seq1 = pF1KE4367.tfa, 1158 bp
seq2 = pF1KE4367/gi568815590r_23037873.tfa (gi568815590r:23037873_23263935), 226063 bp

>pF1KE4367 1158
>gi568815590r:23037873_23263935 (Chr8)

(complement)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-256  (108957-109062)   100% ->
257-370  (115385-115498)   100% ->
371-482  (116864-116975)   100% ->
483-736  (118015-118268)   100% ->
737-768  (118847-118878)   100% ->
769-954  (119301-119486)   99% ->
955-1027  (125676-125748)   100% ->
1028-1158  (125933-126063)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACTTTGGGGACAAAGCGTCCCGACCGCCTCGAGCGCTCGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACTTTGGGGACAAAGCGTCCCGACCGCCTCGAGCGCTCGAGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCTATCCAGGAGCCAGGACAGCGTCGGGAACCAGACCATGGCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCTATCCAGGAGCCAGGACAGCGTCGGGAACCAGACCATGGCTCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCCAAGATCCTTAAGTTCGTCGTCTTCATCGTCGCGGTTCTGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCCCAAGATCCTTAAGTTCGTCGTCTTCATCGTCGCGGTTCTGCTGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          GTCCGGGTTGACTCTGCCACCATCCCCCGGCAGGACGAAGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTG...CAGGTCCGGGTTGACTCTGCCACCATCCCCCGGCAGGACGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCCCAGCAGACAGTGGCCCCACAGCAACAGAGGCGCAGCCTCAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108998 TCCCCAGCAGACAGTGGCCCCACAGCAACAGAGGCGCAGCCTCAAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAGTGTCCAGCAG         GATCTCATAGATCAGAATATACTGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109048 AGGAGTGTCCAGCAGGTG...CAGGATCTCATAGATCAGAATATACTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCTGTAACCCGTGCACAGAGGGTGTGGATTACACCATTGCTTCCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115411 GCCTGTAACCCGTGCACAGAGGGTGTGGATTACACCATTGCTTCCAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTGCCTTCTTGCCTGCTATGTACAGTTTGTAAATCAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 115461 TTTGCCTTCTTGCCTGCTATGTACAGTTTGTAAATCAGGTA...CAGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAACAAATAAAAGTTCCTGTACCACGACCAGAGACACCGTGTGTCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116867 AAACAAATAAAAGTTCCTGTACCACGACCAGAGACACCGTGTGTCAGTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAAAAGGAAGCTTCCAGGATAAAAACTCCCCTGAGATGTGCCGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116917 GAAAAAGGAAGCTTCCAGGATAAAAACTCCCCTGAGATGTGCCGGACGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAGAACAGG         GTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCAGTAATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116967 TAGAACAGGGTA...CAGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCAGTAATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTACGCCCCGGAGTGACATCAAGTGCAAAAATGAATCAGCTGCCAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118047 GTACGCCCCGGAGTGACATCAAGTGCAAAAATGAATCAGCTGCCAGTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACTGGGAAAACCCCAGCAGCGGAGGAGACAGTGACCACCATCCTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118097 ACTGGGAAAACCCCAGCAGCGGAGGAGACAGTGACCACCATCCTGGGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTTGCCTCTCCCTATCACTACCTTATCATCATAGTGGTTTTAGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118147 GCTTGCCTCTCCCTATCACTACCTTATCATCATAGTGGTTTTAGTCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTTTAGCTGTGGTTGTGGTTGGCTTTTCATGTCGGAAGAAATTCATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118197 TTTTAGCTGTGGTTGTGGTTGGCTTTTCATGTCGGAAGAAATTCATTTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TACCTCAAAGGCATCTGCTCAG         GTGGTGGAGGAGGTCCCGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 118247 TACCTCAAAGGCATCTGCTCAGGTA...CAGGTGGTGGAGGAGGTCCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACGTGTGCACAGA         GTCCTTTTCCGGCGGCGTTCATGTCCTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 118866 ACGTGTGCACAGAGTG...AAGGTCCTTTTCCGGCGGCGTTCATGTCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CACGAGTTCCTGGGGCGGAGGACAATGCCCGCAACGAGACCCTGAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119329 CACGAGTTCCTGGGGCGGAGGACAATGCCCGCAACGAGACCCTGAGTAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGATACTTGCAGCCCACCCAGGTCTCTGAGCAGGAAATCCAAGGTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119379 AGATACTTGCAGCCCACCCAGGTCTCTGAGCAGGAAATCCAAGGTCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCTGGCAGAGCTAACAGGTGTGACTGTAGAGTCGCCAGAGGAGCCACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 119429 GCTGGCAGAGCTAACAGGTGTGACTGTAGAGTTGCCAGAGGAGCCACAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTCTGCTG         GAACAGGCAGAAGCTGAAGGGTGTCAGAGGAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 119479 GTCTGCTGGTG...CAGGAACAGGCAGAAGCTGAAGGGTGTCAGAGGAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGGCTGCTGGTTCCAGTGAATGACGCTGACTCCGCTGACA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 125709 AGGCTGCTGGTTCCAGTGAATGACGCTGACTCCGCTGACAGTA...CAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CAGCACCTTGCTGGATGCCTCGGCAACACTGGAAGAAGGACATGCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125934 CAGCACCTTGCTGGATGCCTCGGCAACACTGGAAGAAGGACATGCAAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAACAATTCAGGACCAACTGGTGGGCTCCGAAAAGCTCTTTTATGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125984 AAACAATTCAGGACCAACTGGTGGGCTCCGAAAAGCTCTTTTATGAAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :
   1129 GATGAGGCAGGCTCTGCTACGTCCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 126034 GATGAGGCAGGCTCTGCTACGTCCTGCCTG