seq1 = pF1KE4318.tfa, 972 bp
seq2 = pF1KE4318/gi568815588r_98329538.tfa (gi568815588r:98329538_98543240), 213703 bp

>pF1KE4318 972
>gi568815588r:98329538_98543240 (Chr10)

(complement)

1-117  (100001-100117)   99% ->
118-255  (107469-107606)   100% ->
256-398  (107827-107969)   100% ->
399-507  (109150-109258)   100% ->
508-668  (111950-112110)   100% ->
669-768  (112571-112670)   100% ->
769-867  (113352-113450)   100% ->
868-972  (113599-113703)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGCGTCTTGGTGGCCACTGAGGGCGCAGAGGTCCTCTTCTACTG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTGCGTCTTGGTGGCCACTGAGGGCGCAGAGGTCCTCTTCTACTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAGATCAGGAGTTTGAAGAGAGTCTCCGGCTGAAGTTCGGGCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAGATCAGGAGTTTGAAGAGAGTCTCCGGCTGAAGTTCGGGCAGTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAATGAGGAAGAAGAG         CTCCCTGCCCTGGAGGACCAGCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAATGAGGAAGAAGAGGTG...CAGCTCCCTGCCCTGGAGGACCAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCACCCTCCTAGCCCCGGTCATCATCTCCTCCATGACGATGCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107493 AGCACCCTCCTAGCCCCGGTCATCATCTCCTCCATGACGATGCTGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTCTCGGACACCTACACCTGCTTCTCCACGGAAAATGGCAACTTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107543 GCTCTCGGACACCTACACCTGCTTCTCCACGGAAAATGGCAACTTCCTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGTCCTTCACCTG         TTTGGAGAATGCCTGTTCATTGCCATC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107593 ATGTCCTTCACCTGGTG...CAGTTTGGAGAATGCCTGTTCATTGCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGGTGACCACACCGAGAGCGAGGGGGACCTGCGGCGGAAGCTGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107854 AATGGTGACCACACCGAGAGCGAGGGGGACCTGCGGCGGAAGCTGTATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTCAAGTACCTGTTTGAAGTGCACTTTGGGCTGGTGACTGTGGACGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107904 GCTCAAGTACCTGTTTGAAGTGCACTTTGGGCTGGTGACTGTGGACGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCTTATCCGAAAGGA         GCTGCGGCCCCCAGACCTGGCGCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107954 ATCTTATCCGAAAGGAGTG...CAGGCTGCGGCCCCCAGACCTGGCGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGTGTCCAGCTGTGGGAGCACTTCCAGAGCCTGCTGTGGACCTACAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109175 CGTGTCCAGCTGTGGGAGCACTTCCAGAGCCTGCTGTGGACCTACAGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGCGGGAGCAGGAGCAGTGCTTCGCCGTGGAG         GCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109225 CCTGCGGGAGCAGGAGCAGTGCTTCGCCGTGGAGGTG...TAGGCCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCGACTGATTCACCCCCAGCTCTGTGAGCTGTGCATAGAGGCGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111957 AGCGACTGATTCACCCCCAGCTCTGTGAGCTGTGCATAGAGGCGCTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGGCACGTCATCCAGGCTGTCAACACCAGCCCCGAGCGGGGAGGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112007 CGGCACGTCATCCAGGCTGTCAACACCAGCCCCGAGCGGGGAGGCGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGCCCTGCATGCCTTCCTGCTCGTGCACTCCAAGCTGCTGGCATTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112057 GGCCCTGCATGCCTTCCTGCTCGTGCACTCCAAGCTGCTGGCATTCTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTAG         CCACAGTGCCAGCTCCCTGCGCCCGGCCGACCTGCTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112107 CTAGGTG...CAGCCACAGTGCCAGCTCCCTGCGCCCGGCCGACCTGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCCTCATCCTCCTGGTTCAGGACCTCTACCCCAGCGAGAGCACAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112608 GCCCTCATCCTCCTGGTTCAGGACCTCTACCCCAGCGAGAGCACAGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGACGACATTCAG         CCTTCCCCGCGGAGGGCCCGGAGCAGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 112658 GGACGACATTCAGGTC...CAGCCTTCCCCGCGGAGGGCCCGGAGCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGAACATCCCCGTGCAGCAGGCCTGGAGCCCTCACTCCACGGGCCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113380 AGAACATCCCCGTGCAGCAGGCCTGGAGCCCTCACTCCACGGGCCCAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGGGGAGCTCTGCAGAGACG         GAGACAGACAGCTTCTCCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113430 GGGGGGAGCTCTGCAGAGACGGTG...CAGGAGACAGACAGCTTCTCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCCTGAGGAGTACTTCACACCAGCTCCTTCCCCTGGCGATCAGAGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 113619 CCCTGAGGAGTACTTCACACCAGCTCCTTCCCCTGGCGATCAGAGCTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .
    938 GTGAGGACCGGAGGAAAGCAGGAGGAAACAATAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113669 GTGAGGACCGGAGGAAAGCAGGAGGAAACAATAGC