seq1 = pF1KE4172.tfa, 1899 bp
seq2 = pF1KE4172/gi568815596r_186727987.tfa (gi568815596r:186727987_186949130), 221144 bp

>pF1KE4172 1899
>gi568815596r:186727987_186949130 (Chr2)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-242  (101336-101412)   100% ->
243-283  (104374-104414)   100% ->
284-494  (109962-110172)   100% ->
495-743  (111577-111825)   100% ->
744-828  (115101-115185)   100% ->
829-941  (115899-116011)   100% ->
942-1095  (119251-119404)   100% ->
1096-1899  (120341-121144)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCGCCGAGGCTATAAGGCCTCTGAAAGGCGAAGACACTTGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTCGCCGAGGCTATAAGGCCTCTGAAAGGCGAAGACACTTGAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGCTCAGCTGGCACCAAGACCAGGCGCTGAGTAGCAGCATCTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGCTCAGCTGGCACCAAGACCAGGCGCTGAGTAGCAGCATCTACCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACGAGAGATGGGCCCCACTGGCTTCCTGCTGAGGGAGGAGGAGCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACGAGAGATGGGCCCCACTGGCTTCCTGCTGAGGGAGGAGGAGCCGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACATGGATTTCCGA         GTTTTTCTAGGAAATCCTCACGTTTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACATGGATTTCCGAGTA...AAGGTTTTTCTAGGAAATCCTCACGTTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAACTGTTCCACATTTCCGAAAGGAGGGGAACTTTGTAAGCATATCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101362 TAACTGTTCCACATTTCCGAAAGGAGGGGAACTTTGTAAGCATATCTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 G         GGTCTTGTTGAAAAAATTCAAGCTTCCAAGGAACCATGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101412 GGTA...TAGGGTCTTGTTGAAAAAATTCAAGCTTCCAAGGAACCATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 T         CTGCTTTACAACTGGGTCTTGGAGAAAGAGAGATAAGTGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104414 TGTA...TAGCTGCTTTACAACTGGGTCTTGGAGAAAGAGAGATAAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTGCTTCGGGGGATACATCGAGTTCAAACTCCCCAACCAGGAACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110002 CTTGCTTCGGGGGATACATCGAGTTCAAACTCCCCAACCAGGAACAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGAAAATGAACATGTTGAAGAAGATGGGTACATTAAACAGAAGGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110052 ACGAAAATGAACATGTTGAAGAAGATGGGTACATTAAACAGAAGGAAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATTCAGAGGATATCTGCTCTATTTGTCAAGAGCTACTTTTAGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110102 GATTCAGAGGATATCTGCTCTATTTGTCAAGAGCTACTTTTAGAGAAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTTCCTGTCACCTTTTGCAG         GTTTGGCTGTGGCAATAGTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 110152 GCTTCCTGTCACCTTTTGCAGGTG...TAGGTTTGGCTGTGGCAATAGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTCATATAAAATGCATGAAGATCTTAGCTAATTATCAGAGTACATCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111597 TTCATATAAAATGCATGAAGATCTTAGCTAATTATCAGAGTACATCAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACTTCCATGTTGAAATGTCCTCTGTGCAGGAAAGAGTTTGCACCATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111647 ACTTCCATGTTGAAATGTCCTCTGTGCAGGAAAGAGTTTGCACCATTAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTGATTTTGGAGGAATTCAAAAACTCTAGCAAACTAGTAGCTGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111697 ACTGATTTTGGAGGAATTCAAAAACTCTAGCAAACTAGTAGCTGCAGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAAAGAGAGACTGGACAAACACCTTGGGATTCCCTGTAATAACTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111747 AAAAAGAGAGACTGGACAAACACCTTGGGATTCCCTGTAATAACTGCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAGTTTCCAATTGAGGGGAAGTGTTATAA         GTGTACCGAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 111797 CAGTTTCCAATTGAGGGGAAGTGTTATAAGTA...TAGGTGTACCGAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATAGAATATCACTTATGCCAGGAATGTTTTGATAGCTGCTGCCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115113 CATAGAATATCACTTATGCCAGGAATGTTTTGATAGCTGCTGCCATCTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCCACACGTTTACATTTCGTGAG         AAAAGAAACCAAAAATGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 115163 CCCACACGTTTACATTTCGTGAGGTA...CAGAAAAGAAACCAAAAATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGATCACTAGAAAAAAGAGCAGATGAAGTTGTAAAATACATAGATACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115917 AGATCACTAGAAAAAAGAGCAGATGAAGTTGTAAAATACATAGATACTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAATGAGATTGAAGAAAAGATGTCACATTTTCAAGAAAAGCAAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 115967 AAATGAGATTGAAGAAAAGATGTCACATTTTCAAGAAAAGCAAGGGTG..

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942     CCAAGTTTACACACCAAAACACATTGTAAGATCACTGCCTCTCCAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116017 .CAGCCAAGTTTACACACCAAAACACATTGTAAGATCACTGCCTCTCCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTGATTACTAAGAATAGTAAGCTGCTTGCTCCAGGCTACCAGTGTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119297 CTGATTACTAAGAATAGTAAGCTGCTTGCTCCAGGCTACCAGTGTCTACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTGTTTGAAGGCATTTCATCTTGGTCAACATACAAGATTGCTACCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119347 TTGTTTGAAGGCATTTCATCTTGGTCAACATACAAGATTGCTACCATGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTCACAAG         TTTCACAGGAAGTGTATTGACAACTGGTTATTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 119397 CTCACAAGGTA...AAGTTTCACAGGAAGTGTATTGACAACTGGTTATTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CACAAGTGCAATTCATGCCCTATTGATGGACAAGTTATATATAACCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120374 CACAAGTGCAATTCATGCCCTATTGATGGACAAGTTATATATAACCCTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AACTTGGAAAAATTCAGCAGTGAATGGACAAGCACATCAGTCTGTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120424 AACTTGGAAAAATTCAGCAGTGAATGGACAAGCACATCAGTCTGTTTCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACAGAGACATCATTCATCTATCAAAGCAGAAAGAACCAGATCTTTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120474 ACAGAGACATCATTCATCTATCAAAGCAGAAAGAACCAGATCTTTTTATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCTGGTACTGGATTAGTCTTAAAACAAAATAGACTTGGAATTTTACCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120524 CCTGGTACTGGATTAGTCTTAAAACAAAATAGACTTGGAATTTTACCTAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CATACCTCAGTGTAATTTTGATGAATTGAATACACCTCAAAGCCCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120574 CATACCTCAGTGTAATTTTGATGAATTGAATACACCTCAAAGCCCAAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATGCCTATGAAAATACAACAATAGATAATCTATGCTCTATCAAATTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120624 ATGCCTATGAAAATACAACAATAGATAATCTATGCTCTATCAAATTAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AATTCAAATTCAAAAAAATTAACCTATGATTATAAAATTAGCCAACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120674 AATTCAAATTCAAAAAAATTAACCTATGATTATAAAATTAGCCAACATTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TCCCAGGTATCTTCAAGATTTACCCACTGTGTCATTTGGGAAAATACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120724 TCCCAGGTATCTTCAAGATTTACCCACTGTGTCATTTGGGAAAATACCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CTCAAACACTGCTTCCTCCTATTGTTCATAAGAATATTGTGTGTCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120774 CTCAAACACTGCTTCCTCCTATTGTTCATAAGAATATTGTGTGTCCCACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GCAATGGAAAGTCCATGCATCAGTGGAAAATTTCACACTAGTCTAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120824 GCAATGGAAAGTCCATGCATCAGTGGAAAATTTCACACTAGTCTAAGCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GATGACCAAAGGCTGTAAATGTAATAACCACAACCTAAAGAAGACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120874 GATGACCAAAGGCTGTAAATGTAATAACCACAACCTAAAGAAGACTCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 CCACTAAAATAAGAGAGGACAACAAGAGATCAACTTTACTTCCAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120924 CCACTAAAATAAGAGAGGACAACAAGAGATCAACTTTACTTCCAGAGGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TTCAATCTTATTGTCAATTGGAGCACAGCTAAACTTAGTTTGTCTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120974 TTCAATCTTATTGTCAATTGGAGCACAGCTAAACTTAGTTTGTCTAAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GTATAGTAACTGTATGGGGGAAATTACACGAAAATGTAGTCATCTATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121024 GTATAGTAACTGTATGGGGGAAATTACACGAAAATGTAGTCATCTATCAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 GACAGCCTGTGTCTCACTCTGTAAATACAAAAAGTACTGAGCTATCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121074 GACAGCCTGTGTCTCACTCTGTAAATACAAAAAGTACTGAGCTATCTTTA

   1950     .    :    .    :
   1879 ATAATAGAAGGAGTTCAATTG
        |||||||||||||||||||||
 121124 ATAATAGAAGGAGTTCAATTG