seq1 = pF1KE3601.tfa, 537 bp
seq2 = pF1KE3601/gi568815578f_45712696.tfa (gi568815578f:45712696_45916764), 204069 bp

>pF1KE3601 537
>gi568815578f:45712696_45916764 (Chr20)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-129  (100742-100769)   100% ->
130-216  (101689-101775)   100% ->
217-421  (102846-103050)   100% ->
422-481  (103159-103218)   100% ->
482-537  (104014-104069)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCCAAAACCGCGACCCAGCCGCCACTAGCGTCGCCGCCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCCAAAACCGCGACCCAGCCGCCACTAGCGTCGCCGCCGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAAGGAGCTGAGCCGAGCGGGGGCGCCGCCCGGGGTCCGGTGGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAAGGAGCTGAGCCGAGCGGGGGCGCCGCCCGGGGTCCGGTGGGCAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         GCTACAGCAGGAGCTGATGACCCTCATG         ATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 GGTG...CAGGCTACAGCAGGAGCTGATGACCCTCATGGTG...CAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCTGGCGATAAAGGGATTTCTGCCTTCCCTGAATCAGACAACCTTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101692 TCTGGCGATAAAGGGATTTCTGCCTTCCCTGAATCAGACAACCTTTTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATGGGTAGGGACCATCCATGGAGCAGCTGGAACA         GTATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101742 ATGGGTAGGGACCATCCATGGAGCAGCTGGAACAGTA...CAGGTATATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAGACCTGAGGTATAAGCTCTCGCTAGAGTTCCCCAGTGGCTACCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102853 AAGACCTGAGGTATAAGCTCTCGCTAGAGTTCCCCAGTGGCTACCCTTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AATGCGCCCACAGTGAAGTTCCTCACGCCCTGCTATCACCCCAACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102903 AATGCGCCCACAGTGAAGTTCCTCACGCCCTGCTATCACCCCAACGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACCCAGGGTAACATATGCCTGGACATCCTGAAGGAAAAGTGGTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102953 CACCCAGGGTAACATATGCCTGGACATCCTGAAGGAAAAGTGGTCTGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGTATGATGTCAGGACCATTCTGCTCTCCATCCAGAGCCTTCTAGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103003 TGTATGATGTCAGGACCATTCTGCTCTCCATCCAGAGCCTTCTAGGAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    422        AACCCAACATTGATAGTCCCTTGAACACACATGCTGCCGAGCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103053 G...CAGAACCCAACATTGATAGTCCCTTGAACACACATGCTGCCGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGGAAAAACCCCACAG         CTTTTAAGAAGTACCTGCAAGAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103202 CTGGAAAAACCCCACAGGTG...CAGCTTTTAAGAAGTACCTGCAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :
    506 CCTACTCAAAGCAGGTCACCAGCCAGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 104038 CCTACTCAAAGCAGGTCACCAGCCAGGAGCCC