seq1 = pF1KE4314.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE4314/gi568815588f_4863445.tfa (gi568815588f:4863445_5077739), 214295 bp

>pF1KE4314 969
>gi568815588f:4863445_5077739 (Chr10)

(complement)

1-84  (73905-73988)   100% ->
85-252  (76059-76226)   100% ->
253-369  (77074-77190)   100% ->
370-447  (78463-78540)   100% ->
448-570  (78993-79115)   100% ->
571-680  (81875-81984)   100% ->
681-846  (82256-82421)   100% ->
847-929  (85827-85909)   100% ->
930-969  (87702-87741)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  73905 ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCCTGGGATTTGGCACCTATGCGCCTGCAGAG         GTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  73955 TGTCCTGGGATTTGGCACCTATGCGCCTGCAGAGGTA...CAGGTTCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  76066 AAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATATTGATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  76116 CATATTGATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTGAAGAGAGAAGACATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  76166 CATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTGAAGAGAGAAGACATATTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACACTTCAAAG         CTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
  76216 ACACTTCAAAGGTA...CAGCTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCCGACCAGCCTTGGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77104 GTCCGACCAGCCTTGGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAAAG         CCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
  77154 TGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAAAGGTA...CAGCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGAGGAAGTGATCCCAAAAGATGAAAATGGAAAAATACTATTTGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  78467 GTGAGGAAGTGATCCCAAAAGATGAAAATGGAAAAATACTATTTGACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGATCTCTGTGCCACATGGGAG         GCCATGGAGAAGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  78517 GTGGATCTCTGTGCCACATGGGAGGTG...CAGGCCATGGAGAAGTGTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79010 AGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTGGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79060 TGCTGGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACCAG         GTGGAATGTCATCCTTACTTCAACCAGAGAAAACT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79110 AACCAGGTG...CAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCAACCAGAGAAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  81910 GCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGGATCCCATCGAGAAGAACCATG         GGTGGACCCGAACTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  81960 TGGGATCCCATCGAGAAGAACCATGGTA...CAGGGTGGACCCGAACTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  82272 CCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAAGCACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  82322 GCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGTCCTGGCCAAGAGCTACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  82372 TGGTCCTGGCCAAGAGCTACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847          GTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  82422 GTG...TAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  85868 AGATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATGTA...CA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    930  TTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGATGAATAT
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  87701 GTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGATGAATAT