seq1 = pF1KE3393.tfa, 3564 bp
seq2 = pF1KE3393/gi568815584f_58201578.tfa (gi568815584f:58201578_58471986), 270409 bp

>pF1KE3393 3564
>gi568815584f:58201578_58471986 (Chr14)

1-117  (99998-100113)   97% ->
118-183  (103367-103432)   100% ->
184-274  (104445-104535)   100% ->
275-354  (116965-117044)   100% ->
355-449  (117134-117228)   100% ->
450-582  (121908-122040)   100% ->
583-662  (126660-126739)   100% ->
663-739  (127951-128027)   100% ->
740-906  (128426-128592)   100% ->
907-979  (143118-143190)   100% ->
980-1074  (144834-144928)   100% ->
1075-1172  (145443-145540)   100% ->
1173-1404  (146070-146301)   100% ->
1405-1655  (149496-149746)   100% ->
1656-1853  (152081-152278)   100% ->
1854-1938  (157555-157639)   100% ->
1939-2080  (159324-159465)   100% ->
2081-3211  (162593-163723)   100% ->
3212-3316  (163941-164045)   100% ->
3317-3463  (165306-165452)   100% ->
3464-3564  (170309-170409)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGCGGCAGATGAGCCTGCCTACCTGACAGTGGGAACCGATGTCAG
        |  |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 ACCA GGCGGCAGATGAGCCTGCCTACCTGACAGTGGGAACCGATGTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCAAGTACCGAGGTGCCTTCTGTGAGGCAAAGATTAAGACTGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 TGCCAAGTACCGAGGTGCCTTCTGTGAGGCAAAGATTAAGACTGTGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTGGTGAAAGTTAAG         GTACTCCTGAAACAGGATAATACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100097 GGCTGGTGAAAGTTAAGGTA...CAGGTACTCCTGAAACAGGATAATACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACACAATTGGTACAAGATGACCAAGTAAAGGGTCCTTTAAGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103391 ACACAATTGGTACAAGATGACCAAGTAAAGGGTCCTTTAAGAGTA...TA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GTTGGAGCTATTGTTGAAACAAGGACATCTGATGGATCTTTTCAGGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104444 GGTTGGAGCTATTGTTGAAACAAGGACATCTGATGGATCTTTTCAGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTATTATCAGCAAGTTGACAGATGCTAGTTGGTATACCGTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104494 CTATTATCAGCAAGTTGACAGATGCTAGTTGGTATACCGTGGGTA...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    275  TGTTTGATGATGGTGATGAGCGAACATTGAGACGTACCTCACTTTGTCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116964 GTGTTTGATGATGGTGATGAGCGAACATTGAGACGTACCTCACTTTGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAAGGAGAGAGACATTTTGCAGAGAGTGAG         ACACTTGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 117014 GAAAGGAGAGAGACATTTTGCAGAGAGTGAGGTA...CAGACACTTGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGCTTCCATTAACAAATCCAGAGCATTTTGGAACTCCAGTAATTGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117144 AGCTTCCATTAACAAATCCAGAGCATTTTGGAACTCCAGTAATTGCAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGACGAACAGAGGAAGGAGATCTTCTCTTCCTGT         TACTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 117194 AAGACGAACAGAGGAAGGAGATCTTCTCTTCCTGTGTG...TAGTACTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGATGAAAAGGAAGAAGAAAGCAGTGAAGAGGAAGATGAAGACAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121914 AGATGAAAAGGAAGAAGAAAGCAGTGAAGAGGAAGATGAAGACAAGCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTCTCAATGATGAATTACTAGGAAAAGTTGTAAGTGTGGTGTCTGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121964 GTCTCAATGATGAATTACTAGGAAAAGTTGTAAGTGTGGTGTCTGCAACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGAGGACTGAATGGTATCCTGCTTTG         GTAATATCTCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 122014 GAGAGGACTGAATGGTATCCTGCTTTGGTA...CAGGTAATATCTCCCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTGTAATGATGACATCACAGTGAAAAAGGATCAGTGTTTAGTTCGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126674 CTGTAATGATGACATCACAGTGAAAAAGGATCAGTGTTTAGTTCGATCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTATTGATTCTAAATT         TTACTCTATAGCAAGAAAGGACATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 126724 TTATTGATTCTAAATTGTG...TAGTTACTCTATAGCAAGAAAGGACATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AAGGAAGTAGACATTCTCAATCTACCGGAATCTGAGCTCTCCACTAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127976 AAGGAAGTAGACATTCTCAATCTACCGGAATCTGAGCTCTCCACTAAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AG         GGCTTCAGAAAGCAAGCATCTTCTTAAAAACTAGAGTTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128026 AGGTA...TAGGGCTTCAGAAAGCAAGCATCTTCTTAAAAACTAGAGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTCCTGATAATTGGAAAATGGATATAAGTGAAATCCTTGAGTCATCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128465 TTCCTGATAATTGGAAAATGGATATAAGTGAAATCCTTGAGTCATCCAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGTGATGATGAAGATGGCCCAGCTGAAGAAAATGATGAAGAGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128515 AGTGATGATGAAGATGGCCCAGCTGAAGAAAATGATGAAGAGAAGGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGAGGCCAAAAAGACAGAAGAAGAGGTG         CCTGAGGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 128565 GGAGGCCAAAAAGACAGAAGAAGAGGTGGTA...CAGCCTGAGGAAGAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTGATCCTGAAGAGAGGGACAACTTCCTCCAGCAGCTTTATAAGTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143131 TTGATCCTGAAGAGAGGGACAACTTCCTCCAGCAGCTTTATAAGTTTATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAAGACAGAG         GTACTCCAATCAACAAACCACCTGTTTTGGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 143181 GAAGACAGAGGTA...AAGGTACTCCAATCAACAAACCACCTGTTTTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CTATAAAGATCTCAATCTCTTCAAACTCTTCAGACTGGTTTATCATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144865 CTATAAAGATCTCAATCTCTTCAAACTCTTCAGACTGGTTTATCATCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GTGGATGTGACAAT         ATTGATAGTGGTGCTGTATGGAAGCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 144915 GTGGATGTGACAATGTA...CAGATTGATAGTGGTGCTGTATGGAAGCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ATTTATATGGACCTTGGCATTCCTATTTTGAATTCAGCTGCTTCCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145470 ATTTATATGGACCTTGGCATTCCTATTTTGAATTCAGCTGCTTCCTACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TGTAAAAACTGCTTATAGAAA         GTATCTCTATGGTTTTGAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 145520 TGTAAAAACTGCTTATAGAAAGTA...TAGGTATCTCTATGGTTTTGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AGTACTGCCGTTCGGCAAATATTCAGTTCAGAACTGTTCATCACCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146090 AGTACTGCCGTTCGGCAAATATTCAGTTCAGAACTGTTCATCACCATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CCAAAAGTAAAAGAGGAAAAAAAAGACTTAGAAGAATCAATGGAAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146140 CCAAAAGTAAAAGAGGAAAAAAAAGACTTAGAAGAATCAATGGAAGAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TCTCAAATTAGATCAAGAAATGCCTTTAACAGAAGTGAAGAGTGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146190 TCTCAAATTAGATCAAGAAATGCCTTTAACAGAAGTGAAGAGTGAACCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGGAAAATATCGATTCAAACAGTGAAAGTGAAAGAGAAGAGATAGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146240 AGGAAAATATCGATTCAAACAGTGAAAGTGAAAGAGAAGAGATAGAATTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AAATCTCCGAGG         GGACGAAGGAGAATTGCTCGAGATGTAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 146290 AAATCTCCGAGGGTG...TAGGGACGAAGGAGAATTGCTCGAGATGTAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TTCTATTAAAAAGGAAATTGAAGAAGAGAAAACAGAAGACAAATTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149525 TTCTATTAAAAAGGAAATTGAAGAAGAGAAAACAGAAGACAAATTAAAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ATAATGATACAGAAAATAAGGATGTAGATGATGACTATGAAACTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149575 ATAATGATACAGAAAATAAGGATGTAGATGATGACTATGAAACTGCAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAAAAAGAAAATGAGCTACTACTGGGGAGAAAAAATACACCAAAGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149625 AAAAAAGAAAATGAGCTACTACTGGGGAGAAAAAATACACCAAAGCAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 AGAGAAGAAAATTAAAAAACAGGAGGATTCTGACAAAGACTCAGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149675 AGAGAAGAAAATTAAAAAACAGGAGGATTCTGACAAAGACTCAGATGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AGGAAGAGAAAAGCCAAGAGAG         GGAAGAAACTGAAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 149725 AGGAAGAGAAAAGCCAAGAGAGGTA...CAGGGAAGAAACTGAAAGCAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TGTGACTCTGAAGGAGAGGAAGATGAGGAAGACATGGAACCCTGCCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152100 TGTGACTCTGAAGGAGAGGAAGATGAGGAAGACATGGAACCCTGCCTAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 AGGAACCAAAGTGAAAGTAAAATATGGACGAGGGAAGACTCAGAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152150 AGGAACCAAAGTGAAAGTAAAATATGGACGAGGGAAGACTCAGAAAATTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ATGAAGCCAGTATTAAAAGCACTGAAATTGATGACGGAGAAGTTTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152200 ATGAAGCCAGTATTAAAAGCACTGAAATTGATGACGGAGAAGTTTTATAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TTGGTACATTACTATGGATGGAATGTCAG         GTATGATGAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 152250 TTGGTACATTACTATGGATGGAATGTCAGGTA...AAGGTATGATGAGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GGTGAAGGCTGACAGGATAATCTGGCCTTTGGACAAAGGTGGACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157567 GGTGAAGGCTGACAGGATAATCTGGCCTTTGGACAAAGGTGGACCAAAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 AAAAACAGAAGAAAAAAGCTAAA         AATAAAGAAGATAGTGAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 157617 AAAAACAGAAGAAAAAAGCTAAAGTA...CAGAATAAAGAAGATAGTGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 AAGGACGAAAAGAGAGATGAGGAGAGGCAGAAGTCAAAACGGGGACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159342 AAGGACGAAAAGAGAGATGAGGAGAGGCAGAAGTCAAAACGGGGACGACC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TCCTTTAAAATCAACCCTCTCATCAAACATGCCGTATGGCTTATCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159392 TCCTTTAAAATCAACCCTCTCATCAAACATGCCGTATGGCTTATCTAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CAGCAAACAGTGAAGGAAAATCAG         ACTCTTGTTCATCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 159442 CAGCAAACAGTGAAGGAAAATCAGGTA...CAGACTCTTGTTCATCTGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 AGTGAAACAGAAGATGCTTTAGAAAAGAATTTAATAAATGAAGAACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162610 AGTGAAACAGAAGATGCTTTAGAAAAGAATTTAATAAATGAAGAACTTTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TCTTAAAGATGAACTAGAAAAAAATGAAAATTTGAATGATGATAAGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162660 TCTTAAAGATGAACTAGAAAAAAATGAAAATTTGAATGATGATAAGCTAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ATGAAGAAAATCCAAAGATTTCTGCACATATATTAAAAGAAAATGATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162710 ATGAAGAAAATCCAAAGATTTCTGCACATATATTAAAAGAAAATGATAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 ACTCAAATGCAGCCTTTAGAAACCCTGAAGTTAGAAGTTGGAGAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162760 ACTCAAATGCAGCCTTTAGAAACCCTGAAGTTAGAAGTTGGAGAGAATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 ACAAATAGTACAGATTTTTGGGAACAAAATGGAAAAAACAGAAGAAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162810 ACAAATAGTACAGATTTTTGGGAACAAAATGGAAAAAACAGAAGAAGTTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AGAAAGAAGCCGAAAAATCTCCAAAAGGAAAGGGAAGACGAAGCAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162860 AGAAAGAAGCCGAAAAATCTCCAAAAGGAAAGGGAAGACGAAGCAAGACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 AAAGATCTTTCTTTAGAAATTATAAAGATTTCATCATTTGGCCAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162910 AAAGATCTTTCTTTAGAAATTATAAAGATTTCATCATTTGGCCAGAATGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 AGCAGGAAGTGAACCTCATATAGAAGCTCATAGTCTTGAATTGTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162960 AGCAGGAAGTGAACCTCATATAGAAGCTCATAGTCTTGAATTGTCTTCAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TAGACAATAAAAACTTTTCTTCTGCTACAGAAGATGAAATTGACCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163010 TAGACAATAAAAACTTTTCTTCTGCTACAGAAGATGAAATTGACCAATGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GTGAAAGAAAAGAAGTTGAAACGGAAAATACTAGGACAATCATCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163060 GTGAAAGAAAAGAAGTTGAAACGGAAAATACTAGGACAATCATCGCCAGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 GAAAAAAATAAGAATTGAGAATGGAATGGAAATGACAAATACTGTATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163110 GAAAAAAATAAGAATTGAGAATGGAATGGAAATGACAAATACTGTATCTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 AAGAAAGGACCAGTGATTGTATTGGATCTGAGGGAATGAAAAACTTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163160 AAGAAAGGACCAGTGATTGTATTGGATCTGAGGGAATGAAAAACTTAAAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 TTTGAACAGCACTTTGAAAGAGAAAATGAAGGAATGCCATCATTGATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163210 TTTGAACAGCACTTTGAAAGAGAAAATGAAGGAATGCCATCATTGATAGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 AGAGTCAAACCAATGCATCCAACAACTGACTAGTGAAAGATTTGATAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163260 AGAGTCAAACCAATGCATCCAACAACTGACTAGTGAAAGATTTGATAGTC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 CAGCTGAAGAAACTGTAAATATTCCACTAAAAGAAGATGAGGATGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163310 CAGCTGAAGAAACTGTAAATATTCCACTAAAAGAAGATGAGGATGCAATG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 CCTCTGATCGGGCCTGAAACCTTGGTTTGCCATGAAGTAGATTTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163360 CCTCTGATCGGGCCTGAAACCTTGGTTTGCCATGAAGTAGATTTGGATGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 TTTGGATGAAAAGGATAAGACCAGCATTGAGGATGTAGCAGTTGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163410 TTTGGATGAAAAGGATAAGACCAGCATTGAGGATGTAGCAGTTGAAAGCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 CTGAGTCTAACTCTCTTGTTTCTATTCCACCTGCCCTACCTCCTGTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163460 CTGAGTCTAACTCTCTTGTTTCTATTCCACCTGCCCTACCTCCTGTAGTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 CAACATAACTTTTCAGTAGCTTCACCACTTACTCTTAGTCAAGATGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163510 CAACATAACTTTTCAGTAGCTTCACCACTTACTCTTAGTCAAGATGAGTC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 TCGAAGCGTAAAAAGTGAGAGTGATATAACGATTGAAGTTGATAGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163560 TCGAAGCGTAAAAAGTGAGAGTGATATAACGATTGAAGTTGATAGTATTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 CTGAAGAATCTCAAGAAGGTCTCTGTGAGAGGGAATCGGCAAATGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163610 CTGAAGAATCTCAAGAAGGTCTCTGTGAGAGGGAATCGGCAAATGGATTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 GAAACTAATGTTGCCTCTGGTACCTGTAGTATAATTGTACAAGAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163660 GAAACTAATGTTGCCTCTGGTACCTGTAGTATAATTGTACAAGAGAGAGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 GAGCAGAGAGAAGG         GTCAGAAGAGGCCAAGTGATGGAAATA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 163710 GAGCAGAGAGAAGGGTA...CAGGTCAGAAGAGGCCAAGTGATGGAAATA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 GTGGATTAATGGCAAAAAAGCAAAAGCGTACCCCAAAGCGAACAAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163968 GTGGATTAATGGCAAAAAAGCAAAAGCGTACCCCAAAGCGAACAAGTGCT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 GCAGCCAAAAATGAAAAGAATGGAACAG         ATGAATTAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 164018 GCAGCCAAAAATGAAAAGAATGGAACAGGTT...TAGATGAATTAGATAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 TATGAACAGTACAGAGAGAATCTCATTTCTCCAAGAAAAACTACAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165319 TATGAACAGTACAGAGAGAATCTCATTTCTCCAAGAAAAACTACAGGAAA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 TCAGAAAATATTATATGTCTTTGAAGTCTGAAGTTGCAACCATAGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165369 TCAGAAAATATTATATGTCTTTGAAGTCTGAAGTTGCAACCATAGACAGG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 AGGAGAAAAAGATTAAAAAAGAAAGACAGGGAAG         TGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 165419 AGGAGAAAAAGATTAAAAAAGAAAGACAGGGAAGGTA...CAGTGTCTCA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3471 TGCGGGAGCCTCCATGTCATCTGCTTCATCAGACACTGGAATGAGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170316 TGCGGGAGCCTCCATGTCATCTGCTTCATCAGACACTGGAATGAGTCCCT

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :
   3521 CATCATCATCTCCCCCACAAAATGTACTTGCTGTAGAATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170366 CATCATCATCTCCCCCACAAAATGTACTTGCTGTAGAATGCAGG