seq1 = pF1KE4453.tfa, 1419 bp
seq2 = pF1KE4453/gi568815581r_41509938.tfa (gi568815581r:41509938_41712688), 202751 bp

>pF1KE4453 1419
>gi568815581r:41509938_41712688 (Chr17)

(complement)

1-531  (100001-100531)   100% ->
532-614  (100968-101050)   100% ->
615-771  (101188-101344)   100% ->
772-933  (101459-101620)   100% ->
934-1059  (101710-101835)   100% ->
1060-1280  (102138-102358)   100% ->
1281-1327  (102453-102499)   100% ->
1328-1419  (102660-102751)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCACCTGCAGCCGCCAGTTCACCTCCTCCAGCTCCATGAAGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCACCTGCAGCCGCCAGTTCACCTCCTCCAGCTCCATGAAGGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCGGCATCGGAGGCGGCATCGGGGGCGGCTCCAGCCGCATCTCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCGGCATCGGAGGCGGCATCGGGGGCGGCTCCAGCCGCATCTCCTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGGCCGGAGGGTCCTGCCGTGCCCCCAGCACCTACGGGGGCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTGGCCGGAGGGTCCTGCCGTGCCCCCAGCACCTACGGGGGCGGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGTCTCCTCTCGCTTCTCCTCTGGGGGAGCCTGCGGGCTGGGGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGTCTCCTCTCGCTTCTCCTCTGGGGGAGCCTGCGGGCTGGGGGGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTATGGCGGTGGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCTTTGGTAGTGGCTTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTATGGCGGTGGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCTTTGGTAGTGGCTTCGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGGATATGGTGGTGGCCTTGGTGCTGGCTTCGGTGGTGGCTTGGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGGATATGGTGGTGGCCTTGGTGCTGGCTTCGGTGGTGGCTTGGGTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTTTGGTGGTGGTTTTGCTGGTGGTGATGGGCTTCTGGTGGGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTTTGGTGGTGGTTTTGCTGGTGGTGATGGGCTTCTGGTGGGCAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGGTGACCATGCAGAACCTCAATGACCGCCTGGCCTCCTACCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAGGTGACCATGCAGAACCTCAATGACCGCCTGGCCTCCTACCTGGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGTGCGTGCTCTGGAGGAGGCCAACGCCGACCTGGAAGTGAAGATCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGTGCGTGCTCTGGAGGAGGCCAACGCCGACCTGGAAGTGAAGATCCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACTGGTACCAGAGGCAGCGGCCCAGTGAGATCAAAGACTACAGTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACTGGTACCAGAGGCAGCGGCCCAGTGAGATCAAAGACTACAGTCCCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCAAGACCATCGAGGACCTGAGGAACAAG         ATCATTGCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100501 CTTCAAGACCATCGAGGACCTGAGGAACAAGGTG...CAGATCATTGCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCACCATTGAGAATGCGCAGCCCATTTTGCAGATTGACAATGCCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100978 CCACCATTGAGAATGCGCAGCCCATTTTGCAGATTGACAATGCCAGGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCAGCCGATGACTTCAGGACCAA         GTATGAGCATGAACTGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101028 GCAGCCGATGACTTCAGGACCAAGTG...CAGGTATGAGCATGAACTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTGCGGCAGACTGTGGAGGCCGACGTCAATGGCCTGCGCCGGGTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101206 CCTGCGGCAGACTGTGGAGGCCGACGTCAATGGCCTGCGCCGGGTGTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATGAGCTGACCCTGGCCAGGACTGACCTGGAGATGCAGATCGAAGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101256 ATGAGCTGACCCTGGCCAGGACTGACCTGGAGATGCAGATCGAAGGCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAGGAGGAGCTGGCCTACCTGAGGAAGAACCACGAGGAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101306 AAGGAGGAGCTGGCCTACCTGAGGAAGAACCACGAGGAGGTA...CAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GATGCTTGCTCTGAGAGGTCAGACCGGCGGAGATGTGAACGTGGAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101461 GATGCTTGCTCTGAGAGGTCAGACCGGCGGAGATGTGAACGTGGAGATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATGCTGCACCTGGCGTGGACCTGAGCCGCATCCTGAATGAGATGCGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101511 ATGCTGCACCTGGCGTGGACCTGAGCCGCATCCTGAATGAGATGCGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGTACGAGCAGATGGCAGAGAAAAACCGCAGAGACGCTGAGACCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101561 CAGTACGAGCAGATGGCAGAGAAAAACCGCAGAGACGCTGAGACCTGGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCTGAGCAAG         ACCGAGGAGCTGAACAAAGAAGTGGCCTCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101611 CCTGAGCAAGGTG...CAGACCGAGGAGCTGAACAAAGAAGTGGCCTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACAGCGAACTGGTACAGAGCAGCCGCAGTGAGGTGACGGAGCTCCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101741 ACAGCGAACTGGTACAGAGCAGCCGCAGTGAGGTGACGGAGCTCCGGAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTGCTCCAGGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTCAGCATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101791 GTGCTCCAGGGCCTGGAGATTGAGCTGCAGTCCCAGCTCAGCATGGTA..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1060     AAAGCATCCCTGGAGAACAGCCTGGAGGAGACCAAAGGCCGCTACT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101841 .CAGAAAGCATCCCTGGAGAACAGCCTGGAGGAGACCAAAGGCCGCTACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCATGCAGCTGTCCCAGATCCAGGGACTGATTGGCAGTGTGGAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102184 GCATGCAGCTGTCCCAGATCCAGGGACTGATTGGCAGTGTGGAGGAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTGGCCCAGCTACGCTGTGAGATGGAGCAGCAGAGCCAGGAGTACCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102234 CTGGCCCAGCTACGCTGTGAGATGGAGCAGCAGAGCCAGGAGTACCAGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CTTGCTGGATGTGAAGACGCGGCTGGAGCAGGAGATTGCCACCTACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102284 CTTGCTGGATGTGAAGACGCGGCTGGAGCAGGAGATTGCCACCTACCGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GCCTGCTGGAGGGCGAGGATGCCCA         CCTTTCCTCCCAGCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102334 GCCTGCTGGAGGGCGAGGATGCCCAGTG...CAGCCTTTCCTCCCAGCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GCATCTGGCCAATCCTATTCTTCCCGCGAGG         TCTTCACCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102469 GCATCTGGCCAATCCTATTCTTCCCGCGAGGGTA...CAGTCTTCACCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CTCCTCGTCCTCTTCGAGCCGTCAGACCCGGCCCATCCTCAAGGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 CTCCTCGTCCTCTTCGAGCCGTCAGACCCGGCCCATCCTCAAGGAGCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :
   1388 GCTCATCCAGCTTCAGCCAGGGCCAGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 GCTCATCCAGCTTCAGCCAGGGCCAGAGCTCC