seq1 = pF1KE3874.tfa, 2097 bp
seq2 = pF1KE3874/gi568815591r_138961035.tfa (gi568815591r:138961035_139209331), 248297 bp

>pF1KE3874 2097
>gi568815591r:138961035_139209331 (Chr7)

(complement)

1-308  (100001-100308)   99% ->
309-444  (119573-119708)   100% ->
445-697  (125300-125552)   100% ->
698-1471  (129089-129862)   100% ->
1472-1573  (130679-130780)   100% ->
1574-1697  (132923-133046)   100% ->
1698-1872  (135302-135476)   100% ->
1873-1993  (144333-144453)   100% ->
1994-2097  (148194-148297)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACCCGGAGGTGTGCTGCTTCATCACCAAAATCCTGTGCGCCCA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACCCGGAGGTGTGCTGCTTCATCACCAAAATCCTGTGCGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGGCCGCATGGCCCTGGACGCGCTGCTCCAGGAGATCGCGCTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGGCCGCATGGCCCTGGACGCGCTGCTCCAGGAGATCGCGCTGTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCGCAGCTCTGTGAGGTGCTGCAGGTGGCCGGGCCCGACCGCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCGCAGCTCTGTGAGGTGCTGCAGGTGGCCGGGCCCGACCGCTTTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGTTGGAGACCGGCGGCGAGGCCGGGATCACCCGATCGGTGGTGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGTTGGAGACCGGCGGCGAGGCCGGGATCACCCGATCGGTGGTGGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACTCGAGCCCGGGTCTGCCGTCGCAAGTACTGCCAGAGACCCTGCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACTCGAGCCCGGGTCTGCCGTCGCAAGTACTGCCAGAGACCCTGCGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGCATCTCTGCAAACTCAACTTGCTGGGCCGGTGCAACTATTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGCATCTCTGCAAACTCAACTTGCTGGGCCGGTGCAACTATTCGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGAGCG         GAATTTATGCAAATATTCTCATGAGGTTCTCTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCGAGCGGTG...CAGGAATTTATGCAAATATTCTCATGAGGTTCTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAAGAGAACTTCAAAGTCCTGAAAAATCACGAACTCTCTGGACTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119606 AGAAGAGAACTTCAAAGTCCTGAAAAATCACGAACTCTCTGGACTGAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGAGGAATTAGCAGTGCTCCTCCTCCAAAGTGATCCTTTTTTTATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119656 AAGAGGAATTAGCAGTGCTCCTCCTCCAAAGTGATCCTTTTTTTATGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAG         ATATGCAAAAGTTATAAGGGAGAGGGTCGGCAGCAGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119706 GAGGTA...TAGATATGCAAAAGTTATAAGGGAGAGGGTCGGCAGCAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTGTAACCAGCAGCCACCGTGTTCAAGACTCCACATCTGTGACCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125338 TTGTAACCAGCAGCCACCGTGTTCAAGACTCCACATCTGTGACCACTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCGAGGGAACTGTCGTTTTCCCAACTGCCTCCGGTCCCATAACCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125388 CCCGAGGGAACTGTCGTTTTCCCAACTGCCTCCGGTCCCATAACCTGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACAGAAAGGTGCTGGCCATCATGAGGGAGCACGGGCTGAACCCCGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125438 GACAGAAAGGTGCTGGCCATCATGAGGGAGCACGGGCTGAACCCCGACGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGTCCAGAACATCCAGGACATCTGCAACAGCAAGCACATGCAGAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125488 GGTCCAGAACATCCAGGACATCTGCAACAGCAAGCACATGCAGAAGAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCCCAGGGCCCAGAG         CTCCTTCTTCACATCGTAGAAACATG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 125538 CCCCAGGGCCCAGAGGTA...TAGCTCCTTCTTCACATCGTAGAAACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCATATAGGGCTAGAAGCAAGAGTAGAGATCGGTTCTTTCAGGGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129115 GCATATAGGGCTAGAAGCAAGAGTAGAGATCGGTTCTTTCAGGGCAGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGAATTTCTTGCGTCTGCTTCAGCGTCTGCTGAGAGGTCCTGCACACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129165 AGAATTTCTTGCGTCTGCTTCAGCGTCTGCTGAGAGGTCCTGCACACCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTCCAGATCAGATCAGCCACAGGGCTTCCCTGGAGGACGCGCCTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129215 GTCCAGATCAGATCAGCCACAGGGCTTCCCTGGAGGACGCGCCTGTGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GATCTCACCCGCAAGTTCACGTATCTGGGGAGTCAGGATCGCGCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129265 GATCTCACCCGCAAGTTCACGTATCTGGGGAGTCAGGATCGCGCTCGGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCCCTCAGGCTCGTCCAAGGCTACTGATCTTGGAGGAACAAGTCAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129315 TCCCTCAGGCTCGTCCAAGGCTACTGATCTTGGAGGAACAAGTCAGGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GGACAAGCCAGAGGTTTTTAGAGAACGGCAGTCAAGAGGACCTCTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129365 GGACAAGCCAGAGGTTTTTAGAGAACGGCAGTCAAGAGGACCTCTTGCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGAAATCCAGGCAGCACTTACCTTGCTTCCAATTCAACATCAGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129415 GGAAATCCAGGCAGCACTTACCTTGCTTCCAATTCAACATCAGCCCCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CTGGAAGAGCCTCACATCCTGGACGAATGACCAAGGCGCCAGGAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129465 CTGGAAGAGCCTCACATCCTGGACGAATGACCAAGGCGCCAGGAGAAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CTGTGTTTTCTCCCACGCTACCTGCCGCCCGCTCTTCTCTTGGCTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129515 CTGTGTTTTCTCCCACGCTACCTGCCGCCCGCTCTTCTCTTGGCTCTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CAAACACCTGAAGCTGTGACCACCAGAAAGGGCACAGGCTTGCTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129565 CAAACACCTGAAGCTGTGACCACCAGAAAGGGCACAGGCTTGCTTTCCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGACTACAGGATCATCAATGGCAAAAGTGGAACTCAGGACATCCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129615 AGACTACAGGATCATCAATGGCAAAAGTGGAACTCAGGACATCCAGCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GCCCTCTTTTTAATAATAATGCTGATGGAGTGGCCACAGATATAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129665 GCCCTCTTTTTAATAATAATGCTGATGGAGTGGCCACAGATATAACTTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ACCAGATCCTTAAATTACAAAAGCACTAGCAGCGGTCACAGAGAAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129715 ACCAGATCCTTAAATTACAAAAGCACTAGCAGCGGTCACAGAGAAATATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 ATCACCTAGGATTCAGGATGCTGGACCTGCTTCCCGAGATGTCCAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129765 ATCACCTAGGATTCAGGATGCTGGACCTGCTTCCCGAGATGTCCAGGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CTGGCAGAATCGCAGATGATGCTGACCCAAGAGTAGCACTTGTTAACG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 129815 CTGGCAGAATCGCAGATGATGCTGACCCAAGAGTAGCACTTGTTAACGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1472        ATTCTTTATCTGATGTCACAAGTACCACATCTTCTAGGGTGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129865 A...TAGATTCTTTATCTGATGTCACAAGTACCACATCTTCTAGGGTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 TGATCATGACTCAGAGGAAATTTGTCTTGACCATCTGTGTAAGGGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130722 TGATCATGACTCAGAGGAAATTTGTCTTGACCATCTGTGTAAGGGTTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CGCTTAATG         GTAGCTGCAGCAAAGTCCACTTCCATCTGCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 130772 CGCTTAATGGTG...TAGGTAGCTGCAGCAAAGTCCACTTCCATCTGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 TACCGGTGGCAGATGCTTATTGGTAAAACCTGGACGGACTTTGAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132955 TACCGGTGGCAGATGCTTATTGGTAAAACCTGGACGGACTTTGAGCACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GGAGACGATCGAGAAAGGCTACTGTAACCCCGGAATCCACCT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 133005 GGAGACGATCGAGAAAGGCTACTGTAACCCCGGAATCCACCTGTA...CA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698  CTGTTCTGTAGGAAGTTATACAATCAATTTTCGGGTAATGAGTTGTGAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135301 GCTGTTCTGTAGGAAGTTATACAATCAATTTTCGGGTAATGAGTTGTGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 TCCTTTCCCATCCGACGCCTCTCCACTCCTTCTTCTGTCACCAAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135351 TCCTTTCCCATCCGACGCCTCTCCACTCCTTCTTCTGTCACCAAGCCAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CAATTCTGTCTTCACCACCAAATGGATTTGGTATTGGAAGAATGAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135401 CAATTCTGTCTTCACCACCAAATGGATTTGGTATTGGAAGAATGAATCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 GCACATGGATTCAGTATGGAGAAGAG         AAAGACAAACGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 135451 GCACATGGATTCAGTATGGAGAAGAGGTG...TAGAAAGACAAACGGAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AATTCAAACGTCGACTCTTCATACCTGGAGTCTCTCTATCAATCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144348 AATTCAAACGTCGACTCTTCATACCTGGAGTCTCTCTATCAATCCTGTCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 GAGGGGAGTTGTGCCATTTCAGGCGGGCTCACGGAACTATGAGCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144398 GAGGGGAGTTGTGCCATTTCAGGCGGGCTCACGGAACTATGAGCTGAGTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 TCCAAG         GGATGATTCAGACAAACATAGCTTCCAAAACTCAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144448 TCCAAGGTG...AAGGGATGATTCAGACAAACATAGCTTCCAAAACTCAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 AAGGATGTCATCAGAAGACCAACATTTGTGCCTCAGTGGTATGTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148229 AAGGATGTCATCAGAAGACCAACATTTGTGCCTCAGTGGTATGTGCAGCA

   2150     .    :    .
   2079 GATGAAGAGAGGGCCAGAG
        |||||||||||||||||||
 148279 GATGAAGAGAGGGCCAGAG