seq1 = pF1KE3936.tfa, 537 bp
seq2 = pF1KE3936/gi568815588f_18559638.tfa (gi568815588f:18559638_18775213), 215576 bp

>pF1KE3936 537
>gi568815588f:18559638_18775213 (Chr10)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-107  (106938-106998)   100% ->
108-255  (108893-109040)   100% ->
256-339  (112985-113068)   100% ->
340-491  (114347-114498)   100% ->
492-537  (115531-115576)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTGATCTTCGCCAAACTGTGGAGCCTCTTCTGTAACCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGGGGCTGATCTTCGCCAAACTGTGGAGCCTCTTCTGTAACCAAGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      AACACAAAGTAATTATAGTGGGACTGGATAATGCAGGGAAAACCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..TAGAACACAAAGTAATTATAGTGGGACTGGATAATGCAGGGAAAACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATTCTTTACCAATT         CTTAATGAATGAAGTGGTTCATACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 106983 CCATTCTTTACCAATTGTA...CAGCTTAATGAATGAAGTGGTTCATACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCTCCAACCATAGGAAGCAATGTTGAAGAAATAGTTGTGAAGAACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108918 TCTCCAACCATAGGAAGCAATGTTGAAGAAATAGTTGTGAAGAACACTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTTTCTTATGTGGGATATTGGTGGTCAGGAGTCTCTGCGATCATCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108968 TTTTCTTATGTGGGATATTGGTGGTCAGGAGTCTCTGCGATCATCCTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACACATATTACTCAAATACAGAG         TTCATCATTCTTGTTGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109018 ACACATATTACTCAAATACAGAGGTA...TAGTTCATCATTCTTGTTGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATAGCATTGACAGGGAACGACTAGCTATTACAAAAGAAGAATTATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113003 GATAGCATTGACAGGGAACGACTAGCTATTACAAAAGAAGAATTATACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AATGTTGGCTCATGAG         GATTTACGGAAGGCTGCAGTCCTTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113053 AATGTTGGCTCATGAGGTA...CAGGATTTACGGAAGGCTGCAGTCCTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCTTTGCAAATAAACAGGATATGAAAGGGTGTATGACAGCAGCTGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114372 TCTTTGCAAATAAACAGGATATGAAAGGGTGTATGACAGCAGCTGAAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCGAAATACCTCACCCTTAGTTCAATTAAGGATCATCCATGGCACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114422 TCGAAATACCTCACCCTTAGTTCAATTAAGGATCATCCATGGCACATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATCCTGCTGTGCTCTCACAGGAGAAGG         GTTATGCCAAGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114472 ATCCTGCTGTGCTCTCACAGGAGAAGGGTA...TAGGTTATGCCAAGGTC

    550     .    :    .    :    .    :
    506 TAGAGTGGATGACCTCCCGGATTGGTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 115545 TAGAGTGGATGACCTCCCGGATTGGTGTGAGA