seq1 = pF1KE4261.tfa, 3171 bp
seq2 = pF1KE4261/gi568815588r_67822934.tfa (gi568815588r:67822934_68173108), 350175 bp

>pF1KE4261 3171
>gi568815588r:67822934_68173108 (Chr10)

(complement)

1-226  (100001-100226)   100% ->
227-386  (128546-128705)   100% ->
387-463  (134940-135016)   100% ->
464-685  (138923-139144)   100% ->
686-777  (140240-140331)   100% ->
778-908  (147433-147563)   100% ->
909-1069  (158923-159083)   99% ->
1070-1146  (180427-180503)   100% ->
1147-1271  (180786-180910)   100% ->
1272-1331  (181910-181969)   100% ->
1332-1443  (182094-182205)   100% ->
1444-1633  (182709-182898)   100% ->
1634-1806  (184274-184446)   100% ->
1807-1926  (206307-206426)   100% ->
1927-1950  (213973-213996)   100% ->
1951-2049  (216133-216231)   100% ->
2050-2217  (217979-218146)   100% ->
2218-2361  (218371-218514)   100% ->
2362-2528  (232004-232170)   100% ->
2529-2595  (233455-233521)   100% ->
2596-2678  (236874-236956)   100% ->
2679-2862  (240329-240512)   100% ->
2863-2965  (247922-248024)   100% ->
2966-3171  (249970-250175)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGTGCTGGGGAAATGCATCCTTTGGGCAGCTAGGTTTGGGTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGTGCTGGGGAAATGCATCCTTTGGGCAGCTAGGTTTGGGTGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATGAAGAAATTGTACTAGAGCCCAGAAAAAGTGACTTCTTTATAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATGAAGAAATTGTACTAGAGCCCAGAAAAAGTGACTTCTTTATAAATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAGGGTCCGAGATGTAGGATGTGGACTCAGACATACTGTGTTTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAGGGTCCGAGATGTAGGATGTGGACTCAGACATACTGTGTTTGTTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGATGGAACAGTGTACACATGTGGATGTAATGATCTAGGACAGCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGATGGAACAGTGTACACATGTGGATGTAATGATCTAGGACAGCTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCATGAAAAATCCAGAAAGAAACCAG         AGCAGGTTGTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100201 TCATGAAAAATCCAGAAAGAAACCAGGTA...TAGAGCAGGTTGTTGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGATGCCCAAAATATTGTAGCTGTTTCATGTGGAGAAGCTCATACGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128561 TGGATGCCCAAAATATTGTAGCTGTTTCATGTGGAGAAGCTCATACGTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCGCTAAATGACAAAGGCCAGGTGTATGCTTGGGGTCTCGATTCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128611 GCGCTAAATGACAAAGGCCAGGTGTATGCTTGGGGTCTCGATTCTGATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACAGCTTGGCCTGGTAGGATCAGAGGAATGCATCAGAGTACCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 128661 ACAGCTTGGCCTGGTAGGATCAGAGGAATGCATCAGAGTACCCAGGTA..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387     AAATATTAAAAGTTTGTCAGATATCCAGATTGTACAGGTTGCTTGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128711 .TAGAAATATTAAAAGTTTGTCAGATATCCAGATTGTACAGGTTGCTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGTTACTATCATTCACTTGCACTTTCTAAAG         CAAGTGAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 134986 GGTTACTATCATTCACTTGCACTTTCTAAAGGTA...CAGCAAGTGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCTGTTGGGGACAGAATAAATATGGCCAATTGGGTTTAGGTACTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138933 CTTCTGTTGGGGACAGAATAAATATGGCCAATTGGGTTTAGGTACTGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTAAAAAGCAAACTTCACCGCAGCTGCTTAAGTCTTTGCTTGGAATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138983 GTAAAAAGCAAACTTCACCGCAGCTGCTTAAGTCTTTGCTTGGAATCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCATGCAAGTTGCAGCAGGAGGAGCCCATAGTTTTGTACTCACCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139033 TTCATGCAAGTTGCAGCAGGAGGAGCCCATAGTTTTGTACTCACCCTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGAGCTATCTTTGGATGGGGACGCAACAAGTTTGGTCAGCTAGGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139083 TGGAGCTATCTTTGGATGGGGACGCAACAAGTTTGGTCAGCTAGGTCTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGATGAAAATG         ATAGGTATGTTCCTAATTTACTAAAGTCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 139133 ATGATGAAAATGGTA...CAGATAGGTATGTTCCTAATTTACTAAAGTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTAAGATCTCAGAAAATAGTTTATATTTGTTGTGGAGAAGATCATACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140269 CTAAGATCTCAGAAAATAGTTTATATTTGTTGTGGAGAAGATCATACTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGCTCTAACCAAG         GAAGGTGGAGTGTTTACTTTTGGAGCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 140319 TGCTCTAACCAAGGTA...TAGGAAGGTGGAGTGTTTACTTTTGGAGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAGGGTATGGTCAGTTGGGCCATAATTCTACCAGTCATGAAATAAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147461 GAGGGTATGGTCAGTTGGGCCATAATTCTACCAGTCATGAAATAAACCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGGAAAGTTTTTGAACTTATGGGAAGCATTGTCACTGAGATTGCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147511 AGGAAAGTTTTTGAACTTATGGGAAGCATTGTCACTGAGATTGCTTGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACG         GCAGCACACTTCTGCTTTTGTTCCTTCATCAGGACGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147561 ACGGTA...TAGGCAGCACACTTCTGCTTTTGTTCCTTCATCAGGACGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTTACTCTTTTGGGCTTGGTGGTAATGGGCAGCTGGGAACCGGTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158961 TTTACTCTTTTGGGCTTGGTGGTAATGGGCAGCTGGGAACCGGTTCAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGCAACAGGAAAAGTCCCTTTACTGTAAAAGGAAATTGGTACCCCTATAA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159011 AGCAACAGGAAAAGCCCCTTTACTGTAAAAGGAAATTGGTACCCCTATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGGGCAGTGTCTACCAGATATTG         ATTCTGAAGAATATTTCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 159061 TGGGCAGTGTCTACCAGATATTGGTA...CAGATTCTGAAGAATATTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTGTAAAAAGAATTTTCTCAGGGGGAGATCAAAGCTTTTCACATTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180445 GTGTAAAAAGAATTTTCTCAGGGGGAGATCAAAGCTTTTCACATTACTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGTCCCCAG         AACTGTGGGCCACCAGATGACTTCAGATGTCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 180495 AGTCCCCAGGTA...TAGAACTGTGGGCCACCAGATGACTTCAGATGTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CAATCCGACAAAGCAGATCTGGACAGTGAATGAAGCTCTAATTCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180818 CAATCCGACAAAGCAGATCTGGACAGTGAATGAAGCTCTAATTCAGAAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGCTGAGCTATCCTTCTGGAAGGTTTCCTGTGGAGATAGCCAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 180868 GGCTGAGCTATCCTTCTGGAAGGTTTCCTGTGGAGATAGCCAAGTA...T

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1272   TGAGATAGATGGAACGTTTTCTTCCTCTGGTTGCCTAAATGGAAGTTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181908 AGTGAGATAGATGGAACGTTTTCTTCCTCTGGTTGCCTAAATGGAAGTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TTTAGCTGTTAG         CAATGATGATCACTATAGAACAGGTACCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 181958 TTTAGCTGTTAGGTA...TAGCAATGATGATCACTATAGAACAGGTACCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GATTTTCAGGGGTTGATATGAATGCTGCTAGGCTTTTATTCCACAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182123 GATTTTCAGGGGTTGATATGAATGCTGCTAGGCTTTTATTCCACAAACTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ATACAACCTGATCATCCGCAGATATCTCAGCAG         GTGGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 182173 ATACAACCTGATCATCCGCAGATATCTCAGCAGGTC...TAGGTGGCAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TAGTTTGGAAAAGAATCTTATTCCTAAACTGACTAGCTCCTTACCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182717 TAGTTTGGAAAAGAATCTTATTCCTAAACTGACTAGCTCCTTACCTGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TTGAAGCATTGAGGTTTTATCTTACTCTACCAGAATGTCCCCTGATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182767 TTGAAGCATTGAGGTTTTATCTTACTCTACCAGAATGTCCCCTGATGAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GATTCCAACAATTTCACAACAATAGCAATTCCCTTTGGTACAGCTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182817 GATTCCAACAATTTCACAACAATAGCAATTCCCTTTGGTACAGCTCTTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAACCTAGAAAAGGCACCACTGAAAGTACTTG         AAAACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 182867 GAACCTAGAAAAGGCACCACTGAAAGTACTTGGTA...CAGAAAACTGGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GGTCAGTACTTGAACCTCCACTATTCCTCAAGATAGTAGAACTTTTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184283 GGTCAGTACTTGAACCTCCACTATTCCTCAAGATAGTAGAACTTTTTAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAAGTTGTGGTACATCTTTTGAAACTCTACAAGATCGGTATTCCCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184333 GAAGTTGTGGTACATCTTTTGAAACTCTACAAGATCGGTATTCCCCCTTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGAAAGAAGAATTTTCAACAGTTTTCTTCATACTGCATTAAAGGTTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184383 TGAAAGAAGAATTTTCAACAGTTTTCTTCATACTGCATTAAAGGTTTTAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AAATACTACATAGG         GTAAATGAGAAAATGGGACAGATTATA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 184433 AAATACTACATAGGGTA...TAGGTAAATGAGAAAATGGGACAGATTATA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CAGTATGATAAATTTTATATACATGAAGTACAAGAATTGATAGACATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206334 CAGTATGATAAATTTTATATACATGAAGTACAAGAATTGATAGACATAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AAATGATTATATCAACTGGGTCCAACAGCAGGCCTATGGAATG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 206384 AAATGATTATATCAACTGGGTCCAACAGCAGGCCTATGGAATGGTA...T

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1927   GATGTCAACCATGGATTAACTGAG         TTGGCAGATATCCCT
        >>||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 213971 AGGATGTCAACCATGGATTAACTGAGGTA...CAGTTGGCAGATATCCCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GTTACAATCTGTACATATCCATTTGTATTTGATGCCCAAGCAAAAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216148 GTTACAATCTGTACATATCCATTTGTATTTGATGCCCAAGCAAAAACTAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TCTGTTACAGACCGATGCAGTCTTACAGATGCAG         ATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 216198 TCTGTTACAGACCGATGCAGTCTTACAGATGCAGGTA...CAGATGGCTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TTGATCAGGCCCACAGGCAGAATGTCTCCTCTCTTTTTCTCCCAGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217986 TTGATCAGGCCCACAGGCAGAATGTCTCCTCTCTTTTTCTCCCAGTGATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GAATCTGTGAATCCCTGCTTAATTCTAGTGGTGCGTAGAGAAAATATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218036 GAATCTGTGAATCCCTGCTTAATTCTAGTGGTGCGTAGAGAAAATATTGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 AGGAGATGCAATGGAAGTCCTTAGGAAAACAAAGAACATAGATTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218086 AGGAGATGCAATGGAAGTCCTTAGGAAAACAAAGAACATAGATTACAAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AGCCACTCAAG         GTTATATTTGTTGGAGAAGATGCTGTGGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 218136 AGCCACTCAAGGTA...TAGGTTATATTTGTTGGAGAAGATGCTGTGGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GCAGGAGGGGTGCGCAAAGAATTTTTCTTGCTCATCATGAGGGAATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218401 GCAGGAGGGGTGCGCAAAGAATTTTTCTTGCTCATCATGAGGGAATTATT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GGATCCTAAATACGGCATGTTTAGGTATTATGAAGATTCCAGGCTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218451 GGATCCTAAATACGGCATGTTTAGGTATTATGAAGATTCCAGGCTCATTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GGTTTTCTGATAAG         ACATTTGAAGACAGTGATTTGTTCCAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 218501 GGTTTTCTGATAAGGTA...TAGACATTTGAAGACAGTGATTTGTTCCAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TTGATTGGTGTTATCTGTGGCTTAGCAATTTATAATTGTACCATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232031 TTGATTGGTGTTATCTGTGGCTTAGCAATTTATAATTGTACCATTGTGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CCTCCATTTTCCTTTGGCTTTATATAAGAAACTACTGAAAAAGAAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232081 CCTCCATTTTCCTTTGGCTTTATATAAGAAACTACTGAAAAAGAAGCCAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 CCTTGGATGATTTGAAAGAACTAATGCCTGATGTTGGGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 232131 CCTTGGATGATTTGAAAGAACTAATGCCTGATGTTGGGAGGTT...CAGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 AGCATGCAACAGTTACTGGATTATCCAGAAGATGACATAGAGGAAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233456 AGCATGCAACAGTTACTGGATTATCCAGAAGATGACATAGAGGAAACATT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 TTGTCTTAATTTTACG         ATCACAGTTGAAAACTTTGGTGCAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 233506 TTGTCTTAATTTTACGGTA...TAGATCACAGTTGAAAACTTTGGTGCAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 CAGAAGTGAAAGAGCTGGTTCTAAATGGTGCAGACACAGCTGTTAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236899 CAGAAGTGAAAGAGCTGGTTCTAAATGGTGCAGACACAGCTGTTAACAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 CAAAATCG         GCAAGAGTTTGTCGATGCTTATGTGGATTACAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 236949 CAAAATCGGTA...TAGGCAAGAGTTTGTCGATGCTTATGTGGATTACAT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 ATTCAATAAATCAGTGGCTTCCTTATTTGATGCTTTTCATGCGGGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240362 ATTCAATAAATCAGTGGCTTCCTTATTTGATGCTTTTCATGCGGGCTTTC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 ATAAGGTCTGTGGAGGAAAAGTCCTTCTGCTCTTTCAGCCTAATGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240412 ATAAGGTCTGTGGAGGAAAAGTCCTTCTGCTCTTTCAGCCTAATGAACTA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 CAAGCAATGGTCATTGGAAATACAAATTATGATTGGAAGGAACTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240462 CAAGCAATGGTCATTGGAAATACAAATTATGATTGGAAGGAACTGGAAAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 G         AATACAGAATACAAAGGGGAATATTGGGCAGAACATCCTA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240512 GGTA...TAGAATACAGAATACAAAGGGGAATATTGGGCAGAACATCCTA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 CGATAAAAATTTTTTGGGAAGTATTTCACGAATTACCATTGGAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247962 CGATAAAAATTTTTTGGGAAGTATTTCACGAATTACCATTGGAAAAGAAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 AAACAGTTTCTGT         TATTTTTGACAGGTAGTGATCGCATTCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 248012 AAACAGTTTCTGTGTA...CAGTATTTTTGACAGGTAGTGATCGCATTCC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 TATTCTTGGTATGAAGAGTCTGAAACTAGTCATCCAGTCCACAGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249998 TATTCTTGGTATGAAGAGTCTGAAACTAGTCATCCAGTCCACAGGAGGTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 GTGAGGAGTATCTCCCAGTTTCCCATACTTGTTTTAATCTTCTGGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250048 GTGAGGAGTATCTCCCAGTTTCCCATACTTGTTTTAATCTTCTGGATCTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 CCAAAATATACAGAAAAAGAAACTCTACGCTCTAAACTGATCCAAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250098 CCAAAATATACAGAAAAAGAAACTCTACGCTCTAAACTGATCCAAGCTAT

   3350     .    :    .    :    .
   3144 TGATCACAATGAAGGCTTCAGTTTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 250148 TGATCACAATGAAGGCTTCAGTTTAATA