seq1 = pF1KE3919.tfa, 2121 bp
seq2 = pF1KE3919/gi568815591r_102713345.tfa (gi568815591r:102713345_103129418), 416074 bp

>pF1KE3919 2121
>gi568815591r:102713345_103129418 (Chr7)

(complement)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-217  (100671-100819)   100% ->
218-327  (101861-101970)   99% ->
328-495  (104189-104356)   100% ->
496-591  (161302-161397)   100% ->
592-724  (165754-165886)   100% ->
725-777  (197486-197538)   100% ->
778-878  (203045-203145)   100% ->
879-1008  (216204-216333)   100% ->
1009-1107  (245107-245205)   100% ->
1108-1225  (245734-245851)   100% ->
1226-1388  (245952-246114)   100% ->
1389-1508  (250969-251088)   100% ->
1509-1635  (251826-251952)   100% ->
1636-1770  (296445-296579)   100% ->
1771-1934  (307216-307379)   100% ->
1935-2121  (315888-316074)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCCGGAATTGATGATAAAAGCCTGTAGCTTTTATACTGGACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTCCGGAATTGATGATAAAAGCCTGTAGCTTTTATACTGGACATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTAAAGACTCATTTTTG         CACTTGGAGAGACATAGCTCGTA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 AGTAAAGACTCATTTTTGGTA...CAGCACTTGGAGAGACATAGCTCGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAAATGAAAATGTCGTCCTGGCTGAAAAAATGAACAGAGCAGTGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100694 CAAATGAAAATGTCGTCCTGGCTGAAAAAATGAACAGAGCAGTGACATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACAATTTCAGACTTCAAAAATCTGTATTTCATCACTGGCACTCTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100744 TACAATTTCAGACTTCAAAAATCTGTATTTCATCACTGGCACTCTTATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAGACCAGAAAGAAAAACTTAAAA         ATATGCTATTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| ||||||||||
 100794 GGAAGACCAGAAAGAAAAACTTAAAAGTA...CAGATATTCTATTGCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TACAACAGATCATCTATTGTCACAAGCTAACCATTATCCTAACAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101876 TACAACAGATCATCTATTGTCACAAGCTAACCATTATCCTAACAAAATGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGAATACAGCAAGACATAAGAGTAAAAAGAAAGAAGATGAGCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101926 CGGAATACAGCAAGACATAAGAGTAAAAAGAAAGAAGATGAGCTGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     ATATTAAAACATGAACTTCAATTGAAAAAATGGAAAAATAGGTTAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101976 .CAGATATTAAAACATGAACTTCAATTGAAAAAATGGAAAAATAGGTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TACTCAAAAGAGCTGCTGCAGAAGAATCCAATTTTCCTGAACGAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104235 TACTCAAAAGAGCTGCTGCAGAAGAATCCAATTTTCCTGAACGAAGTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTGAAGTCTTTCTTGTAGATGAGACTCTAAAATGTGACATTTCACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104285 TCTGAAGTCTTTCTTGTAGATGAGACTCTAAAATGTGACATTTCACTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACCTGAAAGAGCAATATTACAG         ATTTTCTTCTACCTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104335 ACCTGAAAGAGCAATATTACAGGTT...TAGATTTTCTTCTACCTCAGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAAAAGATGTGATAATATGTGGTCAAGTTAATCATGCCTGGATGTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161321 TAAAAGATGTGATAATATGTGGTCAAGTTAATCATGCCTGGATGTTGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACACAACTAAACTCACTGTGGAATGCT         ATTGATTTTTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 161371 ACACAACTAAACTCACTGTGGAATGCTGTA...TAGATTGATTTTTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGTGAAAAATGTGATTCCAGATAAATATATAGTGTCTACTTTGCAAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165768 AGTGAAAAATGTGATTCCAGATAAATATATAGTGTCTACTTTGCAAAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGCGTTTAAATGTGCTGCGTTTGAATTTTCGTGGTTGTCTTCTCCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165818 GGCGTTTAAATGTGCTGCGTTTGAATTTTCGTGGTTGTCTTCTCCGACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAACTTTCAGATCTGTCA         GCCACTGTAGGAACTTGCAAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 165868 AAAACTTTCAGATCTGTCAGTA...TAGGCCACTGTAGGAACTTGCAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTTGAATGTCTCTGACTGCCCAACATTCACA         GATGAATCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 197508 GTTGAATGTCTCTGACTGCCCAACATTCACAGTG...CAGGATGAATCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGAGACACATTTCTGAGGGCTGCCCGGGGGTCCTGTGTCTCAATCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203055 TGAGACACATTTCTGAGGGCTGCCCGGGGGTCCTGTGTCTCAATCTGTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AACACAACTATCACCAACAGGACGATGCGACTCCTGCCGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 203105 AACACAACTATCACCAACAGGACGATGCGACTCCTGCCGAGGTA...CAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GCACTTCCACAACTTACAGAATCTTAGTTTGGCTTATTGCAGACGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216204 GCACTTCCACAACTTACAGAATCTTAGTTTGGCTTATTGCAGACGGTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CAGACAAAGGCTTACAGTACCTGAACTTGGGGAATGGATGCCACAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216254 CAGACAAAGGCTTACAGTACCTGAACTTGGGGAATGGATGCCACAAGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATCTATCTGGACCTCTCTGGCTGCACCCAG         ATTTCAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 216304 ATCTATCTGGACCTCTCTGGCTGCACCCAGGTT...CAGATTTCAGTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGGCTTCAGGTACATTGCAAACAGCTGCACTGGAATTATGCATCTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245118 AGGCTTCAGGTACATTGCAAACAGCTGCACTGGAATTATGCATCTTACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTAATGACATGCCAACTCTGACGGACAACTGTGTAAAA         GCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 245168 TTAATGACATGCCAACTCTGACGGACAACTGTGTAAAAGTA...AAGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TTAGTTGAAAAATGCTCTCGTATTACATCGCTGGTTTTCACTGGTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245737 TTAGTTGAAAAATGCTCTCGTATTACATCGCTGGTTTTCACTGGTGCACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCATATCTCCGATTGTACTTTCAGAGCTCTTTCTGCTTGTAAACTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245787 GCATATCTCCGATTGTACTTTCAGAGCTCTTTCTGCTTGTAAACTCAGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGATCCGATTTGAAG         GAAATAAAAGGGTTACTGATGCATCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 245837 AGATCCGATTTGAAGGTC...CAGGAAATAAAAGGGTTACTGATGCATCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TTCAAATTTATAGACAAGAATTATCCAAATCTCAGTCACATTTATATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245978 TTCAAATTTATAGACAAGAATTATCCAAATCTCAGTCACATTTATATGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGACTGCAAGGGAATAACAGACAGCAGCCTCAGATCCCTTTCACCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246028 TGACTGCAAGGGAATAACAGACAGCAGCCTCAGATCCCTTTCACCTTTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGCAACTGACTGTGTTGAATTTGGCAAATTGTGTAAG         AATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 246078 AGCAACTGACTGTGTTGAATTTGGCAAATTGTGTAAGGTA...CAGAATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GGTGATATGGGACTAAAGCAATTTCTTGATGGTCCTGCAAGCATGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250973 GGTGATATGGGACTAAAGCAATTTCTTGATGGTCCTGCAAGCATGAGGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 AAGAGAGCTAAATTTAAGCAACTGTGTGCGGCTAAGTGATGCCTCTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251023 AAGAGAGCTAAATTTAAGCAACTGTGTGCGGCTAAGTGATGCCTCTGTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGAAACTATCTGAGCG         CTGCCCTAATTTAAACTACTTGAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 251073 TGAAACTATCTGAGCGGTA...TAGCTGCCCTAATTTAAACTACTTGAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TTACGAAATTGTGAACATTTGACTGCCCAAGGAATTGGATATATTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251851 TTACGAAATTGTGAACATTTGACTGCCCAAGGAATTGGATATATTGTAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CATCTTTTCCTTGGTATCAATAGATCTCTCTGGAACAGACATCTCTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251901 CATCTTTTCCTTGGTATCAATAGATCTCTCTGGAACAGACATCTCTAATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AG         GCATTCTGCAAAAGCTCACTGATCTTGGAACATTTGGAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251951 AGGTA...CAGGCATTCTGCAAAAGCTCACTGATCTTGGAACATTTGGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GTCTCTTATTGCTCCCAGCTGTCAGATATGATTATCAAAGCACTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296484 GTCTCTTATTGCTCCCAGCTGTCAGATATGATTATCAAAGCACTGGCCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TTACTGCATTAACCTCACATCTCTCAGCATTGCTGGCTGTCCAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 296534 TTACTGCATTAACCTCACATCTCTCAGCATTGCTGGCTGTCCAAAGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1771      ATTACTGACTCAGCAATGGAGATGTTATCGGCAAAATGCCATTAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296584 ..CAGATTACTGACTCAGCAATGGAGATGTTATCGGCAAAATGCCATTAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CTGCACATTTTGGATATCTCTGGTTGTGTCTTGCTTACTGACCAAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307261 CTGCACATTTTGGATATCTCTGGTTGTGTCTTGCTTACTGACCAAATCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGAGGACCTTCAGATAGGCTGCAAACAACTCCGGATCCTTAAGATGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307311 TGAGGACCTTCAGATAGGCTGCAAACAACTCCGGATCCTTAAGATGCAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ACTGCACAAATATTTCCAA         GAAGGCAGCTCAAAGAATGTCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 307361 ACTGCACAAATATTTCCAAGTA...CAGGAAGGCAGCTCAAAGAATGTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 TCTAAAGTTCAGCAGCAGGAATACAACACTAATGGCCCTCCACGTTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 315910 TCTAAAGTTCAGCAGCAGGAATACAACACTAATGACCCTCCACGTTGGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TGGCTATGATAGGGAAGGAAACCCTGTTACAGAGCTTGACAACATAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 315960 TGGCTATGATAGGGAAGGAAACCCTGTTACAGAGCTTGACAACATAACAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CATCTAAAGGAGCCTTAGAATTAACAGTGAAAAAGTCAACATACAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316010 CATCTAAAGGAGCCTTAGAATTAACAGTGAAAAAGTCAACATACAGCAGT

   2250     .    :    .
   2107 GAAGACCAAGCAGCG
        |||||||||||||||
 316060 GAAGACCAAGCAGCG