seq1 = pF1KE4124.tfa, 1536 bp
seq2 = pF1KE4124/gi568815591r_151076115.tfa (gi568815591r:151076115_151287265), 211151 bp

>pF1KE4124 1536
>gi568815591r:151076115_151287265 (Chr7)

(complement)

1-451  (100001-100451)   100% ->
452-719  (100607-100874)   100% ->
720-1239  (105808-106327)   100% ->
1240-1353  (110590-110703)   100% ->
1354-1536  (110969-111151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGGCCAGGTCAGCCTCGGAGCGTGGGACACAGGGGCCTTCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTGGCCAGGTCAGCCTCGGAGCGTGGGACACAGGGGCCTTCTGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCTGTATTTCCCTCCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTTTGGCATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCTGTATTTCCCTCCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTTTGGCATATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCTCCTCCTCCCCACTCCCCTTTCCCTGCCCACATGCTCATGAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCTCCTCCTCCCCACTCCCCTTTCCCTGCCCACATGCTCATGAGTTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTCCAGAAGAGTGCAAGGGGCAGGGAGAGCCCCTCGATGACAGACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTCCAGAAGAGTGCAAGGGGCAGGGAGAGCCCCTCGATGACAGACACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCTGTGCCAGGCTGGTGGAGAAGCCCAGCAGAGGGTCTGAGGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCTGTGCCAGGCTGGTGGAGAAGCCCAGCAGAGGGTCTGAGGAGCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAGTCTGGCCCGGGACCCATCGTCACCCGCACAGCCTCAGGACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAGTCTGGCCCGGGACCCATCGTCACCCGCACAGCCTCAGGACCTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTGCCTTCTGGCAGGCAGTGCTGGCTGGGGACGTGGGCTGTGTCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTGCCTTCTGGCAGGCAGTGCTGGCTGGGGACGTGGGCTGTGTCTCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCCTCGCGGACTCCAGTACTGGCCTGGCTCCTGATTCCGTCTTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCCTCGCGGACTCCAGTACTGGCCTGGCTCCTGATTCCGTCTTTGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAGCGACCCAGAGCGATGGAGGGATTTCCGCTTCAACATCCGTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAGCGACCCAGAGCGATGGAGGGATTTCCGCTTCAACATCCGTGCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 A         GACTCTGGTCTCTGACATACGAAGAGGAGCTGACCACCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGTA...TAGGACTCTGGTCTCTGACATACGAAGAGGAGCTGACCACCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACTGCATGTGGCAGCCAGCCGTGGCCACACGGAAGTCCTGCGGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100647 ACTGCATGTGGCAGCCAGCCGTGGCCACACGGAAGTCCTGCGGCTGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGAGGCGGCGAGCAAGGCCAGACAGTGCCCCTGGGGGCCGCACCGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100697 TGAGGCGGCGAGCAAGGCCAGACAGTGCCCCTGGGGGCCGCACCGCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CACGAGGCCTGTGCTGCAGGCCACACTGCCTGTGTTCATGTGCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100747 CACGAGGCCTGTGCTGCAGGCCACACTGCCTGTGTTCATGTGCTGCTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGCAGGAGCCGACCCCAACATCGCTGACCAGGATGGGAAACGCCCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100797 GGCAGGAGCCGACCCCAACATCGCTGACCAGGATGGGAAACGCCCCCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATCTCTGCCGGGGGCCTGGCACCCTTGA         GTGTGCGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100847 ATCTCTGCCGGGGGCCTGGCACCCTTGAGTG...TAGGTGTGCGGAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTCCTCAGGTTTGGAGCGAGAGTGGATGGTCGGTCCGAGGAAGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105821 CTCCTCAGGTTTGGAGCGAGAGTGGATGGTCGGTCCGAGGAAGAAGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GACCCCTTTGCATGTGGCCGCCCGGCTTGGCCATGTGGAGCTGGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105871 GACCCCTTTGCATGTGGCCGCCCGGCTTGGCCATGTGGAGCTGGCAGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGCTTCTAAGACGGGGGGCATGTCCTGATGCCCGCAATGCCGAAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105921 TGCTTCTAAGACGGGGGGCATGTCCTGATGCCCGCAATGCCGAAGGCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ACCCCACTGCTGGCTGCCTGTGACGTCCGCTGCCAGTCCATCACCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105971 ACCCCACTGCTGGCTGCCTGTGACGTCCGCTGCCAGTCCATCACCGATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CGAGGCCACCACCGCCCGCTGCCTGCAGCTGTGCAGCTTGCTGCTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106021 CGAGGCCACCACCGCCCGCTGCCTGCAGCTGTGCAGCTTGCTGCTTTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CTGGAGCAGACGCTGATGCTGCGGACCAGGACAAGCAGCGACCCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106071 CTGGAGCAGACGCTGATGCTGCGGACCAGGACAAGCAGCGACCCCTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTGGCCTGCCGCCGTGGCCATGCAGCTGTCGTGGAGCTGCTCCTGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106121 CTGGCCTGCCGCCGTGGCCATGCAGCTGTCGTGGAGCTGCTCCTGTCCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGGTGTCAGCGCCAACACCATGGACTATGGGGGACACACGCCCCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106171 TGGTGTCAGCGCCAACACCATGGACTATGGGGGACACACGCCCCTGCACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GTGCTCTGCAGGGCCCAGCTGCAGCCCTGGCCCAGAGCCCCGAGCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106221 GTGCTCTGCAGGGCCCAGCTGCAGCCCTGGCCCAGAGCCCCGAGCACGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GTTCGGGCTCTGCTCAACCATGGCGCCGTCCGTGTCTGGCCAGGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106271 GTTCGGGCTCTGCTCAACCATGGCGCCGTCCGTGTCTGGCCAGGGGCCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CCCCAAG         GTGCTGGAGCGCTGGAGCACGTGCCCTCGGACCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106321 CCCCAAGGTA...CAGGTGCTGGAGCGCTGGAGCACGTGCCCTCGGACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCGAGGTCCTGATGAACACCTACAGTGTTGTGCAGCTTCCCGAGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110624 TCGAGGTCCTGATGAACACCTACAGTGTTGTGCAGCTTCCCGAGGAGGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GTCGGCCTGGTGACTCCTGAAACTCTGCAG         AAACATCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110674 GTCGGCCTGGTGACTCCTGAAACTCTGCAGGTC...CAGAAACATCAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TTTCTACTCCTCCCTCTTCGCCTTGGTGAGGCAGCCCAGGTCGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110980 TTTCTACTCCTCCCTCTTCGCCTTGGTGAGGCAGCCCAGGTCGCTGCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ATTTGAGCCGCTGTGCGCTCCGCTCCCACCTGGAGGGCAGCCTGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111030 ATTTGAGCCGCTGTGCGCTCCGCTCCCACCTGGAGGGCAGCCTGCCCCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GCGCTGCCCCGCCTCCCCCTGCCACCGCGCCTGCTCCGCTACCTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111080 GCGCTGCCCCGCCTCCCCCTGCCACCGCGCCTGCTCCGCTACCTGCAGCT

   1550     .    :    .    :
   1515 GGATTTTGAGGGCGTGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||
 111130 GGATTTTGAGGGCGTGCTCTAC