seq1 = pF1KE3815.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KE3815/gi568815588f_133754514.tfa (gi568815588f:133754514_133759673), 5160 bp

>pF1KE3815 1455
>gi568815588f:133754514_133759673 (Chr10)

1-1455  (1862-3310)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGGTGGAGCCTGCCTGCCTGTGGGCCTTTACAAGGGCGGCTGGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
   1862 ATGAAGGGGTGGAGCCTGCCTGCCCGTGGGCCTTTACAAGGGCGGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCTGGCTGGCTGTCCGGGCAGGCCTCCTGGCTGCACCTGCCGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1912 TGGCTGGCTGGCTGTCCGGGCAGGCCTCCTGGCTGCACCTGCCGCAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGTCCGGCTGAGGTGCACGGGAGCCCGCCGGCCTCTCTCTGCCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1962 ACAGTCCGGCTGAGGTGCACGGGAGCCCGCCGGCCTCTCTCTGCCCGCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGTCCGTGAAATTCCGGCCGGGGCTCACCGCGATGGCCCTCCCGACACC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2012 CCGTCCGTGAAATTGCGGCCGGGGCTCACCGCGATGGCCCTCCCGACACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCGGACAGCACCCTCCCCGCGGAAGCCCGGGGACGAGGACGGCGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2062 TTCGGACAGCACCCTCCCCGCGGAAGCCCGGGGACGAGGACGGCGACGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GACTCGTTTGGACCCCGAGCCAAAGCGAGGCCCTGCGAGCCTGCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2112 GACTCGTTTGGACCCCGAGCCAAAGCGAGGCCCTGCGAGCCTGCTTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGAACCCGTACCCGGGCATCGCCACCAGAGAACGGCTGGCCCAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2162 CGGAACCCGTACCCGGGCATCGCCACCAGAGAACGGCTGGCCCAGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCATTCCGGAGCCCAGGGTCCAGATTTGGTTTCAGAATGAGAGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2212 CGGCATTCCGGAGCCCAGGGTCCAGATTTGGTTTCAGAATGAGAGGTCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCAGCTGAGGCAGCACCGGCGGGAATCTCGGCCCTGGCCCGGGAGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2262 GCCAGCTGAGGCAGCACCGGCGGGAATCTCGGCCCTGGCCCGGGAGACGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCCCGCCAGAAGGCCGGCGAAAGCGGACCGCCGTCACCGGATCCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2312 GGCCCGCCAGAAGGCCGGCGAAAGCGGACCGCCGTCACCGGATCCCAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGCCCTGCTCCTCCGAGCCTTTGAGAAGGATCGCTTTCCAGGCATCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2362 CGCCCTGCTCCTCCGAGCCTTTGAGAAGGATCGCTTTCCAGGCATCGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCGGGAGGAGCTGGCCAGAGAGACGGGCCTCCCGGAGTCCAGGATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2412 CCCGGGAGGAGCTGGCCAGAGAGACGGGCCTCCCGGAGTCCAGGATTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTGGTTTCAGAATCGAAGGGCCAGGCACCCGGGACAGGGTGGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2462 ATCTGGTTTCAGAATCGAAGGGCCAGGCACCCGGGACAGGGTGGCAGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCCGCGCAGGCAGGCGGCCTGTGCAGCGCGGCCCCCGGCGGGGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2512 GCCCGCGCAGGCAGGCGGCCTGTGCAGCGCGGCCCCCGGCGGGGGTCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGCTCCCTCGTGGGTCGCCTTCGCCCACACCGGCGCGTGGGGAACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2562 CTGCTCCCTCGTGGGTCGCCTTCGCCCACACCGGCGCGTGGGGAACGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTCCCGCACCCCACGTGCCCTGCGCGCCTGGGGCTCTCCCACAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2612 CTTCCCGCACCCCACGTGCCCTGCGCGCCTGGGGCTCTCCCACAGGGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTCGTGAGCCAGGCAGCGAGGGCCGCCCCCGCGCTGCAGCCCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2662 TTTCGTGAGCCAGGCAGCGAGGGCCGCCCCCGCGCTGCAGCCCAGCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGCGCCGGCAGAGGGGATCTCCCAACCTGCCCCGGCGCGCGGGGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2712 CCGCGCCGGCAGAGGGGATCTCCCAACCTGCCCCGGCGCGCGGGGATTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCTACGCCGCCCCGGCTCCTCCGGACGGGGCGCTCTCCCACCCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2762 GCCTACGCCGCCCCGGCTCCTCCGGACGGGGCGCTCTCCCACCCTCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCCTCGGTGGCCTCCGCACCCGGGCAAAAGCCGGGAGGACCGGGACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2812 TCCTCGGTGGCCTCCGCACCCGGGCAAAAGCCGGGAGGACCGGGACCCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCGCGACGGCCTGCCGGGCCCCTGCGCGGTGGCACAGCCTGGGCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2862 AGCGCGACGGCCTGCCGGGCCCCTGCGCGGTGGCACAGCCTGGGCCCGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAAGCGGGGCCGCAGGGCCAAGGGGTGCTTGCGCCACCCACGTCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2912 CAAGCGGGGCCGCAGGGCCAAGGGGTGCTTGCGCCACCCACGTCCCAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAGTCCGTGGTGGGGCTGGGGCCGGGGTCCCCAGGTCGCCGGGGCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2962 GAGTCCGTGGTGGGGCTGGGGCCGGGGTCCCCAGGTCGCCGGGGCGGCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGGAACCCCAAGCCGGGGCAGCTCCACCTCCCCAGCCCGCGCCCCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3012 GGGAACCCCAAGCCGGGGCAGCTCCACCTCCCCAGCCCGCGCCCCCGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCCTCCGCCTCCGCGCGGCAGGGGCAGATGCAAGGCATCCCGGCGCCCTC
        ||||||||------||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3062 GCCTCCGC      GCGGCAGGGGCAGATGCAAGGCATCCCGGCGCCCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCAGGCGCTCCAGGAGCCGGCGCCCTGGTCTGCACTCCCCTGCGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3106 CCAGGCGCTCCAGGAGCCGGCGCCCTGGTCTGCACTCCCCTGCGGCCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGCTGGATGAGCTCCTGGCGAGCCCGGAGTTTCTGCAGCAGGCGCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3156 TGCTGGATGAGCTCCTGGCGAGCCCGGAGTTTCTGCAGCAGGCGCAACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTCCTAGAAACGGAGGCCCCGGGGGAGCTGGAGGCCTCGGAAGAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3206 CTCCTAGAAACGGAGGCCCCGGGGGAGCTGGAGGCCTCGGAAGAGGCCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTCGCTGGAAGCACCCCTCAGCGAGGAAGAATACCGGGCTCTGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3256 CTCGCTGGAAGCACCCCTCAGCGAGGAAGAATACCGGGCTCTGCTGGAGG

   1450     .
   1451 AGCTT
        |||||
   3306 AGCTT