seq1 = pF1KE4364.tfa, 1143 bp
seq2 = pF1KE4364/gi568815579r_45206753.tfa (gi568815579r:45206753_45419713), 212961 bp

>pF1KE4364 1143
>gi568815579r:45206753_45419713 (Chr19)

(complement)

1-193  (100001-100193)   100% ->
194-348  (101735-101889)   100% ->
349-481  (104117-104249)   99% ->
482-653  (107794-107965)   100% ->
654-777  (111182-111305)   99% ->
778-967  (112064-112253)   100% ->
968-1143  (112786-112961)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCATTCGGTAACACCCACAACAAGTTCAAGCTGAATTACAAGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCATTCGGTAACACCCACAACAAGTTCAAGCTGAATTACAAGCCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGTACCCCGACCTCAGCAAACATAACAACCACATGGCCAAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGTACCCCGACCTCAGCAAACATAACAACCACATGGCCAAGGTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGACCCTTGAACTCTACAAGAAGCTGCGGGACAAGGAGACTCCATCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGACCCTTGAACTCTACAAGAAGCTGCGGGACAAGGAGACTCCATCTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCACTGTAGACGATGTCATCCAGACAGGAGTGGACAACCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100151 TTCACTGTAGACGATGTCATCCAGACAGGAGTGGACAACCCAGGTG...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194   GTCACCCCTTCATCATGACCGTGGGCTGCGTGGCTGGTGATGAGGAGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101733 AGGTCACCCCTTCATCATGACCGTGGGCTGCGTGGCTGGTGATGAGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTACGAAGTTTTCAAGGAACTCTTTGACCCCATCATCTCGGATCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101783 CCTACGAAGTTTTCAAGGAACTCTTTGACCCCATCATCTCGGATCGCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGGGCTACAAACCCACTGACAAGCACAAGACTGACCTCAACCATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101833 GGGGGCTACAAACCCACTGACAAGCACAAGACTGACCTCAACCATGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCAAG         GGTGGAGACGACCTGGACCCCAACTACGTGCTCA
        |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| |||||||||||||
 101883 CCTCAAGGTC...CAGGGTGGAGACGACCTGGACCCTAACTACGTGCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAGCCGCGTCCGCACTGGCCGCAGCATCAAGGGCTACACGTTGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104151 GCAGCCGCGTCCGCACTGGCCGCAGCATCAAGGGCTACACGTTGCCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACTGCTCCCGTGGCGAGCGCCGGGCGGTGGAGAAGCTCTCTGTGGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104201 CACTGCTCCCGTGGCGAGCGCCGGGCGGTGGAGAAGCTCTCTGTGGAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482         CTCTCAACAGCCTGACGGGCGAGTTCAAAGGGAAGTACTACC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104251 TG...TAGCTCTCAACAGCCTGACGGGCGAGTTCAAAGGGAAGTACTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCTGAAGAGCATGACGGAGAAGGAGCAGCAGCAGCTCATCGATGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107836 CTCTGAAGAGCATGACGGAGAAGGAGCAGCAGCAGCTCATCGATGACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCCTGTTCGACAAGCCCGTGTCCCCGCTGCTGCTGGCCTCAGGCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107886 TTCCTGTTCGACAAGCCCGTGTCCCCGCTGCTGCTGGCCTCAGGCATGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCGCGACTGGCCCGACGCCCGTGGCATCTG         GCACAATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107936 CCGCGACTGGCCCGACGCCCGTGGCATCTGGTG...TAGGCACAATGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAAGAGCCTCCTGGTGTGGGTGAACGAGGAGGATCACCTCCGGGTCATC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111193 ACAAGAGCTTCCTGGTGTGGGTGAACGAGGAGGATCACCTCCGGGTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCCATGGAGAAGGGGGGCAACATGAAGGAGGTTTTCCGCCGCTTCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111243 TCCATGGAGAAGGGGGGCAACATGAAGGAGGTTTTCCGCCGCTTCTGCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGGGCTGCAGAAG         ATTGAGGAGATCTTTAAGAAAGCTGGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111293 AGGGCTGCAGAAGGTG...CAGATTGAGGAGATCTTTAAGAAAGCTGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACCCCTTCATGTGGAACCAGCACCTGGGCTACGTGCTCACCTGCCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112092 ACCCCTTCATGTGGAACCAGCACCTGGGCTACGTGCTCACCTGCCCATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AACCTGGGCACTGGGCTGCGTGGAGGCGTGCATGTGAAGCTGGCGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112142 AACCTGGGCACTGGGCTGCGTGGAGGCGTGCATGTGAAGCTGGCGCACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAGCAAGCACCCCAAGTTCGAGGAGATCCTCACCCGCCTGCGTCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112192 GAGCAAGCACCCCAAGTTCGAGGAGATCCTCACCCGCCTGCGTCTGCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGAGGGGTACAG         GTGGCGTGGACACAGCTGCCGTGGGCTCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 112242 AGAGGGGTACAGGTA...CAGGTGGCGTGGACACAGCTGCCGTGGGCTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTATTTGACGTGTCCAACGCTGATCGGCTGGGCTCGTCCGAAGTAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112815 GTATTTGACGTGTCCAACGCTGATCGGCTGGGCTCGTCCGAAGTAGAACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGTGCAGCTGGTGGTGGATGGTGTGAAGCTCATGGTGGAAATGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112865 GGTGCAGCTGGTGGTGGATGGTGTGAAGCTCATGGTGGAAATGGAGAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1097 AGTTGGAGAAAGGCCAGTCCATCGACGACATGATCCCCGCCCAGAAG
        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 112915 AGTTGGAGAAAGGCCAGTCCATTGACGACATGATCCCCGCCCAGAAG