Result of SIM4 for
pF1KE4269
seq1 = pF1KE4269.tfa, 3387 bp
seq2 = pF1KE4269/gi568815590r_129954734.tfa (gi568815590r:129954734_130501943), 547210 bp
>pF1KE4269 3387
>gi568815590r:129954734_130501943 (Chr8)
(complement)
53-186 (143796-143927) 97% ->
187-259 (264950-265022) 100% ->
260-405 (287243-287388) 100% ->
406-480 (313761-313835) 100% ->
481-530 (314659-314708) 100% ->
531-660 (321064-321193) 100% ->
661-746 (322595-322680) 100% ->
747-822 (332877-332952) 100% ->
823-909 (334322-334408) 100% ->
910-1010 (341980-342080) 100% ->
1011-1080 (349139-349208) 98% ->
1081-1168 (364906-364993) 100% ->
1169-1217 (367600-367648) 100% ->
1218-1381 (373854-374017) 100% ->
1382-1515 (375855-375988) 100% ->
1516-1607 (377840-377931) 100% ->
1608-1794 (383269-383455) 100% ->
1795-1880 (383698-383783) 100% ->
1881-1996 (384949-385064) 100% ->
1997-2064 (385199-385266) 100% ->
2065-2172 (386209-386316) 100% ->
2173-2401 (389622-389850) 100% ->
2402-2572 (409801-409971) 100% ->
2573-2642 (421973-422042) 100% ->
2643-2701 (425538-425596) 100% ->
2702-3192 (440875-441365) 100% ->
3193-3315 (443868-443990) 100% ->
3316-3387 (447139-447210) 100%
0 . : . : . : . : . :
53 GGAATCGGATGCCGGACCAGATCTCTGTCTCGGAGTTCATCGCCGAGACC
|| |--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143796 GGCA GGATGCCGGACCAGATCTCTGTCTCGGAGTTCATCGCCGAGACC
50 . : . : . : . : . :
103 ACCGAGGACTACAACTCGCCCACCACGTCCAGCTTCACCACGCGGCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143844 ACCGAGGACTACAACTCGCCCACCACGTCCAGCTTCACCACGCGGCTGCA
100 . : . : . : . : . :
153 CAACTGCAGGAACACCGTCACGCTGCTGGAGGAG GCTCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
143894 CAACTGCAGGAACACCGTCACGCTGCTGGAGGAGGTA...TAGGCTCTAG
150 . : . : . : . : . :
194 ACCAAGATAGAACAGCCCTTCAGAAAGTGAAGAAGTCTGTAAAAGCAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
264957 ACCAAGATAGAACAGCCCTTCAGAAAGTGAAGAAGTCTGTAAAAGCAATA
200 . : . : . : . : . :
244 TATAATTCTGGTCAAG ATCATGTACAAAATGAAGAAAACTA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
265007 TATAATTCTGGTCAAGGTA...TAGATCATGTACAAAATGAAGAAAACTA
250 . : . : . : . : . :
285 TGCACAAGTTCTTGATAAGTTTGGGAGTAATTTTTTAAGTCGAGACAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
287268 TGCACAAGTTCTTGATAAGTTTGGGAGTAATTTTTTAAGTCGAGACAACC
300 . : . : . : . : . :
335 CCGACCTTGGCACCGCGTTTGTCAAGTTTTCTACTCTTACAAAGGAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
287318 CCGACCTTGGCACCGCGTTTGTCAAGTTTTCTACTCTTACAAAGGAACTG
350 . : . : . : . : . :
385 TCCACACTGCTGAAAAATCTG CTCCAGGGTTTGAGCCACAA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
287368 TCCACACTGCTGAAAAATCTGGTA...CAGCTCCAGGGTTTGAGCCACAA
400 . : . : . : . : . :
426 TGTGATCTTCACCTTGGATTCTTTGTTAAAAGGAGACCTAAAGGGAGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
313781 TGTGATCTTCACCTTGGATTCTTTGTTAAAAGGAGACCTAAAGGGAGTCA
450 . : . : . : . : . :
476 AAGGA GATCTCAAGAAGCCATTTGACAAAGCCTGGAAAGAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
313831 AAGGAGTA...AAGGATCTCAAGAAGCCATTTGACAAAGCCTGGAAAGAT
500 . : . : . : . : . :
517 TATGAGACAAAGTT TACAAAAATTGAGAAAGAGAAAAGAGA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
314695 TATGAGACAAAGTTGTA...CAGTACAAAAATTGAGAAAGAGAAAAGAGA
550 . : . : . : . : . :
558 GCACGCAAAACAACATGGGATGATCCGCACAGAGATAACAGGAGCTGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
321091 GCACGCAAAACAACATGGGATGATCCGCACAGAGATAACAGGAGCTGAGA
600 . : . : . : . : . :
608 TTGCGGAAGAAATGGAGAAGGAAAGGCGCCTCTTTCAGCTCCAAATGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
321141 TTGCGGAAGAAATGGAGAAGGAAAGGCGCCTCTTTCAGCTCCAAATGTGT
650 . : . : . : . : . :
658 GAA TATCTCATTAAAGTTAATGAAATCAAGACCAAAAAGGG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
321191 GAAGTA...CAGTATCTCATTAAAGTTAATGAAATCAAGACCAAAAAGGG
700 . : . : . : . : . :
699 TGTGGATCTGCTGCAGAATCTTATAAAGTATTACCATGCACAGTGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
322633 TGTGGATCTGCTGCAGAATCTTATAAAGTATTACCATGCACAGTGCAAGT
750 . : . : . : . : . :
747 TTTCTTTCAAGATGGCTTGAAAACAGCTGATAAGTTGAAACAG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
322683 G...TAGTTTCTTTCAAGATGGCTTGAAAACAGCTGATAAGTTGAAACAG
800 . : . : . : . : . :
790 TACATTGAAAAACTGGCTGCTGATTTATATAAT ATAAAACA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
332920 TACATTGAAAAACTGGCTGCTGATTTATATAATGTA...TAGATAAAACA
850 . : . : . : . : . :
831 GACCCAGGATGAAGAAAAGAAACAGCTAACTGCACTCCGAGACTTAATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
334330 GACCCAGGATGAAGAAAAGAAACAGCTAACTGCACTCCGAGACTTAATAA
900 . : . : . : . : . :
881 AATCCTCTCTTCAACTGGATCAGAAAGAA GATTCTCAGAGC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
334380 AATCCTCTCTTCAACTGGATCAGAAAGAAGTA...TAGGATTCTCAGAGC
950 . : . : . : . : . :
922 CGGCAAGGAGGATACAGCATGCATCAGCTCCAGGGCAATAAGGAATATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
341992 CGGCAAGGAGGATACAGCATGCATCAGCTCCAGGGCAATAAGGAATATGG
1000 . : . : . : . : . :
972 CAGTGAAAAGAAGGGGTACCTGCTAAAGAAAAGTGACGG GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
342042 CAGTGAAAAGAAGGGGTACCTGCTAAAGAAAAGTGACGGGTA...TAGGA
1050 . : . : . : . : . :
1013 TCCGGAAAGTATGGCAGAGGAGGAAGTGTTCAGTCAAGAATGGGATTCTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
349141 TCCGGAAAGTATGGCAGAGGAGGAAGTGTTCAGTCAAGAATGGGATTCTG
1100 . : . : . : . : . :
1063 ACCATCTCACATGCCACA TCTAACAGGCAACCAGCCAAGTT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
349191 ACCATCTCACATGCCACAGTA...CAGTCTAACAGGCAACCAGCCAAGTT
1150 . : . : . : . : . :
1104 GAACCTTCTCACCTGCCAAGTAAAACCTAATGCCGAAGACAAAAAATCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
364929 GAACCTTCTCACCTGCCAAGTAAAACCTAATGCCGAAGACAAAAAATCTT
1200 . : . : . : . : . :
1154 TTGACCTGATATCAC ATAATAGAACATATCACTTTCAGGCA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
364979 TTGACCTGATATCACGTG...TAGATAATAGAACATATCACTTTCAGGCA
1250 . : . : . : . : . :
1195 GAAGATGAGCAGGATTATGTAGC ATGGATATCAGTATTGAC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
367626 GAAGATGAGCAGGATTATGTAGCGTA...CAGATGGATATCAGTATTGAC
1300 . : . : . : . : . :
1236 AAATAGCAAAGAAGAGGCCCTAACCATGGCCTTCCGTGGAGAGCAGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373872 AAATAGCAAAGAAGAGGCCCTAACCATGGCCTTCCGTGGAGAGCAGAGTG
1350 . : . : . : . : . :
1286 CGGGAGAGAACAGCCTGGAAGACCTGACAAAAGCCATTATTGAGGATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373922 CGGGAGAGAACAGCCTGGAAGACCTGACAAAAGCCATTATTGAGGATGTC
1400 . : . : . : . : . :
1336 CAGCGGCTCCCAGGGAATGACATTTGCTGCGATTGTGGCTCATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
373972 CAGCGGCTCCCAGGGAATGACATTTGCTGCGATTGTGGCTCATCAGGTT.
1450 . : . : . : . : . :
1382 AACCCACCTGGCTTTCAACCAACTTGGGTATTTTGACCTGTATAG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
374022 ..CAGAACCCACCTGGCTTTCAACCAACTTGGGTATTTTGACCTGTATAG
1500 . : . : . : . : . :
1427 AATGTTCTGGCATCCATAGGGAAATGGGGGTTCATATTTCTCGCATTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
375900 AATGTTCTGGCATCCATAGGGAAATGGGGGTTCATATTTCTCGCATTCAG
1550 . : . : . : . : . :
1477 TCTTTGGAACTAGACAAATTAGGAACTTCTGAACTCTTG CT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
375950 TCTTTGGAACTAGACAAATTAGGAACTTCTGAACTCTTGGTA...CAGCT
1600 . : . : . : . : . :
1518 GGCCAAGAATGTAGGAAACAATAGTTTTAATGATATTATGGAAGCAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
377842 GGCCAAGAATGTAGGAAACAATAGTTTTAATGATATTATGGAAGCAAATT
1650 . : . : . : . : . :
1568 TACCCAGCCCCTCACCAAAACCCACCCCTTCAAGTGATAT G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
377892 TACCCAGCCCCTCACCAAAACCCACCCCTTCAAGTGATATGTA...TAGG
1700 . : . : . : . : . :
1609 ACTGTACGAAAAGAATATATCACTGCAAAGTATGTAGATCATAGGTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383270 ACTGTACGAAAAGAATATATCACTGCAAAGTATGTAGATCATAGGTTTTC
1750 . : . : . : . : . :
1659 AAGGAAGACCTGTTCAACTTCATCAGCTAAACTAAATGAATTGCTTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383320 AAGGAAGACCTGTTCAACTTCATCAGCTAAACTAAATGAATTGCTTGAGG
1800 . : . : . : . : . :
1709 CCATCAAATCCAGGGATTTACTTGCACTAATTCAAGTCTATGCAGAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383370 CCATCAAATCCAGGGATTTACTTGCACTAATTCAAGTCTATGCAGAAGGG
1850 . : . : . : . : . :
1759 GTAGAGCTAATGGAACCACTGCTGGAACCTGGGCAG GAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
383420 GTAGAGCTAATGGAACCACTGCTGGAACCTGGGCAGGTA...TAGGAGCT
1900 . : . : . : . : . :
1800 TGGGGAGACAGCCCTTCACCTTGCCGTCCGAACTGCAGATCAGACATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383703 TGGGGAGACAGCCCTTCACCTTGCCGTCCGAACTGCAGATCAGACATCTC
1950 . : . : . : . : . :
1850 TCCATTTGGTTGACTTCCTTGTACAAAACTG TGGGAACCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
383753 TCCATTTGGTTGACTTCCTTGTACAAAACTGGTA...CAGTGGGAACCTG
2000 . : . : . : . : . :
1891 GATAAGCAGACGGCCCTGGGAAACACAGTTCTACACTACTGTAGTATGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
384959 GATAAGCAGACGGCCCTGGGAAACACAGTTCTACACTACTGTAGTATGTA
2050 . : . : . : . : . :
1941 CAGTAAACCTGAGTGTTTGAAGCTTTTGCTCAGGAGCAAGCCCACTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385009 CAGTAAACCTGAGTGTTTGAAGCTTTTGCTCAGGAGCAAGCCCACTGTGG
2100 . : . : . : . : . :
1991 ATATAG TTAACCAGGCTGGAGAAACTGCCCTAGACATAGCA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
385059 ATATAGGTA...CAGTTAACCAGGCTGGAGAAACTGCCCTAGACATAGCA
2150 . : . : . : . : . :
2032 AAGAGACTAAAAGCTACCCAGTGTGAAGATCTG CTTTCCCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
385234 AAGAGACTAAAAGCTACCCAGTGTGAAGATCTGGTA...CAGCTTTCCCA
2200 . : . : . : . : . :
2073 GGCTAAATCTGGAAAGTTCAATCCACACGTCCACGTAGAATATGAGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
386217 GGCTAAATCTGGAAAGTTCAATCCACACGTCCACGTAGAATATGAGTGGA
2250 . : . : . : . : . :
2123 ATCTTCGACAGGAGGAGATAGATGAGAGCGATGATGATCTGGATGACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
386267 ATCTTCGACAGGAGGAGATAGATGAGAGCGATGATGATCTGGATGACAAA
2300 . : . : . : . : . :
2173 CCAAGCCCTATCAAGAAAGAGCGCTCACCCAGACCTCAGAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
386317 GTG...CAGCCAAGCCCTATCAAGAAAGAGCGCTCACCCAGACCTCAGAG
2350 . : . : . : . : . :
2214 CTTCTGCCACTCCTCCAGCATCTCCCCCCAGGACAAGCTGGCACTGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389663 CTTCTGCCACTCCTCCAGCATCTCCCCCCAGGACAAGCTGGCACTGCCAG
2400 . : . : . : . : . :
2264 GATTCAGCACTCCAAGGGACAAACAGCGGCTCTCCTATGGAGCCTTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389713 GATTCAGCACTCCAAGGGACAAACAGCGGCTCTCCTATGGAGCCTTCACC
2450 . : . : . : . : . :
2314 AACCAGATCTTCGTTTCCACAAGCACAGACTCGCCCACATCACCAACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389763 AACCAGATCTTCGTTTCCACAAGCACAGACTCGCCCACATCACCAACCAC
2500 . : . : . : . : . :
2364 GGAGGCTCCCCCTCTGCCTCCTAGGAACGCCGGGAAAG GTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
389813 GGAGGCTCCCCCTCTGCCTCCTAGGAACGCCGGGAAAGGTA...TAGGTC
2550 . : . : . : . : . :
2405 CAACTGGCCCACCTTCAACACTCCCTCTAAGCACCCAGACCTCTAGTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409804 CAACTGGCCCACCTTCAACACTCCCTCTAAGCACCCAGACCTCTAGTGGC
2600 . : . : . : . : . :
2455 AGCTCCACCCTATCCAAGAAGAGGCCTCCTCCCCCACCACCCGGACACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409854 AGCTCCACCCTATCCAAGAAGAGGCCTCCTCCCCCACCACCCGGACACAA
2650 . : . : . : . : . :
2505 GAGAACCCTATCCGACCCTCCCAGCCCACTACCTCATGGGCCCCCAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409904 GAGAACCCTATCCGACCCTCCCAGCCCACTACCTCATGGGCCCCCAAACA
2700 . : . : . : . : . :
2555 AAGGCGCAGTTCCTTGGG GTAACGATGGGGGTCCATCCTCT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
409954 AAGGCGCAGTTCCTTGGGGTA...TAGGTAACGATGGGGGTCCATCCTCT
2750 . : . : . : . : . :
2596 TCAAGTAAGACTACAAACAAGTTTGAGGGACTATCCCAGCAGTCGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
421996 TCAAGTAAGACTACAAACAAGTTTGAGGGACTATCCCAGCAGTCGAGGTA
2800 . : . : . : . : . :
2643 CACCAGTTCTGCAAAGACTGCCCTTGGCCCAAGAGTTCTTCCTA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
422046 ...TAGCACCAGTTCTGCAAAGACTGCCCTTGGCCCAAGAGTTCTTCCTA
2850 . : . : . : . : . :
2687 AACTACCTCAGAAAG TGGCACTAAGGAAAACAGATCATCTC
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
425582 AACTACCTCAGAAAGGTA...CAGTGGCACTAAGGAAAACAGATCATCTC
2900 . : . : . : . : . :
2728 TCCCTAGACAAAGCCACCATCCCGCCCGAAATCTTTCAGAAATCATCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
440901 TCCCTAGACAAAGCCACCATCCCGCCCGAAATCTTTCAGAAATCATCACA
2950 . : . : . : . : . :
2778 GTTGGCAGAGTTGCCACAAAAGCCACCACCTGGAGACCTGCCCCCAAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
440951 GTTGGCAGAGTTGCCACAAAAGCCACCACCTGGAGACCTGCCCCCAAAGC
3000 . : . : . : . : . :
2828 CCACAGAACTGGCCCCCAAGCCCCAAATTGGAGATTTGCCGCCTAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441001 CCACAGAACTGGCCCCCAAGCCCCAAATTGGAGATTTGCCGCCTAAGCCA
3050 . : . : . : . : . :
2878 GGAGAACTGCCCCCCAAACCACAGCTGGGGGACCTGCCACCCAAACCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441051 GGAGAACTGCCCCCCAAACCACAGCTGGGGGACCTGCCACCCAAACCCCA
3100 . : . : . : . : . :
2928 ACTCTCAGACTTACCTCCCAAACCACAGATGAAGGACCTGCCCCCCAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441101 ACTCTCAGACTTACCTCCCAAACCACAGATGAAGGACCTGCCCCCCAAAC
3150 . : . : . : . : . :
2978 CACAGCTGGGAGACCTGCTAGCAAAATCCCAGACTGGAGATGTCTCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441151 CACAGCTGGGAGACCTGCTAGCAAAATCCCAGACTGGAGATGTCTCACCC
3200 . : . : . : . : . :
3028 AAGGCTCAGCAACCCTCTGAGGTCACACTGAAGTCACACCCATTGGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441201 AAGGCTCAGCAACCCTCTGAGGTCACACTGAAGTCACACCCATTGGATCT
3250 . : . : . : . : . :
3078 ATCCCCAAATGTGCAGTCCAGAGACGCCATCCAAAAGCAAGCATCTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441251 ATCCCCAAATGTGCAGTCCAGAGACGCCATCCAAAAGCAAGCATCTGAAG
3300 . : . : . : . : . :
3128 ACTCCAACGACCTCACGCCTACTCTGCCAGAGACGCCCGTACCACTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441301 ACTCCAACGACCTCACGCCTACTCTGCCAGAGACGCCCGTACCACTGCCC
3350 . : . : . : . : . :
3178 AGAAAAATCAATACG GGGAAAAATAAAGTGAGGCGAGTGAA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
441351 AGAAAAATCAATACGGTG...AAGGGGAAAAATAAAGTGAGGCGAGTGAA
3400 . : . : . : . : . :
3219 GACCATTTATGACTGCCAGGCAGACAACGATGACGAGCTCACATTCATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
443894 GACCATTTATGACTGCCAGGCAGACAACGATGACGAGCTCACATTCATCG
3450 . : . : . : . : . :
3269 AGGGAGAAGTGATTATCGTCACAGGGGAAGAGGACCAGGAGTGGTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
443944 AGGGAGAAGTGATTATCGTCACAGGGGAAGAGGACCAGGAGTGGTGGGTA
3500 . : . : . : . : . :
3316 ATTGGCCACATCGAAGGACAGCCTGAAAGGAAGGGGGTCTTTCC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
443994 ...CAGATTGGCCACATCGAAGGACAGCCTGAAAGGAAGGGGGTCTTTCC
3550 . : . : .
3360 AGTGTCCTTTGTTCATATCCTGTCTGAC
||||||||||||||||||||||||||||
447183 AGTGTCCTTTGTTCATATCCTGTCTGAC