seq1 = pF1KE3987.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE3987/gi568815579r_9710899.tfa (gi568815579r:9710899_9918813), 207915 bp

>pF1KE3987 978
>gi568815579r:9710899_9918813 (Chr19)

(complement)

1-86  (100001-100086)   100% ->
87-159  (100197-100269)   100% ->
160-978  (107097-107915)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACTTTGGTCGAACTGCCGGACTCGGTCCTGCTCGAGATCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACTTTGGTCGAACTGCCGGACTCGGTCCTGCTCGAGATCTTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACCTCCCGGTACGGGACCGGATCCGCATCTCCAG         GGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100051 TTACCTCCCGGTACGGGACCGGATCCGCATCTCCAGGTG...CAGGGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCACCGCTGGAAGAGGCTGGTGGACGACCGGTGGCTGTGGCGACATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100202 GTCACCGCTGGAAGAGGCTGGTGGACGACCGGTGGCTGTGGCGACATGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCTGACGCTCTACACG         ATGCGACCTAAAGTCATGTGGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100252 GACCTGACGCTCTACACGGTA...CAGATGCGACCTAAAGTCATGTGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTCCTTCGAAGGTACATGGCATCCCGGCTCCATTCCCTGCGGATGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107120 CCTCCTTCGAAGGTACATGGCATCCCGGCTCCATTCCCTGCGGATGGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTACCTGTTCTCTGGCTCCCAGGCCCCCCAGTTGTCCCCTGCTCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107170 GCTACCTGTTCTCTGGCTCCCAGGCCCCCCAGTTGTCCCCTGCTCTGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAGCCCTGGGCCAGAAGTGCCCCAACCTGAAGCGCCTCTGCCTGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 107220 AGAGCCCTGGGCCAGAAGTGCCCCAACCTGAAGCGCCTCTGCCTGCACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCGACCTGAGCATGGTGCCCATCACCAGCCTGCCCAGCACCTTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107270 GGCCGACCTGAGCATGGTGCCCATCACCAGCCTGCCCAGCACCTTGAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTGGAGCTGCACAGCTGCGAGATCTCCATGGCCTGGCTCCACAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107320 CCCTGGAGCTGCACAGCTGCGAGATCTCCATGGCCTGGCTCCACAAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGGACCCCACCGTGCTGCCCCTGCTTGAATGCATCGTGCTGGACCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107370 CAGGACCCCACCGTGCTGCCCCTGCTTGAATGCATCGTGCTGGACCGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCCCGCCTTCCGTGACGAGCACCTGCAGGGCCTGACGCGCTTCCGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107420 CCCCGCCTTCCGTGACGAGCACCTGCAGGGCCTGACGCGCTTCCGGGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCGCTCGCTGGTGCTGGGTGGTACCTACCGTGTGACCGAGACAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107470 TGCGCTCGCTGGTGCTGGGTGGTACCTACCGTGTGACCGAGACAGGGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GATGCTGGCCTGCAGGAGCTCAGCTATCTGCAGAGGCTTGAGGTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107520 GATGCTGGCCTGCAGGAGCTCAGCTATCTGCAGAGGCTTGAGGTGCTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTGCACCCTGTCTGCCGACAGCACCCTGCTGGCCATCAGCCGCCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107570 CTGCACCCTGTCTGCCGACAGCACCCTGCTGGCCATCAGCCGCCACCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GAGATGTGCGCAAGATCCGGCTGACCGTGAGGGGCCTCTCTGCCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107620 GAGATGTGCGCAAGATCCGGCTGACCGTGAGGGGCCTCTCTGCCCCTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGGCTGTGCTGGAGGGAATGCCGGCCCTGGAGAGTCTGTGCCTGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107670 CTGGCTGTGCTGGAGGGAATGCCGGCCCTGGAGAGTCTGTGCCTGCAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCCCCTCGTCACCCCAGAAATGCCCTCCCCCACTGAAATCCTCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107720 TCCCCTCGTCACCCCAGAAATGCCCTCCCCCACTGAAATCCTCTCCTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCCTCACTATGCCCAAGCTCAGAGTCCTTGAGCTGCAGGGGCTGGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107770 GCCTCACTATGCCCAAGCTCAGAGTCCTTGAGCTGCAGGGGCTGGGGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GAGGGTCAGGAGGCGGAGAAGATCCTGTGTAAGGGGCTGCCCCACTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107820 GAGGGTCAGGAGGCGGAGAAGATCCTGTGTAAGGGGCTGCCCCACTGTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    933 GGTCATCGTCAGGGCTTGCCCCAAAGAGTCTATGGACTGGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107870 GGTCATCGTCAGGGCTTGCCCCAAAGAGTCTATGGACTGGTGGATG