seq1 = pF1KE4481.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KE4481/gi568815588r_15009700.tfa (gi568815588r:15009700_15268612), 258913 bp

>pF1KE4481 1494
>gi568815588r:15009700_15268612 (Chr10)

(complement)

1-110  (100001-100110)   100% ->
111-246  (127056-127191)   100% ->
247-391  (133195-133339)   100% ->
392-510  (135250-135368)   100% ->
511-602  (135469-135560)   100% ->
603-719  (135680-135796)   100% ->
720-890  (138301-138471)   100% ->
891-999  (140155-140263)   99% ->
1000-1170  (149100-149270)   100% ->
1171-1338  (155650-155817)   100% ->
1339-1476  (158774-158911)   100% ->
1477-1494  (159398-159415)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGACAGCGAGTCTGCGGCCAGCCAGCAGAGCCTGGAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGGACAGCGAGTCTGCGGCCAGCCAGCAGAGCCTGGAACTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCAGGACACGTGCGGGATAGACGGGGACAATGAGGAGGAGACGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACCAGGACACGTGCGGGATAGACGGGGACAATGAGGAGGAGACGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGCCAAAGG         AAGTCCTGGAGGGTATTTGGGAGCCAAAAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGCCAAAGGGTA...CAGAAGTCCTGGAGGGTATTTGGGAGCCAAAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAAGAAGAAACAGAAGAGAAAAAAGGAGAAACCAAATTCCGGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127087 AAAAAGAAGAAACAGAAGAGAAAAAAGGAGAAACCAAATTCCGGAGGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGTCAGACTCGGCATCTGATTCCCAGGAGATTAAAATTCAGCAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127137 CAAGTCAGACTCGGCATCTGATTCCCAGGAGATTAAAATTCAGCAGCCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGAAA         AATCCCAGTGTTCCAATGCAGAAGTTGCAGGATATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127187 CGAAAGTG...TAGAATCCCAGTGTTCCAATGCAGAAGTTGCAGGATATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGAGAGCAATGGAGCTGCTATCCGCATGCCAGGGCCCAGCCAGGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133231 CAGAGAGCAATGGAGCTGCTATCCGCATGCCAGGGCCCAGCCAGGAACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATGAGGCTGCAAAGCACAGATACCAGTTTTGGGACACACAACCGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133281 TGATGAGGCTGCAAAGCACAGATACCAGTTTTGGGACACACAACCGGTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAAAACTAG         ATGAAGTCATAACATCTCATGGTGCAATTGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 133331 CAAAACTAGGTA...CAGATGAAGTCATAACATCTCATGGTGCAATTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAGATAAAGACAACGTACGCCAAGAACCGTATTCTTTGCCACAGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135282 CCAGATAAAGACAACGTACGCCAAGAACCGTATTCTTTGCCACAGGGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATGTGGGACACTTTAGACTTGAGTGATGCCGAAGTG         CTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 135332 TATGTGGGACACTTTAGACTTGAGTGATGCCGAAGTGGTG...TAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGAGTTATACACGTTGTTAAATGAGAATTACGTAGAAGATGATGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135473 AGGAGTTATACACGTTGTTAAATGAGAATTACGTAGAAGATGATGACAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGTTCCGATTTGACTATTCACCCGAGTTCCTGTTGTG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 135523 ATGTTCCGATTTGACTATTCACCCGAGTTCCTGTTGTGGTA...CAGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCTGCGTCCACCAGGCTGGCTCCTGCAGTGGCACTGTGGGGTCAGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135683 TCTGCGTCCACCAGGCTGGCTCCTGCAGTGGCACTGTGGGGTCAGAGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTTCAAATAAAAAACTGGTCGGGTTCATAAGTGCCATCCCAGCAAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135733 CTTCAAATAAAAAACTGGTCGGGTTCATAAGTGCCATCCCAGCAAACATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGGATTTATGACAG         TGTGAAGAAGATGGTAGAAATCAACTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 135783 CGGATTTATGACAGGTA...TAGTGTGAAGAAGATGGTAGAAATCAACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCTTTGTGTTCATAAGAAGTTGAGATCGAAACGGGTAGCCCCAGTGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138328 TCTTTGTGTTCATAAGAAGTTGAGATCGAAACGGGTAGCCCCAGTGCTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCCGAGAGATCACTAGAAGAGTGAACCTGGAAGGGATCTTCCAGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138378 TCCGAGAGATCACTAGAAGAGTGAACCTGGAAGGGATCTTCCAGGCTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TACACCGCGGGAGTGGTTCTTCCTAAGCCCATAGCCACATGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 138428 TACACCGCGGGAGTGGTTCTTCCTAAGCCCATAGCCACATGCAGGTA...

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    891    ATACTGGCATCGATCACTAAACCCCAAAAAATTGGTAGAAGTGAAAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 140152 CAGATACTGGCATCGATCACTAAACCCCAGAAAATTGGTAGAAGTGAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTTCTCACTTGAGTAGAAATATGACTTTACAGAGAACAATGAAGCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140202 TTTCTCACTTGAGTAGAAATATGACTTTACAGAGAACAATGAAGCTATAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGACTTCCAGAT         GTTACAAAGACTTCAGGTTTGAGACCAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 140252 AGACTTCCAGATGTA...AAGGTTACAAAGACTTCAGGTTTGAGACCAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGAACCAAAAGATATCAAATCAGTTCGAGAATTAATCAACACTTACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149129 GGAACCAAAAGATATCAAATCAGTTCGAGAATTAATCAACACTTACCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCAGTTTCATCTGGCTCCAGTGATGGATGAAGAGGAAGTAGCCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149179 AGCAGTTTCATCTGGCTCCAGTGATGGATGAAGAGGAAGTAGCCCACTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTCCTCCCCCGGGAGCACATTATTGACACGTTTGTAGTGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 149229 TTCCTCCCCCGGGAGCACATTATTGACACGTTTGTAGTGGAGGTA...TA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1171  AGCCCCAACGGTAAACTGACTGATTTCCTGAGCTTCTATACGCTCCCCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155649 GAGCCCCAACGGTAAACTGACTGATTTCCTGAGCTTCTATACGCTCCCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCACGGTGATGCACCACCCTGCTCACAAGAGCCTCAAAGCCGCCTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155699 CCACGGTGATGCACCACCCTGCTCACAAGAGCCTCAAAGCCGCCTACTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTCTACAACATCCACACAGAGACGCCCCTGCTGGACCTCATGAGCGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155749 TTCTACAACATCCACACAGAGACGCCCCTGCTGGACCTCATGAGCGACGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCTCATCCTGGCTAAATCG         AAAGGATTTGATGTATTCAATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 155799 GCTCATCCTGGCTAAATCGGTA...CAGAAAGGATTTGATGTATTCAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CACTGGATTTGATGGAAAATAAGACATTCTTGGAAAAACTCAAGTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158796 CACTGGATTTGATGGAAAATAAGACATTCTTGGAAAAACTCAAGTTTGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ATAGGAGATGGCAATTTGCAGTATTACCTGTACAATTGGAGGTGTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158846 ATAGGAGATGGCAATTTGCAGTATTACCTGTACAATTGGAGGTGTCCAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TACAGATTCTGAAAAG         GTTGGACTAGTACTACAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 158896 TACAGATTCTGAAAAGGTA...CAGGTTGGACTAGTACTACAA