seq1 = pF1KE3623.tfa, 444 bp
seq2 = pF1KE3623/gi568815591f_45057829.tfa (gi568815591f:45057829_45283409), 225581 bp

>pF1KE3623 444
>gi568815591f:45057829_45283409 (Chr7)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-191  (119481-119613)   100% ->
192-444  (125329-125581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACTGGAGCGCTGCGGCGCCCGCAACTTCTCCCGTTGCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACTGGAGCGCTGCGGCGCCCGCAACTTCTCCCGTTGCTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTGCG         GTGGGTGTCCCAGAGCAGGCGGCTGCAACGAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTGCGGTA...CAGGTGGGTGTCCCAGAGCAGGCGGCTGCAACGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGGCATGTTGGAGAGGCTGCCCCTGTGTGGGAAGGCTTTCGCAGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119514 CAGGCATGTTGGAGAGGCTGCCCCTGTGTGGGAAGGCTTTCGCAGACATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGGCAAGGTGGACGTCTGGAAGTGGTGCAACCTGTCCGAGTTCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119564 ATGGGCAAGGTGGACGTCTGGAAGTGGTGCAACCTGTCCGAGTTCATCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          GTACTATGAGAGTTTCACCAACTGCACCGAGATGGAGGCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119614 GTG...CAGGTACTATGAGAGTTTCACCAACTGCACCGAGATGGAGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTCGTGGGCTGCTACTGGCCCAACCCCCTGGCCCAGGGCTTCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125370 ATGTCGTGGGCTGCTACTGGCCCAACCCCCTGGCCCAGGGCTTCATCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCATCCACAGGCAGTTCTTCTCCAACTGCACCGTGGACAGGGTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125420 GGCATCCACAGGCAGTTCTTCTCCAACTGCACCGTGGACAGGGTCCACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGGACCCCCCAGACGAGGTTCTCATCCCGCTGATCGTTATACCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125470 GGAGGACCCCCCAGACGAGGTTCTCATCCCGCTGATCGTTATACCCGTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCTGACTGTCGCCATGGCTGGCCTGGTGGTGTGGCGCAGCAAACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125520 TTCTGACTGTCGCCATGGCTGGCCTGGTGGTGTGGCGCAGCAAACGCACC

    450     .    :
    433 GACACGCTGCTG
        ||||||||||||
 125570 GACACGCTGCTG