seq1 = pF1KE4019.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KE4019/gi568815586f_123484637.tfa (gi568815586f:123484637_123696726), 212090 bp

>pF1KE4019 603
>gi568815586f:123484637_123696726 (Chr12)

1-180  (100001-100180)   99% ->
181-373  (102111-102303)   100% ->
374-481  (105706-105813)   100% ->
482-603  (111969-112090)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGACGCTTGCTGAACTGCTGGTGCTCCTGGCCGCTCTCCTGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGACGCTTGCTGAACTGCTGGTGCTTCTGGCCGCTCTCCTGGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCTCGGGCTATTTCGTTAGCATCGACGCCCATGCTGAAGAGTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCTCGGGCTATTTCGTTAGCATCGACGCCCATGCTGAAGAGTGCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGAGCGGGTCACCTCGGGCACCAAGATGGGCCTCATCTTCGAGGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGAGCGGGTCACCTCGGGCACCAAGATGGGCCTCATCTTCGAGGTGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGGCGGCTTCCTGGACATCGACGTGGAG         ATTACAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100151 GAGGGCGGCTTCCTGGACATCGACGTGGAGGTG...CAGATTACAGGACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATAACAAAGGAATTTACAAAGGAGACAGAGAATCCAGTGGGAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102122 AGATAACAAAGGAATTTACAAAGGAGACAGAGAATCCAGTGGGAAATACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTTGCTGCTCACATGGATGGAACATACAAATTTTGTTTTAGTAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102172 CATTTGCTGCTCACATGGATGGAACATACAAATTTTGTTTTAGTAACCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGTCCACCATGACTCCAAAAATAGTGATGTTCACCATTGATATTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102222 ATGTCCACCATGACTCCAAAAATAGTGATGTTCACCATTGATATTGGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCTCCAAAAGGACAAGATATGGAAACAGAAG         CTCACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102272 GGCTCCAAAAGGACAAGATATGGAAACAGAAGGTG...TAGCTCACCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAAGCTAGAAGAAATGATCAATGAGCTAGCAGTGGCGATGACAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105715 ACAAGCTAGAAGAAATGATCAATGAGCTAGCAGTGGCGATGACAGCTGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGCACGAACAGGAATACATGGAAGTCCGGGAGAGAATACACAGAGCCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105765 AAGCACGAACAGGAATACATGGAAGTCCGGGAGAGAATACACAGAGCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482         TCAACGACAACACAAACAGCAGAGTGGTCCTTTGGTCCTTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105815 TA...CAGTCAACGACAACACAAACAGCAGAGTGGTCCTTTGGTCCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGAAGCTCTTGTTCTAGTTGCCATGACATTGGGACAGATCTACTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112011 TTGAAGCTCTTGTTCTAGTTGCCATGACATTGGGACAGATCTACTACCTG

    600     .    :    .    :    .    :
    574 AAGAGATTTTTTGAAGTCCGGAGAGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 112061 AAGAGATTTTTTGAAGTCCGGAGAGTTGTT