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seq2 = pF1KE4254/gi568815589r_123281435.tfa (gi568815589r:123281435_123979021), 697587 bp

>pF1KE4254 3027
>gi568815589r:123281435_123979021 (Chr9)

(complement)

75-132  (186376-186435)   91% ->
133-182  (209459-209508)   100% ->
183-302  (221200-221319)   100% ->
303-372  (302233-302302)   100% ->
373-453  (307651-307731)   100% ->
454-507  (311943-311996)   100% ->
508-618  (326899-327009)   100% ->
619-719  (348546-348646)   100% ->
720-765  (369541-369586)   100% ->
766-867  (395752-395853)   99% ->
868-993  (421327-421452)   100% ->
994-1098  (521125-521229)   100% ->
1099-1186  (521587-521674)   100% ->
1187-1227  (524243-524283)   100% ->
1228-1299  (526675-526746)   100% ->
1300-1356  (528273-528329)   100% ->
1357-1488  (538531-538662)   100% ->
1489-1577  (575532-575620)   100% ->
1578-1836  (595109-595367)   100% ->
1837-3027  (596397-597587)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     75 TGGC ACTCTTT CAGATCCTGAGGTGCAGAGGCAATTCCCGGAGGACTA
        || |-| | |||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186376 TGTCAATTATTTACAGATCCTGAGGTGCAGAGGCAATTCCCGGAGGACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    123 CAGTGACCAG         GAAGTTCTACAGACTTTGACCAAGTTTTGTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 186426 CAGTGACCAGGTT...CAGGAAGTTCTACAGACTTTGACCAAGTTTTGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    164 TCCCCTTCTATGTGGACAG         CCTCACAGTTAGCCAAGTTGGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 209490 TCCCCTTCTATGTGGACAGGTA...CAGCCTCACAGTTAGCCAAGTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    205 CAGAACTTCACATTCGTGCTCACTGACATTGACAGCAAACAGAGATTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221222 CAGAACTTCACATTCGTGCTCACTGACATTGACAGCAAACAGAGATTCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    255 GTTCTGCCGCTTATCTTCAGGAGCGAAGAGCTGCTTCTGTATCTTAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 221272 GTTCTGCCGCTTATCTTCAGGAGCGAAGAGCTGCTTCTGTATCTTAAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    303        CTATCTCCCCTGGTTCGAGGTATTTTATAAGCTGCTTAACATC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221322 A...CAGCTATCTCCCCTGGTTCGAGGTATTTTATAAGCTGCTTAACATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    346 CTGGCAGATTACACGACAAAAAGACAG         GAAAATCAGTGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 302276 CTGGCAGATTACACGACAAAAAGACAGGTA...CAGGAAAATCAGTGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387 TGAGCTTCTTGAAACTCTGCACAAACTTCCCATCCCTGACCCAGGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307665 TGAGCTTCTTGAAACTCTGCACAAACTTCCCATCCCTGACCCAGGAGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    437 CTGTCCATCTCAGCGTG         CATTCTTATTTTACTGTGCCTGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 307715 CTGTCCATCTCAGCGTGGTA...TAGCATTCTTATTTTACTGTGCCTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478 ACCAGAGAACTTCCCAGCATACCTGAGAAT         AGAAATCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 311967 ACCAGAGAACTTCCCAGCATACCTGAGAATGTA...TAGAGAAATCTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    519 AGAATATTTTGTGGCTGTGGATGTTAACAACATGTTGCATCTGTACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 326910 AGAATATTTTGTGGCTGTGGATGTTAACAACATGTTGCATCTGTACGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    569 GTATGCTGTACGAACGCCGGATACTCATCATTTGCAGCAAACTCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 326960 GTATGCTGTACGAACGCCGGATACTCATCATTTGCAGCAAACTCAGCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    619          CTGACTGCCTGCATCCACGGGTCTGCGGCGATGCTCTACCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327010 GTG...CAGCTGACTGCCTGCATCCACGGGTCTGCGGCGATGCTCTACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    660 CATGTACTGGCAGCACGTGTACATCCCCGTGCTGCCGCCGCATCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348587 CATGTACTGGCAGCACGTGTACATCCCCGTGCTGCCGCCGCATCTGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    710 ACTACTGCTG         TGCTCCCATGCCCTACCTCATAGGAATCCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 348637 ACTACTGCTGGTA...CAGTGCTCCCATGCCCTACCTCATAGGAATCCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTAAGTTTAATGGAG         AAAGTCAGAAACATGGCCCTGGATGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 369572 TTAAGTTTAATGGAGGTA...CAGAAAGTCAGAAACATGGCCCTGGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGTCGTGATCCTGAATGTGGACACTAACACCCTGGAAACCCCCTTCGATG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 395778 TGTCGTGATCCTGAATGTGGACACCAACACCCTGGAAACCCCCTTCGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACCTCCAGAGCCTCCCAAACGACGTG         ATCTCTTCCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 395828 ACCTCCAGAGCCTCCCAAACGACGTGGTA...CAGATCTCTTCCCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AACAGGCTGAAAAAGGTCTCCACAACCACTGGGGATGGTGTGGCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 421342 AACAGGCTGAAAAAGGTCTCCACAACCACTGGGGATGGTGTGGCCAGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GTTCCTCAAGGCCCAGGCTGCTTTCTTCGGTAGCTACCGAAACGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 421392 GTTCCTCAAGGCCCAGGCTGCTTTCTTCGGTAGCTACCGAAACGCTCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AAATCGAGCCG         GAGGAGCCGATCACTTTCTGTGAGGAAGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 421442 AAATCGAGCCGGTG...CAGGAGGAGCCGATCACTTTCTGTGAGGAAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTCGTGTCCCACTACCGCTCCGGAGCCATGAGGCAGTTCCTGCAGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 521155 TTCGTGTCCCACTACCGCTCCGGAGCCATGAGGCAGTTCCTGCAGAACGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CACACAGCTGCAGCTCTTCAAGCAG         TTTATTGATGGTCGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 521205 CACACAGCTGCAGCTCTTCAAGCAGGTG...TAGTTTATTGATGGTCGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TAGATCTTCTCAATTCCGGCGAAGGTTTCAGTGATGTTTTTGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 521603 TAGATCTTCTCAATTCCGGCGAAGGTTTCAGTGATGTTTTTGAAGAGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 ATCAACATGGGCGAGTACGCTG         GCAGTGACAAACTGTACCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 521653 ATCAACATGGGCGAGTACGCTGGTG...CAGGCAGTGACAAACTGTACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCAGTGGCTCTCCACTGTCCGG         AAAGGAAGTGGAGCAATTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 524262 TCAGTGGCTCTCCACTGTCCGGGTA...TAGAAAGGAAGTGGAGCAATTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGAATACTGTAAAGACCAAAGCAAATCCGGCCATGAAGACTGTCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 526694 TGAATACTGTAAAGACCAAAGCAAATCCGGCCATGAAGACTGTCTACAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TTC         GCAAAAGATCATGCAAAAATGGGAATAAAAGAGGTGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 526744 TTCGTA...CAGGCAAAAGATCATGCAAAAATGGGAATAAAAGAGGTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AAACCGCTTGAAGCAAAAG         GACATTGCCGAGAATGGCTGCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 528311 AAACCGCTTGAAGCAAAAGGTA...CAGGACATTGCCGAGAATGGCTGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCCCCACCCCAGAAGAGCAGCTGCCAAAGACTGCACCGTCCCCACTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 538553 CCCCCACCCCAGAAGAGCAGCTGCCAAAGACTGCACCGTCCCCACTGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GAGGCCAAGGACCCCAAGCTCCGAGAAGACCGGCGGCCAATCACAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 538603 GAGGCCAAGGACCCCAAGCTCCGAGAAGACCGGCGGCCAATCACAGTCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CTTTGGACAG         GTGCGCCCACCTCGTCCACATGTTGTTAAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 538653 CTTTGGACAGGTG...TAGGTGCGCCCACCTCGTCCACATGTTGTTAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GACCAAAGAGCAACATCGCAGTGGAAGGCCGGAGGACGTCTGTGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 575563 GACCAAAGAGCAACATCGCAGTGGAAGGCCGGAGGACGTCTGTGCCGAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CCTGAGCA         GCCGCAGCCGTATCGGACACTCAGGGAGTCAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 575613 CCTGAGCAGTG...CAGGCCGCAGCCGTATCGGACACTCAGGGAGTCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CAGCGCGGAAGGCGACGAGGCAGAGAGTCCAGAGCAGCAAGTGCGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 595142 CAGCGCGGAAGGCGACGAGGCAGAGAGTCCAGAGCAGCAAGTGCGGAAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CCACAGGCCCTGTCCCAGCTCCCCCTGACCGGGCTGCCAGCATCGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 595192 CCACAGGCCCTGTCCCAGCTCCCCCTGACCGGGCTGCCAGCATCGACCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CTGGAAGACGTCTTCAGCAACCTGGACATGGAGGCCGCACTGCAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 595242 CTGGAAGACGTCTTCAGCAACCTGGACATGGAGGCCGCACTGCAGCCACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GGGCCAGGCCAAGAGCTTAGAGGACCTTCGTGCCCCCAAAGACCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 595292 GGGCCAGGCCAAGAGCTTAGAGGACCTTCGTGCCCCCAAAGACCTGAGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 AGCAGCCAGGGACCTTTGACTATCAG         AGGCTGGATCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 595342 AGCAGCCAGGGACCTTTGACTATCAGGTA...CAGAGGCTGGATCTGGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GGGAGTGAGAGGAGCCGCGGGGTGACAGTGGCCTTGAAGCTTACCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596412 GGGAGTGAGAGGAGCCGCGGGGTGACAGTGGCCTTGAAGCTTACCCACCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GTACAACAAGCTCTGGAGCCTGGGCCAGGACGACATGGCCATCCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596462 GTACAACAAGCTCTGGAGCCTGGGCCAGGACGACATGGCCATCCCCAGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 AGCCCCCAGCTGCCTCCCCTGAGAAGCCCTCGGCCCTGCTCGGGAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
 596512 AGCCCCCAGCTGCCTCCCCTGAGAAGCCCTCAGCCCTGCTCGGAAACTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CTGGCCCTGCCTCGAAGGCCCCAGAACCGGGACAGCATCCTGAACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596562 CTGGCCCTGCCTCGAAGGCCCCAGAACCGGGACAGCATCCTGAACCCCAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 TGACAAGGAGGAGGTGCCCACCCCTACTCTGGGCAGCATCACCATCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596612 TGACAAGGAGGAGGTGCCCACCCCTACTCTGGGCAGCATCACCATCCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 GGCCCCAAGGCAGGAAGACCCCAGAGCTGGGCATCGTGCCTCCACCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596662 GGCCCCAAGGCAGGAAGACCCCAGAGCTGGGCATCGTGCCTCCACCGCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 ATTCCCCGCCCGGCCAAGCTCCAGGCTGCCGGCGCCGCACTTGGTGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596712 ATTCCCCGCCCGGCCAAGCTCCAGGCTGCCGGCGCCGCACTTGGTGACGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 CTCAGAGCGGCTGCAGACGGATCGGGACAGGCGAGCTGCCCTGAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596762 CTCAGAGCGGCTGCAGACGGATCGGGACAGGCGAGCTGCCCTGAGTCCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 GGCTCCTGCCTGGTGTTGTCCCCCAAGGCCCCACTGAACTGCTCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596812 GGCTCCTGCCTGGTGTTGTCCCCCAAGGCCCCACTGAACTGCTCCAGCCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2302 CTCAGCCCTGGCCCCGGGGCTGCAGGCACGAGCAGTGACGCCCTGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596862 CTCAGCCCTGGCCCCGGGGCTGCAGGCACGAGCAGTGACGCCCTGCTCGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352 CCTCCTGGACCCGCTCAGCACAGCCTGGTCAGGCAGCACCCTCCCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596912 CCTCCTGGACCCGCTCAGCACAGCCTGGTCAGGCAGCACCCTCCCGTCAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 GCCCCGCCACCCCGAATGTAGCCACCCCATTCACCCCCCAATTCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 596962 GCCCCGCCACCCCGAATGTAGCCACCCCATTCACCCCCCAATTCAGCTTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 CCCCCTGCAGGGACACCCACCCCATTCCCACAGCCACCACTCAACCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597012 CCCCCTGCAGGGACACCCACCCCATTCCCACAGCCACCACTCAACCCCTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 TGTCCCATCCATGCCAGCAGCCCCACCCACCCTGCCCCTGGTCTCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597062 TGTCCCATCCATGCCAGCAGCCCCACCCACCCTGCCCCTGGTCTCCACAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 CAGCCGGGCCTTTCGGGGCCCCTCCAGCTTCCCTGGGGCCGGCTTTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597112 CAGCCGGGCCTTTCGGGGCCCCTCCAGCTTCCCTGGGGCCGGCTTTTGCG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 TCCGGCCTCCTGCTGTCCAGTGCTGGCTTCTGTGCCCCTCACAGGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597162 TCCGGCCTCCTGCTGTCCAGTGCTGGCTTCTGTGCCCCTCACAGGTCTCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 GCCCAACCTCTCCGCCCTCTCCATGCCCAACCTCTTTGGCCAGATGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597212 GCCCAACCTCTCCGCCCTCTCCATGCCCAACCTCTTTGGCCAGATGCCCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 TGGGCACCCACACGAGCCCCCTACAGCCGCTGGGTCCCCCAGCAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597262 TGGGCACCCACACGAGCCCCCTACAGCCGCTGGGTCCCCCAGCAGTTGCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 CCGTCGAGGATCCGAACGTTGCCCCTGGCCCGCTCAAGTGCCAGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597312 CCGTCGAGGATCCGAACGTTGCCCCTGGCCCGCTCAAGTGCCAGGGCTGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 TGAGACCAAGCAGGGGCTGGCCCTGAGGCCTGGAGACCCCCCGCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597362 TGAGACCAAGCAGGGGCTGGCCCTGAGGCCTGGAGACCCCCCGCTTCTGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2852 CTCCCAGGCCCCCTCAAGGCCTGGAGCCAACACTGCAGCCCTCTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597412 CTCCCAGGCCCCCTCAAGGCCTGGAGCCAACACTGCAGCCCTCTGCTCCT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2902 CAACAGGCCAGAGACCCCTTTGAGGATTTGTTACAGAAAACCAAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597462 CAACAGGCCAGAGACCCCTTTGAGGATTTGTTACAGAAAACCAAGCAAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2952 CGTGAGCCCGAGTCCGGCCCTGGCCCCGGCCCCAGACTCGGTGGAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597512 CGTGAGCCCGAGTCCGGCCCTGGCCCCGGCCCCAGACTCGGTGGAGCAGC

   3100     .    :    .    :    .
   3002 TCAGGAAGCAGTGGGAGACCTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||
 597562 TCAGGAAGCAGTGGGAGACCTTCGAG