seq1 = pF1KE4090.tfa, 1368 bp
seq2 = pF1KE4090/gi568815579r_48970066.tfa (gi568815579r:48970066_49172585), 202520 bp

>pF1KE4090 1368
>gi568815579r:48970066_49172585 (Chr19)

(complement)

1-555  (100001-100555)   100% ->
556-1368  (101708-102520)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCGCGGTGCCCGCCGCCGTGCGGCTGCTGCGAGCGGCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCGCGGTGCCCGCCGCCGTGCGGCTGCTGCGAGCGGCTGGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACGTGGCCGGGCTGCGCTTCGAGACGCGGGCGCGCACGCTGGGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACGTGGCCGGGCTGCGCTTCGAGACGCGGGCGCGCACGCTGGGCCGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCGGACACTCTGCTAGGGGACCCAGCGCGCCGCGGCCGCTTCTACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCGGACACTCTGCTAGGGGACCCAGCGCGCCGCGGCCGCTTCTACGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGCGCGCCGCGAGTATTTCTTCGACCGGCACCGGCCCAGCTTCGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGCGCGCCGCGAGTATTTCTTCGACCGGCACCGGCCCAGCTTCGACGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGCTCTACTACTACCAGTCCGGTGGGCGGCTGCGGCGGCCGGCGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGCTCTACTACTACCAGTCCGGTGGGCGGCTGCGGCGGCCGGCGCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCGCTCGACGTCTTCCTGGAAGAGGTGGCCTTCTACGGGCTGGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCGCTCGACGTCTTCCTGGAAGAGGTGGCCTTCTACGGGCTGGGCGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCCCTGGCACGCCTGCGCGAGGACGAGGGCTGCCCGGTGCCGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGCCCTGGCACGCCTGCGCGAGGACGAGGGCTGCCCGGTGCCGCCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGCCCCCTGCCCCGCCGCGCCTTCGCCCGCCAGCTGTGGCTGCTTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCCCCCTGCCCCGCCGCGCCTTCGCCCGCCAGCTGTGGCTGCTTTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTTTCCCGAGAGCTCTCAGGCCGCGCGCGTGCTCGCCGTAGTCTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTTTCCCGAGAGCTCTCAGGCCGCGCGCGTGCTCGCCGTAGTCTCCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTCATCCTCGTCTCCATCGTCGTCTTCTGCCTCGAGACGCTGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTCATCCTCGTCTCCATCGTCGTCTTCTGCCTCGAGACGCTGCCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCCGCGACGACCGCGACGGCACGGGGCTTGCTGCTGCAGCCGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCCGCGACGACCGCGACGGCACGGGGCTTGCTGCTGCAGCCGCAGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCCG         TTCCCCGCTCCGCTGAATGGCTCCAGCCAAATGCCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCCGGTG...CAGTTCCCCGCTCCGCTGAATGGCTCCAGCCAAATGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGAAATCCACCCCGCCTGCCCTTCAATGACCCGTTCTTCGTGGTGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101744 GGAAATCCACCCCGCCTGCCCTTCAATGACCCGTTCTTCGTGGTGGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGTGTATTTGTTGGTTCTCCTTTGAGCTGCTGGTACGCCTCCTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101794 GCTGTGTATTTGTTGGTTCTCCTTTGAGCTGCTGGTACGCCTCCTGGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GTCCAAGCAAGGCTATCTTCTTCAAGAACGTGATGAACCTCATCGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101844 GTCCAAGCAAGGCTATCTTCTTCAAGAACGTGATGAACCTCATCGATTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTGGCTATCCTTCCCTACTTTGTGGCACTGGGCACCGAGCTGGCCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101894 GTGGCTATCCTTCCCTACTTTGTGGCACTGGGCACCGAGCTGGCCCGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCGAGGGGTGGGCCAGCAGGCCATGTCACTGGCCATCCTGAGAGTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101944 GCGAGGGGTGGGCCAGCAGGCCATGTCACTGGCCATCCTGAGAGTCATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GATTGGTGCGTGTCTTCCGCATCTTCAAGCTGTCCCGGCACTCAAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101994 GATTGGTGCGTGTCTTCCGCATCTTCAAGCTGTCCCGGCACTCAAAGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTGCAAATCTTGGGCCAGACGCTTCGGGCCTCCATGCGTGAGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102044 CTGCAAATCTTGGGCCAGACGCTTCGGGCCTCCATGCGTGAGCTGGGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCTCATCTTTTTCCTCTTCATCGGTGTGGTCCTCTTTTCCAGCGCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102094 CCTCATCTTTTTCCTCTTCATCGGTGTGGTCCTCTTTTCCAGCGCCGTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACTTTGCCGAAGTTGACCGGGTGGACTCCCATTTCACTAGCATCCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102144 ACTTTGCCGAAGTTGACCGGGTGGACTCCCATTTCACTAGCATCCCTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TCCTTCTGGTGGGCGGTAGTCACCATGACTACAGTTGGCTATGGAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102194 TCCTTCTGGTGGGCGGTAGTCACCATGACTACAGTTGGCTATGGAGACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGCACCCGTCACTGTGGGTGGCAAGATAGTGGGCTCTCTGTGTGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102244 GGCACCCGTCACTGTGGGTGGCAAGATAGTGGGCTCTCTGTGTGCCATTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CGGGCGTGCTGACTATTTCCCTGCCAGTGCCCGTCATTGTCTCCAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102294 CGGGCGTGCTGACTATTTCCCTGCCAGTGCCCGTCATTGTCTCCAATTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AGCTACTTTTATCACCGGGAGACAGAGGGCGAAGAGGCTGGGATGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102344 AGCTACTTTTATCACCGGGAGACAGAGGGCGAAGAGGCTGGGATGTTCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CCATGTGGACATGCAGCCTTGTGGCCCACTGGAGGGCAAGGCCAATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102394 CCATGTGGACATGCAGCCTTGTGGCCCACTGGAGGGCAAGGCCAATGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GGCTGGTGGACGGGGAGGTACCTGAGCTACCACCTCCACTCTGGGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102444 GGCTGGTGGACGGGGAGGTACCTGAGCTACCACCTCCACTCTGGGCACCC

   1350     .    :    .    :    .
   1342 CCAGGGAAACACCTGGTCACCGAAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||
 102494 CCAGGGAAACACCTGGTCACCGAAGTG