seq1 = pF1KE3767.tfa, 2265 bp
seq2 = pF1KE3767/gi568815586r_121208483.tfa (gi568815586r:121208483_121452340), 243858 bp

>pF1KE3767 2265
>gi568815586r:121208483_121452340 (Chr12)

(complement)

1-207  (100001-100207)   100% ->
208-287  (104460-104539)   100% ->
288-397  (105336-105445)   100% ->
398-590  (106310-106502)   99% ->
591-657  (110272-110338)   100% ->
658-759  (114949-115050)   100% ->
760-950  (116618-116808)   100% ->
951-1032  (120913-120994)   100% ->
1033-1122  (121669-121758)   100% ->
1123-1304  (123844-124025)   100% ->
1305-1440  (125110-125245)   100% ->
1441-1515  (131882-131956)   100% ->
1516-1637  (132523-132644)   100% ->
1638-1745  (133733-133840)   100% ->
1746-1893  (133917-134064)   100% ->
1894-2056  (142478-142640)   100% ->
2057-2265  (143650-143858)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGCGTCCACGAGAGCCTCTACTTCAATCCCATGATGACCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGCGTCCACGAGAGCCTCTACTTCAATCCCATGATGACCAATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTGTGCACGCCAATGTGTTCGGCATCAAGGACTGGGTGACGCCGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTTGTGCACGCCAATGTGTTCGGCATCAAGGACTGGGTGACGCCGTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATCGCGGTGCTGGTGCTGCTGAACGAGATGAGCCGCACAGGCGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATCGCGGTGCTGGTGCTGCTGAACGAGATGAGCCGCACAGGCGAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGTCAGCCTCATGGAGCGGCGGAGGCTCAACCAGCTGCTCCTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGTCAGCCTCATGGAGCGGCGGAGGCTCAACCAGCTGCTCCTGCCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCAG         GGCCCAGATATTACACTGTCAAAACTTTACAAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCAGGTG...CAGGGCCCAGATATTACACTGTCAAAACTTTACAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAATTGAAGAGTCTTGTCCACAGCTGGCAAATTCAGTGCAGATCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104494 TAATTGAAGAGTCTTGTCCACAGCTGGCAAATTCAGTGCAGATCAGGTA.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    288      AATCAAACTGATGGCTGAAGGCGAGTTGAAGGATATGGAACAGTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104544 ..CAGAATCAAACTGATGGCTGAAGGCGAGTTGAAGGATATGGAACAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTTGATGACCTTTCAGATTCTTTCTCTGGAACTGAACCAGAGGTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105381 TTTTGATGACCTTTCAGATTCTTTCTCTGGAACTGAACCAGAGGTTCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAACAAGTGTAGTAG         GTTTGTTTCTGCGTCACATGATCTTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105431 AAACAAGTGTAGTAGGTA...TAGGTTTGTTTCTGCGTCACATGATCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCTACAGTAAGCTTTCTTTCAGCCAAGTGTTCAAACTGTACACTGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 106336 GCCTACAGTAAGCTTTCTTTCAGCCAAGTGTTTAAACTGTACACTGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCAGCAGTACTTCCAGAATGGTGAGAAAAAGACAGTGGAGGATGCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106386 TCAGCAGTACTTCCAGAATGGTGAGAAAAAGACAGTGGAGGATGCTGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGAACTGACCAGTAGAGATGAGGGTGAAAGAAAAATGGAAAAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106436 TGGAACTGACCAGTAGAGATGAGGGTGAAAGAAAAATGGAAAAAGAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTTGATGTATCTGTAAG         AGAAGAGGAGGTATCTTGCAGTGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106486 CTTGATGTATCTGTAAGGTA...CAGAGAAGAGGAGGTATCTTGCAGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCCTCTGTCCCAAAAACAAGCAGAATTTTTTCTTTCTCAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110296 GCCTCTGTCCCAAAAACAAGCAGAATTTTTTCTTTCTCAACAGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    658   GCTTCTTTGCTAAAGAATGATGAGACTAAGGCCCTCACTCCAGCTTCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114947 AGGCTTCTTTGCTAAAGAATGATGAGACTAAGGCCCTCACTCCAGCTTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTGCAGAAGGAATTAAACAATTTGTTGAAATTTAATCCTGATTTTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114997 TTGCAGAAGGAATTAAACAATTTGTTGAAATTTAATCCTGATTTTGCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCG         CATTATCTCAGCTACTTAAACAACCTCCGTGTCCAAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115047 AGCGGTA...TAGCATTATCTCAGCTACTTAAACAACCTCCGTGTCCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATGTTTTCAGTTCAACACACAGTCTCCTCCATTATTTTGATCGTCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116655 ATGTTTTCAGTTCAACACACAGTCTCCTCCATTATTTTGATCGTCTGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTTACCGGAGCCGAAAGCAAAAGTAATGGGGAAGAGGGCTATGGCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116705 CTTACCGGAGCCGAAAGCAAAAGTAATGGGGAAGAGGGCTATGGCCGGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTTGAGATACGCCGCTCTGAATCTTGCCGCCCTGCACTGCCGCTTCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116755 CTTGAGATACGCCGCTCTGAATCTTGCCGCCCTGCACTGCCGCTTCGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACTA         TCAACAGGCAGAGCTCGCCCTGCAGGAGGCAATTAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116805 ACTAGTA...TAGTCAACAGGCAGAGCTCGCCCTGCAGGAGGCAATTAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATTGCCCAGGAGTCCAACGATCACGTGTGTCTCCAGCACTGTTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120950 ATTGCCCAGGAGTCCAACGATCACGTGTGTCTCCAGCACTGTTTGGTG..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033     AGCTGGCTTTATGTGCTGGGGCAGAAGAGATCCGATAGCTATGTTC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121000 .CAGAGCTGGCTTTATGTGCTGGGGCAGAAGAGATCCGATAGCTATGTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGCTGGAGCATTCTGTGAAGAAGGCAGTACATTTTGGGTTACCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 121715 TGCTGGAGCATTCTGTGAAGAAGGCAGTACATTTTGGGTTACCGGTA...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1123    TACCTCGCCTCCCTGGGAATACAGTCCCTTGTTCAACAGAGAGCTTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123841 TAGTACCTCGCCTCCCTGGGAATACAGTCCCTTGTTCAACAGAGAGCTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGCTGGGAAGACGGCAAACAAGCTGATGGATGCCCTAAAGGACTCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123891 TGCTGGGAAGACGGCAAACAAGCTGATGGATGCCCTAAAGGACTCCGACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCCTGCACTGGAAACACAGCCTGTCAGAGCTCATCGATATCAGCATCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123941 TCCTGCACTGGAAACACAGCCTGTCAGAGCTCATCGATATCAGCATCGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CAGAAAACGGCCATCTGGAGGCTGTATGGCCGCAG         CACCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123991 CAGAAAACGGCCATCTGGAGGCTGTATGGCCGCAGGTA...CAGCACCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGCACTGCAACAGGCCCAGATGTTGCTGAGCATGAACAGCCTGGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125116 GGCACTGCAACAGGCCCAGATGTTGCTGAGCATGAACAGCCTGGAGGCGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGAATGCGGGCGTGCAGCAGAACAACACAGAGTCCTTTGCTGTCGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125166 TGAATGCGGGCGTGCAGCAGAACAACACAGAGTCCTTTGCTGTCGCACTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TGCCACCTCGCAGAGCTACACGCGGAGCAG         GGCTGTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 125216 TGCCACCTCGCAGAGCTACACGCGGAGCAGGTA...TAGGGCTGTTTTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGCAGCTTCTGAAGTGTTAAAGCACTTGAAGGAACGATTTCCGCCTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131893 TGCAGCTTCTGAAGTGTTAAAGCACTTGAAGGAACGATTTCCGCCTAATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GTCAGCACGCCCAG         TTATGGATGCTATGTGATCAAAAAATA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 131943 GTCAGCACGCCCAGGTA...TAGTTATGGATGCTATGTGATCAAAAAATA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CAGTTTGACAGAGCAATGAATGATGGCAAATATCATTTGGCTGATTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132550 CAGTTTGACAGAGCAATGAATGATGGCAAATATCATTTGGCTGATTCACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGTTACAGGAATCACAGCTCTCAATAGCATAGAGGGTGTTTATAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 132600 TGTTACAGGAATCACAGCTCTCAATAGCATAGAGGGTGTTTATAGGTA..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638     GAAAGCGGTTGTATTACAAGCTCAGAACCAAATGTCAGAGGCACAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132650 .CAGGAAAGCGGTTGTATTACAAGCTCAGAACCAAATGTCAGAGGCACAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AAGCTTTTACAAAAATTGTTGGTTCATTGTCAGAAACTGAAGAACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133779 AAGCTTTTACAAAAATTGTTGGTTCATTGTCAGAAACTGAAGAACACAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AATGGTGATCAG         TGTCCTACTGTCCGTGGCAGAGCTGTACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 133829 AATGGTGATCAGGTA...CAGTGTCCTACTGTCCGTGGCAGAGCTGTACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GGCGATCTTCCTCCCCTACCATCGCGCTGCCCATGCTCCTGCAGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133946 GGCGATCTTCCTCCCCTACCATCGCGCTGCCCATGCTCCTGCAGGCTCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GCCCTCTCCAAGGAGTACCGGTTACAGTACTTGGCCTCTGAAACAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133996 GCCCTCTCCAAGGAGTACCGGTTACAGTACTTGGCCTCTGAAACAGTGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GAACTTGGCTTTTGCGCAG         CTCATTCTTGGAATCCCAGAAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 134046 GAACTTGGCTTTTGCGCAGGTA...CAGCTCATTCTTGGAATCCCAGAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 AGGCCTTAAGTCTTCTCCACATGGCCATCGAGCCCATCTTGGCTGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142500 AGGCCTTAAGTCTTCTCCACATGGCCATCGAGCCCATCTTGGCTGACGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GCTATCCTGGACAAAGGTCGTGCCATGTTCTTAGTGGCCAAGTGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142550 GCTATCCTGGACAAAGGTCGTGCCATGTTCTTAGTGGCCAAGTGCCAGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GGCTTCAGCAGCTTCCTACGATCAGCCGAAGAAAGCAGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 142600 GGCTTCAGCAGCTTCCTACGATCAGCCGAAGAAAGCAGAAGGTA...CAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CTCTGGAGGCTGCCATCGAGAACCTCAATGAAGCCAAGAACTATTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143650 CTCTGGAGGCTGCCATCGAGAACCTCAATGAAGCCAAGAACTATTTTGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 AAGGTTGACTGCAAAGAGCGCATCAGGGACGTCGTTTACTTCCAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143700 AAGGTTGACTGCAAAGAGCGCATCAGGGACGTCGTTTACTTCCAGGCCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 ACTCTACCATACCCTGGGGAAGACCCAGGAGAGGAACCGGTGTGCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143750 ACTCTACCATACCCTGGGGAAGACCCAGGAGAGGAACCGGTGTGCGATGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TCTTCCGGCAGCTGCATCAGGAGCTGCCCTCTCATGGGGTACCCTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143800 TCTTCCGGCAGCTGCATCAGGAGCTGCCCTCTCATGGGGTACCCTTGATA

   2400     .
   2257 AACCATCTC
        |||||||||
 143850 AACCATCTC