seq1 = pF1KE4520.tfa, 1671 bp
seq2 = pF1KE4520/gi568815588f_93658145.tfa (gi568815588f:93658145_93897800), 239656 bp

>pF1KE4520 1671
>gi568815588f:93658145_93897800 (Chr10)

1-215  (100001-100215)   100% ->
216-287  (100616-100687)   100% ->
288-359  (119235-119306)   100% ->
360-431  (119402-119473)   100% ->
432-503  (131955-132026)   100% ->
504-673  (134599-134768)   99% ->
674-838  (135042-135206)   100% ->
839-1671  (138824-139656)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATCAGAAAGAAGCAAAAGGATGGGAAATGCCTGCATTCCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATCAGAAAGAAGCAAAAGGATGGGAAATGCCTGCATTCCCCTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGAATTGCTTATTTCCTATGTCTCTTATCTGCGCTTTTGCTGACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGAATTGCTTATTTCCTATGTCTCTTATCTGCGCTTTTGCTGACTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAAGAAACCAGCGAAGCCAAAATGCCCTGCCGTGTGTACTTGTACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGAAGAAACCAGCGAAGCCAAAATGCCCTGCCGTGTGTACTTGTACCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATAATGCTTTATGTGAGAATGCCAGATCCATTCCACGCACCGTTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATAATGCTTTATGTGAGAATGCCAGATCCATTCCACGCACCGTTCCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATGTTATCTCATT         ATCCTTTGTGAGATCTGGTTTTACTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGATGTTATCTCATTGTA...CAGATCCTTTGTGAGATCTGGTTTTACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAATCTCAGAAGGGAGTTTTTTATTCACGCCATCGCTGCAGCTCTT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100642 AAATCTCAGAAGGGAGTTTTTTATTCACGCCATCGCTGCAGCTCTTGTG.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    288      GTTATTCACATCGAACTCCTTTGATGTGATCAGTGATGATGCTTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 ..CAGGTTATTCACATCGAACTCCTTTGATGTGATCAGTGATGATGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TATTGGTCTTCCACATCTAGAGTATTT         ATTCATAGAAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 119280 TATTGGTCTTCCACATCTAGAGTATTTGTA...CAGATTCATAGAAAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAACATCAAGTCAATTTCAAGACATACTTTCCGGGGACTAAAGTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119416 ACAACATCAAGTCAATTTCAAGACATACTTTCCGGGGACTAAAGTCATTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTCACTT         GAGCCTTGCAAACAACAATCTCCAGACACTCCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 119466 ATTCACTTGTA...CAGGAGCCTTGCAAACAACAATCTCCAGACACTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAAAGATATTTTCAAAGGCCTGGATTCTTTAACAAATGT         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 131988 AAAAGATATTTTCAAAGGCCTGGATTCTTTAACAAATGTGTA...CAGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACCTGAGGGGTAATTCATTTAATTGTGACTGTAAACTGAAATGGCTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134601 ACCTGAGGGGTAATTCATTTAATTGTGACTGTAAACTGAAATGGCTAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAATGGCTTGGCCACACCAATGCAACTGTTGAAGACATCTACTGCGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134651 GAATGGCTTGGCCACACCAATGCAACTGTTGAAGACATCTACTGCGAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCCCCCAGAATACAAGAAGCGCAAAATCAATAGTCTCTCCTCGAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134701 CCCCCCAGAATACAAGAAGCGCAAAATCAATAGTCTCTCCTCGAAGGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCGATTGCATCATTACAG         AATTTGCAAAGTCTCAAGACCTG
        | ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 134751 TTGATTGCATCATTACAGGTA...CAGAATTTGCAAAGTCTCAAGACCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTTATCAATCATTGTCCATAGACACTTTTTCTTATTTGAATGATGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135065 CCTTATCAATCATTGTCCATAGACACTTTTTCTTATTTGAATGATGAGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGTAGTCATCGCTCAGCCTTTTACTGGAAAATGCATTTTCCTTGAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135115 TGTAGTCATCGCTCAGCCTTTTACTGGAAAATGCATTTTCCTTGAATGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCATGTGGAAAAGACCTTCCGGAATTATGACAACATTACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 135165 ACCATGTGGAAAAGACCTTCCGGAATTATGACAACATTACAGGTA...CA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    839  GCACATCCACTGTAGTATGCAAGCCTATAGTCATTGAAACTCAGCTCTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138823 GGCACATCCACTGTAGTATGCAAGCCTATAGTCATTGAAACTCAGCTCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTTATTGTGGCCCAGCTGTTTGGTGGCTCTCACATCTATAAGCGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138873 TGTTATTGTGGCCCAGCTGTTTGGTGGCTCTCACATCTATAAGCGAGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GTTTTGCAAATAAATTCATAAAAATCCAGGATATTGAAATTCTCAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138923 GTTTTGCAAATAAATTCATAAAAATCCAGGATATTGAAATTCTCAAAATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGAAAACCCAATGACATTGAAACATTCAAGATTGAAAACAACTGGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138973 CGAAAACCCAATGACATTGAAACATTCAAGATTGAAAACAACTGGTACTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGTTGTTGCTGACAGTTCAAAAGCTGGTTTTACTACCATTTACAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139023 TGTTGTTGCTGACAGTTCAAAAGCTGGTTTTACTACCATTTACAAATGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACGGAAACGGATTCTACTCCCATCAATCCTTACACGCGTGGTACAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139073 ACGGAAACGGATTCTACTCCCATCAATCCTTACACGCGTGGTACAGGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACTGATGTGGAATATCTAGAAATAGTCAGAACACCTCAGACACTCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139123 ACTGATGTGGAATATCTAGAAATAGTCAGAACACCTCAGACACTCAGAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCCTCATTTAATTCTGTCTAGTAGTTCCCAGCGTCCTGTAATTTATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139173 GCCTCATTTAATTCTGTCTAGTAGTTCCCAGCGTCCTGTAATTTATCAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GGAACAAAGCAACACAATTATTCACTAACCAAACTGACATTCCTAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139223 GGAACAAAGCAACACAATTATTCACTAACCAAACTGACATTCCTAACATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GAGGATGTGTACGCAGTGAAGCACTTCTCAGTGAAAGGGGACGTGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139273 GAGGATGTGTACGCAGTGAAGCACTTCTCAGTGAAAGGGGACGTGTACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TTGCTTGACAAGATTCATTGGTGATTCCAAAGTCATGAAATGGGGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139323 TTGCTTGACAAGATTCATTGGTGATTCCAAAGTCATGAAATGGGGAGGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CCTCGTTCCAGGATATTCAGAGGATGCCATCGCGAGGATCCATGGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139373 CCTCGTTCCAGGATATTCAGAGGATGCCATCGCGAGGATCCATGGTGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CAGCCTCTTCAAATAAATAATTACCAATATGCAATTCTTGGAAGTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139423 CAGCCTCTTCAAATAAATAATTACCAATATGCAATTCTTGGAAGTGATTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CTCCTTTACTCAAGTGTATAACTGGGATGCAGAGAAAGCCAAATTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139473 CTCCTTTACTCAAGTGTATAACTGGGATGCAGAGAAAGCCAAATTTGTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 AATTTCAGGAATTAAATGTTCAGGCACCAAGATCATTCACACATGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139523 AATTTCAGGAATTAAATGTTCAGGCACCAAGATCATTCACACATGTGTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 ATTAATAAGCGTAATTTTCTTTTTGCTTCCAGTTTTAAGGGAAATACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139573 ATTAATAAGCGTAATTTTCTTTTTGCTTCCAGTTTTAAGGGAAATACACA

   1700     .    :    .    :    .    :
   1638 GATTTACAAACATGTCATAGTTGACTTAAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139623 GATTTACAAACATGTCATAGTTGACTTAAGCGCA