seq1 = pF1KE4068.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KE4068/gi568815582r_1677100.tfa (gi568815582r:1677100_1881483), 204384 bp

>pF1KE4068 1065
>gi568815582r:1677100_1881483 (Chr16)

(complement)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-304  (102872-103049)   100% ->
305-492  (103163-103350)   100% ->
493-595  (103436-103538)   100% ->
596-721  (103612-103737)   99% ->
722-1065  (104041-104384)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGACGCCCCCGGAACAGCAGGGCCTGGCACTTCGTCCTGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGACGCCCCCGGAACAGCAGGGCCTGGCACTTCGTCCTGAGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCCGCCGAGACGCAGATGCCCGGGCCGTGGCTCTAGCAGGCTCCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCCGCCGAGACGCAGATGCCCGGGCCGTGGCTCTAGCAGGCTCCACTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGGGCTACGACTCTGATGGGCAG         CACAGCGACTCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 ACTGGGGCTACGACTCTGATGGGCAGGTA...CAGCACAGCGACTCGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCGACCCCGAGTACTCCACGCTGCCGCCATCCATCCCCAGTGCGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102887 TCCGACCCCGAGTACTCCACGCTGCCGCCATCCATCCCCAGTGCGGTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGACCGGCGAGTCCTTCTGTGACTGTGCTGGGCAGAGCGAGGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102937 CGTGACCGGCGAGTCCTTCTGTGACTGTGCTGGGCAGAGCGAGGCCTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTGTAGCAGCCTGCACTCGGCCCACCGGGGCAGGGACTGCCGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102987 TCTGTAGCAGCCTGCACTCGGCCCACCGGGGCAGGGACTGCCGCTGCGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGAAGACGAGT         ATTTCGACTGGGTCTGGGATGACTTAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103037 GAGGAAGACGAGTGTG...CAGATTTCGACTGGGTCTGGGATGACTTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAGTCATCAGCCACCCTGCTGAGCTGTGACAACCGTAAGGTCAGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103191 TAAGTCATCAGCCACCCTGCTGAGCTGTGACAACCGTAAGGTCAGCTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACATGGAGTACAGCTGCGGCACAGCGGCCATCCGGGGCACCAAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103241 ACATGGAGTACAGCTGCGGCACAGCGGCCATCCGGGGCACCAAGGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGGGAGGGCCAGCACTTCTGGGAGATCAAGATGACCTCTCCCGTCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103291 GGGGAGGGCCAGCACTTCTGGGAGATCAAGATGACCTCTCCCGTCTACGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCGACATG         ATGGTGGGCATCGGGACGTCGGATGTGGACC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103341 CACCGACATGGTA...TAGATGGTGGGCATCGGGACGTCGGATGTGGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGACAAATACCGCCACACGTTCTGCAGCCTGCTGGGCAGGGATGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103467 TGGACAAATACCGCCACACGTTCTGCAGCCTGCTGGGCAGGGATGAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCTGGGGCCTCTCCTACACGG         GCCTCCTCCACCACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103517 AGCTGGGGCCTCTCCTACACGGGTG...CAGGCCTCCTCCACCACAAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGACAAGACCAGCTTCTCGTCGCGGTTCGGCCAGGGCTCCATCATTGGCG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 103631 CGACAAGACCAGCTTCTCATCGCGGTTCGGCCAGGGCTCCATCATTGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCACCTGGACACCTGGCACGGCACACTCACCTTTTTCAAGAACAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103681 TGCACCTGGACACCTGGCACGGCACACTCACCTTTTTCAAGAACAGGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGTATAG         GTGTGGCAGCCACCAAGCTGCAGAACAAGAGATT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103731 TGTATAGGTG...CAGGTGTGGCAGCCACCAAGCTGCAGAACAAGAGATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTACCCGATGGTGTGCTCCACGGCGGCCCGGAGCAGCATGAAGGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104075 CTACCCGATGGTGTGCTCCACGGCGGCCCGGAGCAGCATGAAGGTCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCTCCTGTGCCAGCGCCACTTCCCTCCAGTACCTGTGCTGCCACCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104125 GCTCCTGTGCCAGCGCCACTTCCCTCCAGTACCTGTGCTGCCACCGCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CGCCAGCTGCGGCCAGACTCGGGAGACACGCTGGAGGGTCTGCCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104175 CGCCAGCTGCGGCCAGACTCGGGAGACACGCTGGAGGGTCTGCCGCTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCCGGGCCTCAAGCAGGTGCTACACAACAAGCTGGGCTGGGTCCTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104225 GCCGGGCCTCAAGCAGGTGCTACACAACAAGCTGGGCTGGGTCCTGAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGAGTTGCAGCCGCCGCAAGGCTCCAGTGTCCGATCCCCAGGCAGCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104275 TGAGTTGCAGCCGCCGCAAGGCTCCAGTGTCCGATCCCCAGGCAGCGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCCGCCCACCCCAGCAGTCGCGAGCCTCGGCCCTGCCAGAGGAAGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104325 TCCGCCCACCCCAGCAGTCGCGAGCCTCGGCCCTGCCAGAGGAAGCGCTG

   1100     .    :
   1056 CCGCCGGACC
        ||||||||||
 104375 CCGCCGGACC