seq1 = pF1KE4023.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KE4023/gi568815586r_121679501.tfa (gi568815586r:121679501_121893633), 214133 bp

>pF1KE4023 633
>gi568815586r:121679501_121893633 (Chr12)

(complement)

1-138  (100001-100138)   100% ->
139-226  (100395-100482)   100% ->
227-336  (112442-112551)   100% ->
337-471  (112628-112762)   100% ->
472-633  (113972-114133)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCCCCCGGGGCCCTGGCCCAGACCGCCGCCCCCGGTCCGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCCCCCGGGGCCCTGGCCCAGACCGCCGCCCCCGGTCCGGGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGGAGCTGAAGATCGTGATCGTGGGCGACGGCGGCTGCGGCAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGGAGCTGAAGATCGTGATCGTGGGCGACGGCGGCTGCGGCAAGACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGCTCATGGTGTACAGCCAGGGCTCCTTCCCCGAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 CGCTGCTCATGGTGTACAGCCAGGGCTCCTTCCCCGAGGTG...CAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACGCCCCATCGGTGTTCGAGAAGTACACGGCCAGCGTGACCGTTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 TACGCCCCATCGGTGTTCGAGAAGTACACGGCCAGCGTGACCGTTGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGAGGTGACCCTGAACCTCTACGACACGGCCG         GGCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100448 CAAGGAGGTGACCCTGAACCTCTACGACACGGCCGGTG...CAGGGCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGACTATGACCGGCTGCGGCCCCTGTCCTACCAGAACACCCACCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112448 AAGACTATGACCGGCTGCGGCCCCTGTCCTACCAGAACACCCACCTCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCATCTGCTATGACGTCATGAATCCCACCAGCTACGACAACGTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112498 CTCATCTGCTATGACGTCATGAATCCCACCAGCTACGACAACGTCCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAG         TGGTTCCCTGAGGTCACGCATTTCTGCCGCGGGATCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112548 CAAGGTG...CAGTGGTTCCCTGAGGTCACGCATTTCTGCCGCGGGATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCATGGTGCTCATCGGCTGCAAGACAGACCTGAGGAAGGACAAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112665 CCATGGTGCTCATCGGCTGCAAGACAGACCTGAGGAAGGACAAGGAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGCGGAAGCTCCGGGCCGCCCAGCTGGAGCCCATCACCTACATGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 112715 CTGCGGAAGCTCCGGGCCGCCCAGCTGGAGCCCATCACCTACATGCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        GGCCTGAGCGCCTGCGAACAGATCCGAGCTGCTCTCTACCTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112765 G...CAGGGCCTGAGCGCCTGCGAACAGATCCGAGCTGCTCTCTACCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AATGTTCCGCCAAGTTTCGGGAGAATGTGGAGGACGTCTTCCGGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114015 AATGTTCCGCCAAGTTTCGGGAGAATGTGGAGGACGTCTTCCGGGAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCAAGGTGGCTCTCAGCGCTCTGAAGAAGGCGCAACGGCAGAAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114065 GCCAAGGTGGCTCTCAGCGCTCTGAAGAAGGCGCAACGGCAGAAGAAGCG

    650     .    :    .
    615 CCGGCTCTGCCTGCTGCTC
        |||||||||||||||||||
 114115 CCGGCTCTGCCTGCTGCTC