seq1 = pF1KE4176.tfa, 1914 bp
seq2 = pF1KE4176/gi568815581r_75774486.tfa (gi568815581r:75774486_75978548), 204063 bp

>pF1KE4176 1914
>gi568815581r:75774486_75978548 (Chr17)

(complement)

1-675  (100001-100675)   99% ->
676-771  (101736-101831)   100% ->
772-1002  (102057-102287)   100% ->
1003-1201  (102450-102648)   100% ->
1202-1276  (103075-103149)   100% ->
1277-1914  (103426-104063)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGGCAGTGGACCCTTCAGCTGCCCCATCTGCCTAGAGCCACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGGCAGTGGACCCTTCAGCTGCCCCATCTGCCTAGAGCCACTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCCGGTGACGCTGCCCTGCGGCCACAACTTCTGTCTCGCCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCCGGTGACGCTGCCCTGCGGCCACAACTTCTGTCTCGCCTGCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCGCTCTGGCCGCATCGTGGCGCGAGTGGAGCCGGCGGACCCGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCGCTCTGGCCGCATCGTGGCGCGAGTGGAGCCGGCGGACCCGGAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGCCCGCTGCCCGCTGTGCCAGGAGCCCTTCCCCGACGGCCTTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGCCCGCTGCCCGCTGTGCCAGGAGCCCTTCCCCGACGGCCTTCAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCAAGAACCACACGCTGTCCGAGCTGCTGCAGCTCCGCCAGGGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCAAGAACCACACGCTGTCCGAGCTGCTGCAGCTCCGCCAGGGCTCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCCCGGGTCCGGCCCCGGCCCGGCCCCTGCCCTGGCCCCGGAGCCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCCCGGGTCCGGCCCCGGCCCGGCCCCTGCCCTGGCCCCGGAGCCCTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCACCCAGCGCGCTGCCCAGTGTCCCGGAGCCGTCGGCCCCCTGCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCACCCAGCGCGCTGCCCAGTGTCCCGGAGCCGTCGGCCCCCTGCGCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGAGCCGTGGCCCGCGGGCGAAGAGCCAGTGCGCTGCGACGCGTGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGAGCCGTGGCCCGCGGGCGAAGAGCCAGTGCGCTGCGACGCGTGCCCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGCGCGGCCCTGCCCGCCGCGCTGTCCTGCCTCTCCTGCCTCGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGGCGCGGCCCTGCCCGCCGCGCTGTCCTGCCTCTCCTGCCTCGCCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTTGCCCCGCGCACCTGGGCCCGCACGAGCGCAGCCCCGCGCTCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100451 TTTTGCCCCGCGCACCTGGGCCCGCACGAGCGCAGCCCCGCCCTCCGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACACCGCCTGGTGCCGCCGCTGCGCCGGCTAGAGGAGAGCCTGTGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACACCGCCTGGTGCCGCCGCTGCGCCGGCTAGAGGAGAGCCTGTGCCCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCACCTATGGCCGCTCGAGCGCTACTGCCGCGCGGAGCGCGTGTGTCTG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCACCTACGGCCGCTCGAGCGCTACTGCCGCGCGGAGCGCGTGTGTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGCGAGGCCTGCGCCGCCCAGGAGCACCGCGGCCACGAGCTGGTGCCGCT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGCGAGGCCTGCGCCGCACAGGAGCACCGCGGCCACGAGCTGGTGCCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGCAGGAGCGCGCGCTTCAGGAG         GCTGAGCAGTCCAAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100651 GGAGCAGGAGCGCGCGCTTCAGGAGGTG...CAGGCTGAGCAGTCCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCTGAGCGCCGTGGAGGACCGCATGGACGAGCTGGGTGCTGGCATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101752 TCCTGAGCGCCGTGGAGGACCGCATGGACGAGCTGGGTGCTGGCATTGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGTCCAGGCGCACAGTGGCCCTCATCAAG         AGTGCAGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101802 CAGTCCAGGCGCACAGTGGCCCTCATCAAGGTC...CAGAGTGCAGCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGCAGAGCGGGAGAGGGTGAGCCGGCTGTTTGCAGATGCTGCGGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102068 AGCAGAGCGGGAGAGGGTGAGCCGGCTGTTTGCAGATGCTGCGGCCGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGCAGGGCTTCCAGACCCAGGTGCTGGGCTTCATCGAGGAGGGGGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102118 TGCAGGGCTTCCAGACCCAGGTGCTGGGCTTCATCGAGGAGGGGGAAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCCATGCTAGGCCGCTCCCAGGGTGACCTGCGGCGACAGGAGGAACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102168 GCCATGCTAGGCCGCTCCCAGGGTGACCTGCGGCGACAGGAGGAACAGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CAGCCGCCTGAGCCGAGCCCGCCAGAATCTCAGCCAGGTCCCTGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102218 CAGCCGCCTGAGCCGAGCCCGCCAGAATCTCAGCCAGGTCCCTGAAGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACTCAGTCAGCTTCCTGCAG         GAGCTGCTGGCACTAAGGCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102268 ACTCAGTCAGCTTCCTGCAGGTG...CAGGAGCTGCTGGCACTAAGGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GCCCTGGAGGATGGGTGTGGCCCTGGGCCTGGACCCCCGAGGGAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102471 GCCCTGGAGGATGGGTGTGGCCCTGGGCCTGGACCCCCGAGGGAGCTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CTTCACCAAATCATCCCAAGCTGTCCGTGCAGTGAGAGACATGCTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102521 CTTCACCAAATCATCCCAAGCTGTCCGTGCAGTGAGAGACATGCTGGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGGCCTGCGTCAACCAGTGGGAGCAGCTGAGGGGGCCGGGTGGCAACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102571 TGGCCTGCGTCAACCAGTGGGAGCAGCTGAGGGGGCCGGGTGGCAACGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GATGGGCCACAGAAGCTGGACTCGGAAG         CTGATGCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102621 GATGGGCCACAGAAGCTGGACTCGGAAGGTG...CAGCTGATGCTGAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCAAGACCTCGAGAGTACGAACCTCTTGGAGAGTGAAGCTCCCAGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103088 CCAAGACCTCGAGAGTACGAACCTCTTGGAGAGTGAAGCTCCCAGGGACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ATTTCCTCAAGT         TTGCCTATATTGTGGATTTGGACAGCGAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103138 ATTTCCTCAAGTGTA...CAGTTGCCTATATTGTGGATTTGGACAGCGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACAGCAGACAAGTTCCTGCAGCTGTTTGGAACCAAAGGTGTCAAGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103455 ACAGCAGACAAGTTCCTGCAGCTGTTTGGAACCAAAGGTGTCAAGAGGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GCTGTGTCCTATCAACTACCCCTTGTCGCCCACCCGCTTCACCCATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103505 GCTGTGTCCTATCAACTACCCCTTGTCGCCCACCCGCTTCACCCATTGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGCAGGTGCTGGGCGAGGGTGCCCTGGACCGAGGCACCTACTACTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103555 AGCAGGTGCTGGGCGAGGGTGCCCTGGACCGAGGCACCTACTACTGGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GTGGAGATTATCGAGGGCTGGGTCAGCATGGGGGTCATGGCCGAAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103605 GTGGAGATTATCGAGGGCTGGGTCAGCATGGGGGTCATGGCCGAAGACTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTCCCCACAAGAGCCCTACGACCGCGGCCGGCTGGGCCGCAACGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103655 CTCCCCACAAGAGCCCTACGACCGCGGCCGGCTGGGCCGCAACGCCCACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CCTGCTGCCTGCAGTGGAATGGACGCAGCTTCTCCGTCTGGTTTCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103705 CCTGCTGCCTGCAGTGGAATGGACGCAGCTTCTCCGTCTGGTTTCATGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CTGGAGGCTCCCCTGCCCCACCCCTTCTCGCCCACGGTTGGGGTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103755 CTGGAGGCTCCCCTGCCCCACCCCTTCTCGCCCACGGTTGGGGTCTGCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GGAATACGCTGACCGTGCCTTGGCCTTCTATGCTGTACGGGACGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103805 GGAATACGCTGACCGTGCCTTGGCCTTCTATGCTGTACGGGACGGCAAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TGAGCCTCCTGCGGAGGCTGAAGGCCTCCCGGCCCCGCCGGGGTGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103855 TGAGCCTCCTGCGGAGGCTGAAGGCCTCCCGGCCCCGCCGGGGTGGCATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CCGGCCTCCCCCATTGACCCCTTCCAGAGCCGCCTGGACAGTCACTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103905 CCGGCCTCCCCCATTGACCCCTTCCAGAGCCGCCTGGACAGTCACTTTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GGGGCTCTTCACCCACAGACTCAAGCCTGCCTTCTTCCTGGAGAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103955 GGGGCTCTTCACCCACAGACTCAAGCCTGCCTTCTTCCTGGAGAGTGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 ACGCCCACTTGCAGATCGGGCCCCTCAAGAAGTCCTGCATATCCGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104005 ACGCCCACTTGCAGATCGGGCCCCTCAAGAAGTCCTGCATATCCGTGCTG

   1950     .
   1906 AAGAGGAGG
        |||||||||
 104055 AAGAGGAGG