAGAACGGCCGCCACGCGTGGATCTGGCACGACTGTCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 AG         GCACTACCACAGCATGGAGGTGTTCACCCACTATGACCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158683 AGGTA...CAGGCACTACCACAGCATGGAGGTGTTCACCCACTATGACCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 GCTGAACCTCAATGGCACCAAGGTGGCAGAGGGCCACAAGGCCAGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164994 GCTGAACCTCAATGGCACCAAGGTGGCAGAGGGCCACAAGGCCAGCTTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 GCTTGGAGGACACAGAATGTGAAGGAG         ACATCCAGAAGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 165044 GCTTGGAGGACACAGAATGTGAAGGAGGTA...CAGACATCCAGAAGAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 TACGAGTGTGCCAACTTCGGCGATCAGGGCATCACCATGGGCTGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166203 TACGAGTGTGCCAACTTCGGCGATCAGGGCATCACCATGGGCTGCTGGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 CATGTACCGCCATGACATCGACTGCCAGTGGGTTGACATCACTGACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166253 CATGTACCGCCATGACATCGACTGCCAGTGGGTTGACATCACTGACGTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CCCCTGGAGACTACCTGTTCCAG         GTTGTTATTAACCCCAAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 166303 CCCCTGGAGACTACCTGTTCCAGGTG...TAGGTTGTTATTAACCCCAAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 TTCGAGGTTGCAGAATCCGATTACTCCAACAACATCATGAAATGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169423 TTCGAGGTTGCAGAATCCGATTACTCCAACAACATCATGAAATGCAGGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 CCGCTATGACGGCCACCGCATCTGGATGTACAACTGCCACATAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 169473 CCGCTATGACGGCCACCGCATCTGGATGTACAACTGCCACATAGGTA...

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2246    GTGGTTCCTTCAGCGAAGAGACGGAAAAAAAGTTTGAGCACTTCAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170227 CAGGTGGTTCCTTCAGCGAAGAGACGGAAAAAAAGTTTGAGCACTTCAGC

   2400     .    :    .    :    .    :
   2293 GGGCTCTTAAACAACCAGCTGTCCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 170277 GGGCTCTTAAACAACCAGCTGTCCCCGCAG