seq1 = pF1KE3932.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE3932/gi568815589r_113197609.tfa (gi568815589r:113197609_113398184), 200576 bp

>pF1KE3932 576
>gi568815589r:113197609_113398184 (Chr9)

(complement)

1-576  (100001-100576)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGCAGCAGGGCCGGGAGCTTGAGGCTGAGTGCCCCGTCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGCAGCAGGGCCGGGAGCTTGAGGCTGAGTGCCCCGTCTGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACCCCTTCAACAACACGTTCCATACCCCCAAAATGCTGGATTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACCCCTTCAACAACACGTTCCATACCCCCAAAATGCTGGATTGCTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCCTTCTGCGTGGAATGTCTGGCCCACCTCAGCCTTGTGACTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCCTTCTGCGTGGAATGTCTGGCCCACCTCAGCCTTGTGACTCCAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCGCCGCCTGCTGTGCCCACTCTGTCGCCAGCCCACAGTGCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCGCCGCCTGCTGTGCCCACTCTGTCGCCAGCCCACAGTGCTGGCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGGCAGCCTGTCACTGACTTGCCCACGGACACTGCCATGCTCACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100201 AGGGCAGCCTGTCACTGACTTGCCCACGGACACTGCCATGCTCGCCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCGCCTGGAGCCCCACCATGTCATCCTGGAAGGCCATCAGCTGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCGCCTGGAGCCCCACCATGTCATCCTGGAAGGCCATCAGCTGTGCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGGACCAGCCCAAGAGCCGCTACTTCCTGCGCCAGCCTCGAGTCTACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100301 AAGGACCAGCCCAAGAGCCGCTACTTCCTGCGCCAGCCTCAAGTCTACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGACCTTGGCCCCCAGCCTGGGGGCCAGACTGGGCCGCCCCCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGACCTTGGCCCCCAGCCTGGGGGCCAGACTGGGCCGCCCCCAGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGCCTCTGCCACCGTGTCTACGCCCATCCTCATCCCCAGCCACCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGCCTCTGCCACCGTGTCTACGCCCATCCTCATCCCCAGCCACCACTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGAGGGAGTGTTTCCGCAACCCTCAGTTCCGCATCTTTGCCTACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGAGGGAGTGTTTCCGCAACCCTCAGTTCCGCATCTTTGCCTACCTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCCGTCATCCTCAGTGTCACTCTGTTGCTCATATTCTCCATCTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCCGTCATCCTCAGTGTCACTCTGTTGCTCATATTCTCCATCTTTTGGA

    550     .    :    .    :    .
    551 CCAAGCAGTTCCTTTGGGGTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCAAGCAGTTCCTTTGGGGTGTGGGG