seq1 = pF1KE4125.tfa, 1539 bp
seq2 = pF1KE4125/gi568815578r_50904042.tfa (gi568815578r:50904042_51110338), 206297 bp

>pF1KE4125 1539
>gi568815578r:50904042_51110338 (Chr20)

(complement)

1-774  (100001-100774)   100% ->
775-1539  (105533-106297)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCTCTTACCGGGAGACAATTCTGACTACGACTACAGCGCGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCTCTTACCGGGAGACAATTCTGACTACGACTACAGCGCGCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCACCTCGGACGCCTCCTTCCACCCGGCCTTCCTCCCGCAGCGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCACCTCGGACGCCTCCTTCCACCCGGCCTTCCTCCCGCAGCGCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATCAAGGGCGCGTTCTACCGCCGGGCGCAGCGGCTGCGGCCGCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATCAAGGGCGCGTTCTACCGCCGGGCGCAGCGGCTGCGGCCGCAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCCCGCCAGGGCTGTCAGCCCGAGGACCGCCGCCGTCGGATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCCCCGCCAGGGCTGTCAGCCCGAGGACCGCCGCCGTCGGATCATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACGTAGGCGGCATCAAGTACTCGCTGCCCTGGACCACGCTGGACGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACGTAGGCGGCATCAAGTACTCGCTGCCCTGGACCACGCTGGACGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCCGCTGACGCGCCTGGGCCAGCTCAAGGCCTGCACCAACTTCGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCCGCTGACGCGCCTGGGCCAGCTCAAGGCCTGCACCAACTTCGACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCCTCAACGTGTGCGATGACTACGACGTCACCTGCAACGAGTTCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCCTCAACGTGTGCGATGACTACGACGTCACCTGCAACGAGTTCTTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACCGCAACCCGGGGGCCTTCGGCACTATCCTGACCTTCCTGCGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGACCGCAACCCGGGGGCCTTCGGCACTATCCTGACCTTCCTGCGCGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAAGCTGCGGCTGCTGCGCGAGATGTGCGCGCTGTCCTTCCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAAGCTGCGGCTGCTGCGCGAGATGTGCGCGCTGTCCTTCCAGGAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGCTGTACTGGGGCATCGCGGAGGACCACCTGGACGGCTGCTGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGCTGTACTGGGGCATCGCGGAGGACCACCTGGACGGCTGCTGCAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGCTACCTGCAGAAGATTGAGGAGTTCGCGGAGATGGTGGAGCGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGCTACCTGCAGAAGATTGAGGAGTTCGCGGAGATGGTGGAGCGGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGGACGACGCGCTGGACAGCGAGGGCCGCGACAGCGAGGGCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGGACGACGCGCTGGACAGCGAGGGCCGCGACAGCGAGGGCCCGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGGCGAGGGCCGCCTGGGGCGCTGCATGCGGCGACTGCGCGACATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGGCGAGGGCCGCCTGGGGCGCTGCATGCGGCGACTGCGCGACATGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGAGGCCGCACTCGGGGCTGCCTGGCAAGGTGTTCGCCTGCCTGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGAGGCCGCACTCGGGGCTGCCTGGCAAGGTGTTCGCCTGCCTGTCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCTCTTCGTGACCGTCACCGCCGTCAACCTCTCCGTCAGCACCTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCTCTTCGTGACCGTCACCGCCGTCAACCTCTCCGTCAGCACCTTGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCCTGAGGGAGGAGGAGGAGCAG         GGCCACTGTTCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100751 AGCCTGAGGGAGGAGGAGGAGCAGGTA...CAGGGCCACTGTTCCCAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GTGCCACAACGTCTTCATCGTGGAGTCGGTGTGCGTGGGCTGGTTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105550 GTGCCACAACGTCTTCATCGTGGAGTCGGTGTGCGTGGGCTGGTTCTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGGAGTTCCTCCTGCGGCTCATTCAGGCGCCCAGCAAGTTCGCCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105600 TGGAGTTCCTCCTGCGGCTCATTCAGGCGCCCAGCAAGTTCGCCTTCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGGAGCCCGCTGACGCTGATCGACCTGGTGGCCATCCTGCCCTACTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105650 CGGAGCCCGCTGACGCTGATCGACCTGGTGGCCATCCTGCCCTACTACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CACGCTGCTGGTGGACGGCGCCGCCGCAGGCCGTCGCAAGCCCGGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105700 CACGCTGCTGGTGGACGGCGCCGCCGCAGGCCGTCGCAAGCCCGGCGCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCAACAGCTACCTGGACAAGGTGGGGCTGGTGCTGCGCGTGCTGCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105750 GCAACAGCTACCTGGACAAGGTGGGGCTGGTGCTGCGCGTGCTGCGGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CTGCGCATCCTGTACGTGATGCGCCTGGCGCGCCACTCCCTGGGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105800 CTGCGCATCCTGTACGTGATGCGCCTGGCGCGCCACTCCCTGGGGCTGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GACGCTGGGGCTCACGGCCCGCCGCTGCACCCGCGAGTTCGGGCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105850 GACGCTGGGGCTCACGGCCCGCCGCTGCACCCGCGAGTTCGGGCTCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGCTCTTCCTCTGCGTGGCCATCGCCCTCTTCGCGCCCCTGCTCTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105900 TGCTCTTCCTCTGCGTGGCCATCGCCCTCTTCGCGCCCCTGCTCTACGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATCGAGAACGAGATGGCCGACAGCCCCGAGTTCACCAGCATCCCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105950 ATCGAGAACGAGATGGCCGACAGCCCCGAGTTCACCAGCATCCCTGCCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CTACTGGTGGGCTGTCATCACCATGACGACGGTGGGCTATGGCGACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106000 CTACTGGTGGGCTGTCATCACCATGACGACGGTGGGCTATGGCGACATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TCCCCAGGAGCACCCCGGGCCAGGTAGTGGCCCTGAGCAGCATCCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106050 TCCCCAGGAGCACCCCGGGCCAGGTAGTGGCCCTGAGCAGCATCCTGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GGCATCCTGCTCATGGCCTTCCCAGTCACCTCCATCTTCCACACCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106100 GGCATCCTGCTCATGGCCTTCCCAGTCACCTCCATCTTCCACACCTTCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CCGCTCCTACCTGGAGCTCAAGCAGGAGCAAGAGAGGGTGATGTTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106150 CCGCTCCTACCTGGAGCTCAAGCAGGAGCAAGAGAGGGTGATGTTCCGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GGGCGCAGTTCCTCATCAAAACCAAGTCGCAGCTGAGCGTGTCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106200 GGGCGCAGTTCCTCATCAAAACCAAGTCGCAGCTGAGCGTGTCCCAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1492 AGTGACATCTTGTTCGGAAGTGCCTCCTCGGACACCAGAGACAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106250 AGTGACATCTTGTTCGGAAGTGCCTCCTCGGACACCAGAGACAATAAC