seq1 = pF1KE3582.tfa, 1674 bp
seq2 = pF1KE3582/gi568815579f_34265267.tfa (gi568815579f:34265267_34500033), 234767 bp

>pF1KE3582 1674
>gi568815579f:34265267_34500033 (Chr19)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-213  (101079-101169)   100% ->
214-282  (101517-101585)   100% ->
283-402  (103317-103436)   100% ->
403-486  (112237-112320)   100% ->
487-633  (112469-112615)   100% ->
634-705  (113668-113739)   100% ->
706-750  (114252-114296)   100% ->
751-804  (116200-116253)   100% ->
805-865  (127982-128042)   100% ->
866-909  (128462-128505)   100% ->
910-1062  (128648-128800)   100% ->
1063-1192  (131035-131164)   100% ->
1193-1269  (131315-131391)   100% ->
1270-1398  (133941-134069)   100% ->
1399-1474  (134290-134365)   100% ->
1475-1541  (134453-134519)   100% ->
1542-1674  (134635-134767)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCTCTCACCCGGGACCCCCAGTTCCAGAAGCTGCAGCAATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCTCTCACCCGGGACCCCCAGTTCCAGAAGCTGCAGCAATGGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGAGCACCGCTCCGAGCTGAACCTGCGCCGCCTCTTCGATGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCGAGCACCGCTCCGAGCTGAACCTGCGCCGCCTCTTCGATGCCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACCGCTTCAACCACTTCAG         CTTGACCCTCAACACCAAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 AGGACCGCTTCAACCACTTCAGGTG...CAGCTTGACCCTCAACACCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATGGGCATATCCTGGTGGATTACTCCAAGAACCTGGTGACGGAGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 CATGGGCATATCCTGGTGGATTACTCCAAGAACCTGGTGACGGAGGACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATGCGGATGCTGGTGGACTTG         GCCAAGTCCAGGGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101148 GATGCGGATGCTGGTGGACTTGGTA...TAGGCCAAGTCCAGGGGCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGCCGCCCGGGAGCGGATGTTCAATGGTGAGAAGATCAACTACACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101536 AGGCCGCCCGGGAGCGGATGTTCAATGGTGAGAAGATCAACTACACCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283          GGTCGAGCCGTGCTGCACGTGGCTCTGCGGAACCGGTCAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101586 GTG...CAGGGTCGAGCCGTGCTGCACGTGGCTCTGCGGAACCGGTCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACACCCATCCTGGTAGACGGCAAGGATGTGATGCCAGAGGTCAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103358 CACACCCATCCTGGTAGACGGCAAGGATGTGATGCCAGAGGTCAACAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCTGGACAAGATGAAGTCTTTCTGCCAG         CGTGTCCGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103408 TTCTGGACAAGATGAAGTCTTTCTGCCAGGTA...CAGCGTGTCCGGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGTGACTGGAAGGGGTACACAGGCAAGACCATCACGGACGTCATCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112249 GGTGACTGGAAGGGGTACACAGGCAAGACCATCACGGACGTCATCAACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGCATTGGCGGCTCCGACCTG         GGACCCCTCATGGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112299 TGGCATTGGCGGCTCCGACCTGGTG...CAGGGACCCCTCATGGTGACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AAGCCCTTAAGCCATACTCTTCAGGAGGTCCCCGCGTCTGGTATGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112488 AAGCCCTTAAGCCATACTCTTCAGGAGGTCCCCGCGTCTGGTATGTCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACATTGATGGAACTCACATTGCCAAAACCCTGGCCCAGCTGAACCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112538 AACATTGATGGAACTCACATTGCCAAAACCCTGGCCCAGCTGAACCCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTCCTCCCTGTTCATCATTGCCTCCAAG         ACCTTTACTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 112588 GTCCTCCCTGTTCATCATTGCCTCCAAGGTA...CAGACCTTTACTACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGGAGACCATCACGAATGCAGAGACGGCGAAGGAGTGGTTTCTCCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113681 AGGAGACCATCACGAATGCAGAGACGGCGAAGGAGTGGTTTCTCCAGGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCAAGGAT         CCTTCTGCAGTGGCGAAGCACTTTGTTGCCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 113731 GCCAAGGATGTG...TAGCCTTCTGCAGTGGCGAAGCACTTTGTTGCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GTCTACTAACACA         ACCAAAGTGAAGGAGTTTGGAATTGACC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114284 GTCTACTAACACAGTA...TAGACCAAAGTGAAGGAGTTTGGAATTGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTCAAAACATGTTCGAGTTCTGGGAT         TGGGTGGGAGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 116228 CTCAAAACATGTTCGAGTTCTGGGATGTA...TAGTGGGTGGGAGGACGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGACTCTCCATTGCCCTGCACGTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 127997 TACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGACTCTCCATTGCCCTGCACGTGGGTG.

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    866      GTTTTGACAACTTCGAGCAGCTGCTCTCGGGGGCTCACTGGATG 
        ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128047 ..CAGGTTTTGACAACTTCGAGCAGCTGCTCTCGGGGGCTCACTGGATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    910         GACCAGCACTTCCGCACGACGCCCCTGGAGAAGAACGCCCCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128507 TG...CAGGACCAGCACTTCCGCACGACGCCCCTGGAGAAGAACGCCCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 GTCTTGCTGGCCCTGCTGGGTATCTGGTACATCAACTGCTTTGGGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128690 GTCTTGCTGGCCCTGCTGGGTATCTGGTACATCAACTGCTTTGGGTGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GACACACGCCATGCTGCCCTATGACCAGTACCTGCACCGCTTTGCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128740 GACACACGCCATGCTGCCCTATGACCAGTACCTGCACCGCTTTGCTGCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 ACTTCCAGCAG         GGCGACATGGAGTCCAATGGGAAATACATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 128790 ACTTCCAGCAGGTA...CAGGGCGACATGGAGTCCAATGGGAAATACATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 ACCAAATCTGGAACCCGTGTGGACCACCAGACAGGCCCCATTGTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131065 ACCAAATCTGGAACCCGTGTGGACCACCAGACAGGCCCCATTGTGTGGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGAGCCAGGGACCAATGGCCAGCATGCTTTTTACCAGCTCATCCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131115 GGAGCCAGGGACCAATGGCCAGCATGCTTTTTACCAGCTCATCCACCAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193          GCACCAAGATGATACCCTGTGACTTCCTCATCCCGGTCCAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131165 GTA...CAGGCACCAAGATGATACCCTGTGACTTCCTCATCCCGGTCCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 ACCCAGCACCCCATACGGAAGGGTCTGCATCACAAG         ATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 131356 ACCCAGCACCCCATACGGAAGGGTCTGCATCACAAGGTA...CAGATCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 CCTGGCCAACTTCTTGGCCCAGACAGAGGCCCTGATGAGGGGAAAATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133946 CCTGGCCAACTTCTTGGCCCAGACAGAGGCCCTGATGAGGGGAAAATCGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 CGGAGGAGGCCCGAAAGGAGCTCCAGGCTGCGGGCAAGAGTCCAGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133996 CGGAGGAGGCCCGAAAGGAGCTCCAGGCTGCGGGCAAGAGTCCAGAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 CTTGAGAGGCTGCTGCCACATAAG         GTCTTTGAAGGAAATCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 134046 CTTGAGAGGCTGCTGCCACATAAGGTC...CAGGTCTTTGAAGGAAATCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CCCAACCAACTCTATTGTGTTCACCAAGCTCACACCATTCATGCTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134307 CCCAACCAACTCTATTGTGTTCACCAAGCTCACACCATTCATGCTTGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 CCTTGGTCG         CCATGTATGAGCACAAGATCTTCGTTCAGGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 134357 CCTTGGTCGGTG...CAGCCATGTATGAGCACAAGATCTTCGTTCAGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 ATCATCTGGGACATCAACAGCTTTGACCAGTGGGG         AGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 134485 ATCATCTGGGACATCAACAGCTTTGACCAGTGGGGGTG...CAGAGTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 GCTGGGAAAGCAGCTGGCTAAGAAAATAGAGCCTGAGCTTGATGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134641 GCTGGGAAAGCAGCTGGCTAAGAAAATAGAGCCTGAGCTTGATGGCAGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 CTCAAGTGACCTCTCACGACGCTTCTACCAATGGGCTCATCAACTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134691 CTCAAGTGACCTCTCACGACGCTTCTACCAATGGGCTCATCAACTTCATC

   1800     .    :    .    :    .
   1648 AAGCAGCAGCGCGAGGCCAGAGTCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||
 134741 AAGCAGCAGCGCGAGGCCAGAGTCCAA