seq1 = pF1KE4056.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE4056/gi568815587f_64984699.tfa (gi568815587f:64984699_65188111), 203413 bp

>pF1KE4056 930
>gi568815587f:64984699_65188111 (Chr11)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-214  (100417-100528)   100% ->
215-408  (101717-101910)   100% ->
409-481  (102022-102094)   100% ->
482-628  (102230-102376)   100% ->
629-746  (102618-102735)   100% ->
747-930  (103230-103413)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTTTGTAAGTGCCCCAAGAGAAAGGTGACCAACCTGTTCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTTTGTAAGTGCCCCAAGAGAAAGGTGACCAACCTGTTCTGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAACATCGGGTCAACGTCTGCGAGCACTGCCTGGTAGCCAATCACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAACATCGGGTCAACGTCTGCGAGCACTGCCTGGTAGCCAATCACGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         TGCATCGTCCAGTCCTACCTGCAATGGCTCCAAGATAGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTG...CAGTGCATCGTCCAGTCCTACCTGCAATGGCTCCAAGATAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACTACAACCCCAATTGCCGCCTGTGCAACATACCCCTGGCCAGCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100456 GACTACAACCCCAATTGCCGCCTGTGCAACATACCCCTGGCCAGCCGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACGACCCGCCTTGTCTGCTATG         ATCTCTTTCACTGGGCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100506 GACGACCCGCCTTGTCTGCTATGGTG...AAGATCTCTTTCACTGGGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCTCAATGAACGTGCTGCCCAGCTACCCCGAAACACGGCACCTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101735 GCCTCAATGAACGTGCTGCCCAGCTACCCCGAAACACGGCACCTGCCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATCAGTGCCCCAGCTGCAATGGCCCCATCTTCCCCCCAACCAACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101785 TATCAGTGCCCCAGCTGCAATGGCCCCATCTTCCCCCCAACCAACCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCCCCGTGGCCTCCGCACTGAGAGAGAAGCTGGCCACAGTCAACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101835 TGGCCCCGTGGCCTCCGCACTGAGAGAGAAGCTGGCCACAGTCAACTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCGGGCAGGACTGGGCCTCCCTCTG         ATCGATGAGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101885 CCCGGGCAGGACTGGGCCTCCCTCTGGTG...CAGATCGATGAGGTGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCCCAGAGCCCGAGCCCCTCAACACGTCTGACTTCTCTGACTGGTCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102037 AGCCCAGAGCCCGAGCCCCTCAACACGTCTGACTTCTCTGACTGGTCTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTTTAATG         CCAGCAGTACCCCTGGACCAGAGGAGGTAGACA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102087 TTTTAATGGTA...CAGCCAGCAGTACCCCTGGACCAGAGGAGGTAGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCGCCTCTGCTGCCCCAGCCTTCTACAGCCAGGCCCCCCGGCCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102263 GCGCCTCTGCTGCCCCAGCCTTCTACAGCCAGGCCCCCCGGCCCCCAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCCCCAGGCCGGCCCGAGCAGCACACAGTGATCCACATGGGCAATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102313 TCCCCAGGCCGGCCCGAGCAGCACACAGTGATCCACATGGGCAATCCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCCCTTGACTCACG         CCCCTAGGAAGGTGTATGATACGCGGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102363 GCCCTTGACTCACGGTG...TAGCCCCTAGGAAGGTGTATGATACGCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGATGACCGGACACCAGGCCTCCATGGAGACTGTGACGATGACAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102645 ATGATGACCGGACACCAGGCCTCCATGGAGACTGTGACGATGACAAGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGACGTCGGCCGGCCTTGGGTTGGCTGGCCCGGCTGCTAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102695 CGACGTCGGCCGGCCTTGGGTTGGCTGGCCCGGCTGCTAAGGTA...CAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAGCCGGGCTGGGTCTCGGAAGCGGCCGCTGACCCTGCTCCAGCGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103230 GAGCCGGGCTGGGTCTCGGAAGCGGCCGCTGACCCTGCTCCAGCGGGCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGCTGCTGCTACTCTTGGGACTGCTGGGCTTCCTGGCCCTCCTTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103280 GGCTGCTGCTACTCTTGGGACTGCTGGGCTTCCTGGCCCTCCTTGCCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATGTCTCGCCTAGGCCGGGCCGCAGCTGACAGCGATCCCAACCTGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103330 ATGTCTCGCCTAGGCCGGGCCGCAGCTGACAGCGATCCCAACCTGGACCC

    950     .    :    .    :    .    :
    897 ACTCATGAACCCTCACATCCGCGTGGGCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103380 ACTCATGAACCCTCACATCCGCGTGGGCCCCTCC