seq1 = pF1KE3390.tfa, 3612 bp
seq2 = pF1KE3390/gi568815588f_103867746.tfa (gi568815588f:103867746_104125717), 257972 bp

>pF1KE3390 3612
>gi568815588f:103867746_104125717 (Chr10)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-315  (122930-123094)   100% ->
316-364  (124853-124901)   100% ->
365-514  (125239-125388)   100% ->
515-587  (131154-131226)   100% ->
588-782  (131374-131568)   100% ->
783-864  (132122-132203)   100% ->
865-993  (133699-133827)   100% ->
994-2349  (134427-135782)   100% ->
2350-2480  (137816-137946)   100% ->
2481-2604  (138167-138290)   100% ->
2605-2784  (140432-140611)   100% ->
2785-2914  (150415-150544)   100% ->
2915-3039  (151039-151163)   100% ->
3040-3228  (151989-152177)   100% ->
3229-3354  (152743-152868)   100% ->
3355-3468  (153875-153988)   100% ->
3469-3612  (157829-157972)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTTCTTCAATTTCCGTAAGATCTTCAAGTTGGGGAGCGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTTCTTCAATTTCCGTAAGATCTTCAAGTTGGGGAGCGAGAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGAAGCAGTACGAACACGTGAAGAGGGACCTGAACCCCGAAGACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGAAGCAGTACGAACACGTGAAGAGGGACCTGAACCCCGAAGACTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAGATTATAGGAGAACTGGGCGACGGAGCCTTTGGGAAAGTGTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGAGATTATAGGAGAACTGGGCGACGGAGCCTTTGGGAAAGTGTACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          GCCCAGAATAAAGAGACCAGTGTTTTAGCTGCTGCAAAAGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTA...CAGGCCCAGAATAAAGAGACCAGTGTTTTAGCTGCTGCAAAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATTGACACTAAATCTGAAGAAGAACTTGAAGATTACATGGTAGAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122971 GATTGACACTAAATCTGAAGAAGAACTTGAAGATTACATGGTAGAGATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATATTAGCATCTTGTGATCACCCAAATATAGTCAAGCTTCTAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123021 ACATATTAGCATCTTGTGATCACCCAAATATAGTCAAGCTTCTAGATGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCTATTATGAGAACAATCTTTGG         ATCCTCATTGAATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 123071 TTCTATTATGAGAACAATCTTTGGGTA...CAGATCCTCATTGAATTTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCAGGTGGAGCAGTAGATGCTGTGATGCTTG         AACTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 124870 TGCAGGTGGAGCAGTAGATGCTGTGATGCTTGGTA...TAGAACTTGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GACCATTAACTGAGTCCCAAATACAAGTAGTTTGCAAGCAGACTTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125248 GACCATTAACTGAGTCCCAAATACAAGTAGTTTGCAAGCAGACTTTAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCATTGAACTACTTACATGATAATAAGATCATCCACAGAGATCTGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125298 GCATTGAACTACTTACATGATAATAAGATCATCCACAGAGATCTGAAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGCAACATTCTCTTTACCTTAGATGGAGATATCAAATTGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 125348 TGGCAACATTCTCTTTACCTTAGATGGAGATATCAAATTGGGTA...AAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGGATTTTGGAGTATCAGCTAAAAACACGAGGACAATTCAAAGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131154 CGGATTTTGGAGTATCAGCTAAAAACACGAGGACAATTCAAAGAAGAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCCTTTATTGGTACACCATATTG         GATGGCTCCTGAAGTAGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 131204 TCCTTTATTGGTACACCATATTGGTA...TAGGATGGCTCCTGAAGTAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CATGTGTGAAACATCTAAGGACAGACCCTATGACTACAAAGCTGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131392 CATGTGTGAAACATCTAAGGACAGACCCTATGACTACAAAGCTGATGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGTCCCTGGGTATCACTTTAATAGAAATGGCTGAGATAGAACCACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131442 GGTCCCTGGGTATCACTTTAATAGAAATGGCTGAGATAGAACCACCTCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CATGAATTAAATCCAATGCGAGTGCTGCTAAAAATAGCAAAATCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131492 CATGAATTAAATCCAATGCGAGTGCTGCTAAAAATAGCAAAATCTGAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACCTACATTAGCACAGCCATCCAGATG         GTCTTCAAATTTTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 131542 ACCTACATTAGCACAGCCATCCAGATGGTA...AAGGTCTTCAAATTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGACTTTCTAAAGAAATGCTTAGAAAAGAATGTGGATGCCAGGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132136 AGGACTTTCTAAAGAAATGCTTAGAAAAGAATGTGGATGCCAGGTGGACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACATCTCAGCTGCTGCAG         CATCCCTTTGTTACTGTTGATTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 132186 ACATCTCAGCTGCTGCAGGTA...CAGCATCCCTTTGTTACTGTTGATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAACAAACCCATCCGAGAATTGATTGCAGAGGCGAAGGCTGAAGTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133722 CAACAAACCCATCCGAGAATTGATTGCAGAGGCGAAGGCTGAAGTAACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGAAGTTGAAGATGGCAAAGAGGAAGATGAAGAGGAGGAAACAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133772 AAGAAGTTGAAGATGGCAAAGAGGAAGATGAAGAGGAGGAAACAGAAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCTCTG         CCAATACCTGCAAGTAAGCGTGCATCTTCTGACCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133822 TCTCTGGTC...TAGCCAATACCTGCAAGTAAGCGTGCATCTTCTGACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TAGTATCGCCAGCTCTGAAGAAGATAAACTTTCACAAAATGCTTGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134462 TAGTATCGCCAGCTCTGAAGAAGATAAACTTTCACAAAATGCTTGTATTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGAGTCTGTCTCAGAAAAAACAGAACGTAGTAACTCTGAAGATAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134512 TGGAGTCTGTCTCAGAAAAAACAGAACGTAGTAACTCTGAAGATAAACTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AACAGCAAAATTCTTAATGAAAAACCCACCACTGATGAACCTGAAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134562 AACAGCAAAATTCTTAATGAAAAACCCACCACTGATGAACCTGAAAAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGTGGAGGATATTAATGAACATATTACCGATGCTCAGTTAGAAGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134612 TGTGGAGGATATTAATGAACATATTACCGATGCTCAGTTAGAAGCAATGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTGAACTCCATGACAGAACAGCAGTAATCAAGGAGAATGAAAGAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134662 CTGAACTCCATGACAGAACAGCAGTAATCAAGGAGAATGAAAGAGAGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AGGCCCAAGCTTGAAAATCTGCCTGACACAGAAGACCAAGAAACTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134712 AGGCCCAAGCTTGAAAATCTGCCTGACACAGAAGACCAAGAAACTGTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CATTAATTCAGTCAGTGAAGGAAAAGAGAATAATATAATGATAACCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134762 CATTAATTCAGTCAGTGAAGGAAAAGAGAATAATATAATGATAACCTTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAACAAATATTGAACATAATCTAAAATCTGAGGAAGAAAAGGATCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134812 AAACAAATATTGAACATAATCTAAAATCTGAGGAAGAAAAGGATCAGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AAGCAACAGATGTTTGAAAATAAGCTTATAAAATCTGAAGAAATTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134862 AAGCAACAGATGTTTGAAAATAAGCTTATAAAATCTGAAGAAATTAAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TACTATTTTGCAAACAGTAGATTTAGTTTCTCAAGAGACTGGAGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134912 TACTATTTTGCAAACAGTAGATTTAGTTTCTCAAGAGACTGGAGAAAAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AGGCAAATATTCAGGCAGTTGATAGTGAAGTTGGGCTTACAAAGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134962 AGGCAAATATTCAGGCAGTTGATAGTGAAGTTGGGCTTACAAAGGAAGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 ACCCAAGAGAAATTGGGGGAAGACGACAAAACTCAAAAAGATGTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135012 ACCCAAGAGAAATTGGGGGAAGACGACAAAACTCAAAAAGATGTGATCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CAATACAAGTGATGTGATAGGAACATGTGAGGCAGCAGATGTGGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135062 CAATACAAGTGATGTGATAGGAACATGTGAGGCAGCAGATGTGGCTCAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AAGTGGATGAAGACAGTGCTGAGGATACGCAGAGTAATGATGGGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135112 AAGTGGATGAAGACAGTGCTGAGGATACGCAGAGTAATGATGGGAAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GTGGTCGAAGTAGGCCAGAAATTAATTAATAAGCCCATGGTGGGTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135162 GTGGTCGAAGTAGGCCAGAAATTAATTAATAAGCCCATGGTGGGTCCTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GGCTGGTGGTACTAAGGAAGTTCCTATTAAAGAAATAGTTGAAATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135212 GGCTGGTGGTACTAAGGAAGTTCCTATTAAAGAAATAGTTGAAATGAATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AAATAGAAGAAGGTAAAAATAAGGAACAAGCAATAAACAGTTCAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135262 AAATAGAAGAAGGTAAAAATAAGGAACAAGCAATAAACAGTTCAGAGAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 ATAATGGACATCAATGAGGAACCAGGAACAACTGAAGGTGAAGAAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135312 ATAATGGACATCAATGAGGAACCAGGAACAACTGAAGGTGAAGAAATCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 TGAGTCAAGTAGCACTGAAGAAATGGAGGTCAGAAGTGTGGTGGCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135362 TGAGTCAAGTAGCACTGAAGAAATGGAGGTCAGAAGTGTGGTGGCTGATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 CTGACCAAAAGGCTTTAGGAAGTGAAGTTCAGGATGCTTCTAAAGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135412 CTGACCAAAAGGCTTTAGGAAGTGAAGTTCAGGATGCTTCTAAAGTCACT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 ACTCAGATAGATAAAGAGAAAAAAGAAATTCCAGTGTCAATTAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135462 ACTCAGATAGATAAAGAGAAAAAAGAAATTCCAGTGTCAATTAAAAAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 GCCTGAAGTTACTGTAGTTTCACAGCCCACTGAACCTCAGCCTGTTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135512 GCCTGAAGTTACTGTAGTTTCACAGCCCACTGAACCTCAGCCTGTTCTAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 TACCCAGTATTAATATCAACTCTGACAGTGGAGAAAATAAAGAAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135562 TACCCAGTATTAATATCAACTCTGACAGTGGAGAAAATAAAGAAGAAATA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 GGTTCTTTATCAAAAACTGAAACTATTCTGCCACCAGAATCTGAGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135612 GGTTCTTTATCAAAAACTGAAACTATTCTGCCACCAGAATCTGAGAATCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 AAAGGAAAATGATAATGATTCAGGCACTGGTTCCACTGCTGATACTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135662 AAAGGAAAATGATAATGATTCAGGCACTGGTTCCACTGCTGATACTAGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 GTATTGACTTGAATTTATCCATCTCTAGCTTTCTAAGTAAAACTAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135712 GTATTGACTTGAATTTATCCATCTCTAGCTTTCTAAGTAAAACTAAAGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 AGTGGATCGATATCTTTACAA         GAAACAAGAAGACAAAAGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 135762 AGTGGATCGATATCTTTACAAGTA...CAGGAAACAAGAAGACAAAAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 AACATTGAAGAAAACACGCAAATTTATTGTTGATGGTGTAGAAGTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137836 AACATTGAAGAAAACACGCAAATTTATTGTTGATGGTGTAGAAGTGAGTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 TAACAACATCAAAGATAGTTACAGATAGTGATTCCAAAACTGAAGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137886 TAACAACATCAAAGATAGTTACAGATAGTGATTCCAAAACTGAAGAATTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 CGGTTTCTTAG         ACGTCAGGAACTTCGGGAATTAAGATTTCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 137936 CGGTTTCTTAGGTG...CAGACGTCAGGAACTTCGGGAATTAAGATTTCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 TCAGAAAGAAGAGCAAAGAGCCCAACAACAGCTCAATAGCAAACTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138197 TCAGAAAGAAGAGCAAAGAGCCCAACAACAGCTCAATAGCAAACTACAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2561 AACAACGAGAACAAATTTTCCGGCGCTTTGAGCAGGAAATGATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 138247 AACAACGAGAACAAATTTTCCGGCGCTTTGAGCAGGAAATGATGGTA...

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2605    AGTAAAAAGCGACAATATGACCAGGAAATTGAGAATCTAGAAAAACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140429 CAGAGTAAAAAGCGACAATATGACCAGGAAATTGAGAATCTAGAAAAACA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 GCAGAAACAGACTATCGAACGCCTGGAACAAGAGCACACAAATCGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140479 GCAGAAACAGACTATCGAACGCCTGGAACAAGAGCACACAAATCGCTTGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 GAGATGAAGCCAAACGCATCAAAGGAGAACAAGAGAAAGAGTTGTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140529 GAGATGAAGCCAAACGCATCAAAGGAGAACAAGAGAAAGAGTTGTCCAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 TTTCAGAATATGCTGAAGAACCGAAAGAAGGAG         GAACAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 140579 TTTCAGAATATGCTGAAGAACCGAAAGAAGGAGGTA...TAGGAACAAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2793 GTTTGTTCAGAAACAACAGCAAGAATTAGATGGCTCTCTGAAAAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150423 GTTTGTTCAGAAACAACAGCAAGAATTAGATGGCTCTCTGAAAAAGATCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2843 TCCAGCAGCAGAAGGCAGAGTTAGCTAATATTGAGAGAGAGTGCCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150473 TCCAGCAGCAGAAGGCAGAGTTAGCTAATATTGAGAGAGAGTGCCTGAAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2893 AACAAGCAACAGCTCATGAGAG         CTCGAGAAGCTGCAATTTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 150523 AACAAGCAACAGCTCATGAGAGGTA...TAGCTCGAGAAGCTGCAATTTG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2934 GGAGCTCGAAGAACGACACTTACAAGAAAAACACCAGCTGCTCAAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151058 GGAGCTCGAAGAACGACACTTACAAGAAAAACACCAGCTGCTCAAACAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2984 AGCTTAAAGATCAGTATTTCATGCAAAGACATCAGCTACTTAAGCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151108 AGCTTAAAGATCAGTATTTCATGCAAAGACATCAGCTACTTAAGCGCCAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3034 GAGAAG         GAAACAGAGCAAATGCAGCGTTACAATCAAAGACT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151158 GAGAAGGTT...TAGGAAACAGAGCAAATGCAGCGTTACAATCAAAGACT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3075 TATTGAGGAATTGAAAAACAGACAGACTCAAGAAAGAGCAAGACTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152024 TATTGAGGAATTGAAAAACAGACAGACTCAAGAAAGAGCAAGACTGCCCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3125 AGATTCAGCGCAGTGAAGCCAAGACTCGAATGGCCATGTTTAAGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152074 AGATTCAGCGCAGTGAAGCCAAGACTCGAATGGCCATGTTTAAGAAGAGT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3175 TTGAGAATTAACTCAACAGCCACACCAGATCAGGACCGTGATAAAATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152124 TTGAGAATTAACTCAACAGCCACACCAGATCAGGACCGTGATAAAATTAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3225 ACAG         TTTGCTGCACAAGAAGAAAAGAGGCAGAAAAATGAGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152174 ACAGGTA...TAGTTTGCTGCACAAGAAGAAAAGAGGCAGAAAAATGAGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3266 GAATGGCTCAGCATCAGAAACATGAGAATCAAATGCGAGATCTTCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152780 GAATGGCTCAGCATCAGAAACATGAGAATCAAATGCGAGATCTTCAGTTG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3316 CAGTGTGAAGCCAATGTCCGCGAACTGCATCAGCTGCAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 152830 CAGTGTGAAGCCAATGTCCGCGAACTGCATCAGCTGCAGGTC...CAGAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3357 TGAAAAATGCCACTTGTTGGTTGAGCATGAGACTCAGAAACTGAAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153877 TGAAAAATGCCACTTGTTGGTTGAGCATGAGACTCAGAAACTGAAGGAGT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3407 TAGATGAGGAACATAGCCAAGAATTAAAGGAGTGGAGAGAGAAATTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153927 TAGATGAGGAACATAGCCAAGAATTAAAGGAGTGGAGAGAGAAATTGAGA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3457 CCTAGGAAAAAG         ACACTGGAAGAAGAGTTTGCCAGGAAACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 153977 CCTAGGAAAAAGGTA...AAGACACTGGAAGAAGAGTTTGCCAGGAAACT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3498 ACAGGAACAGGAAGTATTCTTTAAAATGACTGGGGAGTCTGAATGCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157858 ACAGGAACAGGAAGTATTCTTTAAAATGACTGGGGAGTCTGAATGCCTTA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3548 ACCCATCAACACAGAGCCGGATTTCCAAATTTTATCCTATTCCCAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157908 ACCCATCAACACAGAGCCGGATTTCCAAATTTTATCCTATTCCCAGCTTG

   3750     .    :    .
   3598 CATTCCACCGGATCA
        |||||||||||||||
 157958 CATTCCACCGGATCA