Result of SIM4 for
pF1KE3378
seq1 = pF1KE3378.tfa, 3390 bp
seq2 = pF1KE3378/gi568815592r_149561732.tfa (gi568815592r:149561732_149802126), 240395 bp
>pF1KE3378 3390
>gi568815592r:149561732_149802126 (Chr6)
(complement)
1-348 (100001-100348) 100% ->
349-496 (106906-107053) 100% ->
497-2010 (117535-119048) 100% ->
2011-2593 (121670-122252) 100% ->
2594-2776 (125390-125572) 100% ->
2777-2883 (125761-125867) 100% ->
2884-3390 (139889-140395) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAGAGGAGTGAAAAGCCAGAAGGATATAGACAAATGAGGCCTAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAAGAGGAGTGAAAAGCCAGAAGGATATAGACAAATGAGGCCTAAGAC
50 . : . : . : . : . :
51 CTTTCCTGCCAGTAACTATACTGTCAGTAGCCGGCAAATGTTACAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTTTCCTGCCAGTAACTATACTGTCAGTAGCCGGCAAATGTTACAAGAAA
100 . : . : . : . : . :
101 TTCGGGAATCCCTTAGGAATTTATCTAAACCATCTGATGCTGCTAAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TTCGGGAATCCCTTAGGAATTTATCTAAACCATCTGATGCTGCTAAGGCT
150 . : . : . : . : . :
151 GAGCATAACATGAGTAAAATGTCAACCGAAGATCCTCGACAAGTCAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GAGCATAACATGAGTAAAATGTCAACCGAAGATCCTCGACAAGTCAGAAA
200 . : . : . : . : . :
201 TCCACCCAAATTTGGGACGCATCATAAAGCCTTGCAGGAAATTCGAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TCCACCCAAATTTGGGACGCATCATAAAGCCTTGCAGGAAATTCGAAACT
250 . : . : . : . : . :
251 CTCTGCTTCCATTTGCAAATGAAACAAATTCTTCTCGGAGTACTTCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 CTCTGCTTCCATTTGCAAATGAAACAAATTCTTCTCGGAGTACTTCAGAA
300 . : . : . : . : . :
301 GTTAATCCACAAATGCTTCAAGACTTGCAAGCTGCTGGATTTGATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
100301 GTTAATCCACAAATGCTTCAAGACTTGCAAGCTGCTGGATTTGATGAGGT
350 . : . : . : . : . :
349 GATATGGTTATACAAGCTCTTCAGAAAACTAACAACAGAAGTA
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 A...CAGGATATGGTTATACAAGCTCTTCAGAAAACTAACAACAGAAGTA
400 . : . : . : . : . :
392 TAGAAGCAGCAATTGAATTCATTAGTAAAATGAGTTACCAAGATCCTCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106949 TAGAAGCAGCAATTGAATTCATTAGTAAAATGAGTTACCAAGATCCTCGA
450 . : . : . : . : . :
442 CGAGAGCAGATGGCTGCAGCAGCTGCCAGACCTATTAATGCCAGCATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106999 CGAGAGCAGATGGCTGCAGCAGCTGCCAGACCTATTAATGCCAGCATGAA
500 . : . : . : . : . :
492 ACCAG GGAATGTGCAGCAATCAGTTAACCGCAAACAGAGCT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107049 ACCAGGTG...TAGGGAATGTGCAGCAATCAGTTAACCGCAAACAGAGCT
550 . : . : . : . : . :
533 GGAAAGGTTCTAAAGAATCCTTAGTTCCTCAGAGGCATGGCCCGCCACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117571 GGAAAGGTTCTAAAGAATCCTTAGTTCCTCAGAGGCATGGCCCGCCACTA
600 . : . : . : . : . :
583 GGAGAAAGTGTGGCCTATCATTCTGAGAGTCCCAACTCACAGACAGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117621 GGAGAAAGTGTGGCCTATCATTCTGAGAGTCCCAACTCACAGACAGATGT
650 . : . : . : . : . :
633 AGGAAGACCTTTGTCTGGATCTGGTATATCAGCATTTGTTCAAGCTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117671 AGGAAGACCTTTGTCTGGATCTGGTATATCAGCATTTGTTCAAGCTCACC
700 . : . : . : . : . :
683 CTAGCAACGGACAGAGAGTGAACCCCCCACCACCACCTCAAGTAAGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117721 CTAGCAACGGACAGAGAGTGAACCCCCCACCACCACCTCAAGTAAGGAGT
750 . : . : . : . : . :
733 GTTACTCCTCCACCACCTCCAAGAGGCCAGACTCCCCCTCCAAGAGGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117771 GTTACTCCTCCACCACCTCCAAGAGGCCAGACTCCCCCTCCAAGAGGTAC
800 . : . : . : . : . :
783 AACTCCACCTCCCCCTTCATGGGAACCAAACTCTCAAACAAAGCGCTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117821 AACTCCACCTCCCCCTTCATGGGAACCAAACTCTCAAACAAAGCGCTATT
850 . : . : . : . : . :
833 CTGGAAACATGGAATACGTAATCTCCCGAATCTCTCCTGTCCCACCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117871 CTGGAAACATGGAATACGTAATCTCCCGAATCTCTCCTGTCCCACCTGGG
900 . : . : . : . : . :
883 GCATGGCAAGAGGGCTATCCTCCACCACCTCTCAACACTTCCCCCATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117921 GCATGGCAAGAGGGCTATCCTCCACCACCTCTCAACACTTCCCCCATGAA
950 . : . : . : . : . :
933 TCCTCCTAATCAAGGACAGAGAGGCATTAGTTCTGTTCCTGTTGGCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117971 TCCTCCTAATCAAGGACAGAGAGGCATTAGTTCTGTTCCTGTTGGCAGAC
1000 . : . : . : . : . :
983 AACCAATCATCATGCAGAGTTCTAGCAAATTTAACTTTCCATCAGGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118021 AACCAATCATCATGCAGAGTTCTAGCAAATTTAACTTTCCATCAGGGAGA
1050 . : . : . : . : . :
1033 CCTGGAATGCAGAATGGTACTGGACAAACTGATTTCATGATACACCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118071 CCTGGAATGCAGAATGGTACTGGACAAACTGATTTCATGATACACCAAAA
1100 . : . : . : . : . :
1083 TGTTGTCCCTGCTGGCACTGTGAATCGGCAGCCACCACCTCCATATCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118121 TGTTGTCCCTGCTGGCACTGTGAATCGGCAGCCACCACCTCCATATCCTC
1150 . : . : . : . : . :
1133 TGACAGCAGCTAATGGACAAAGCCCTTCTGCTTTACAAACAGGGGGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118171 TGACAGCAGCTAATGGACAAAGCCCTTCTGCTTTACAAACAGGGGGATCT
1200 . : . : . : . : . :
1183 GCTGCTCCTTCGTCATATACAAATGGAAGTATTCCTCAGTCTATGATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118221 GCTGCTCCTTCGTCATATACAAATGGAAGTATTCCTCAGTCTATGATGGT
1250 . : . : . : . : . :
1233 GCCAAACAGAAATAGTCATAACATGGAACTATATAACATTAGTGTACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118271 GCCAAACAGAAATAGTCATAACATGGAACTATATAACATTAGTGTACCTG
1300 . : . : . : . : . :
1283 GACTGCAAACAAATTGGCCTCAGTCATCTTCTGCTCCAGCCCAGTCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118321 GACTGCAAACAAATTGGCCTCAGTCATCTTCTGCTCCAGCCCAGTCATCC
1350 . : . : . : . : . :
1333 CCGAGCAGTGGGCATGAAATCCCTACATGGCAACCTAACATACCAGTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118371 CCGAGCAGTGGGCATGAAATCCCTACATGGCAACCTAACATACCAGTGAG
1400 . : . : . : . : . :
1383 GTCAAATTCTTTTAATAACCCATTAGGAAATAGAGCAAGTCACTCTGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118421 GTCAAATTCTTTTAATAACCCATTAGGAAATAGAGCAAGTCACTCTGCTA
1450 . : . : . : . : . :
1433 ATTCTCAGCCTTCTGCTACAACAGTCACTGCAATTACACCAGCTCCTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118471 ATTCTCAGCCTTCTGCTACAACAGTCACTGCAATTACACCAGCTCCTATT
1500 . : . : . : . : . :
1483 CAACAGCCTGTGAAAAGTATGCGTGTATTAAAACCAGAGCTACAGACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118521 CAACAGCCTGTGAAAAGTATGCGTGTATTAAAACCAGAGCTACAGACTGC
1550 . : . : . : . : . :
1533 TTTAGCACCTACACACCCTTCTTGGATACCACAGCCAATTCAAACTGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118571 TTTAGCACCTACACACCCTTCTTGGATACCACAGCCAATTCAAACTGTTC
1600 . : . : . : . : . :
1583 AACCCAGTCCTTTTCCTGAGGGAACCGCTTCAAATGTGACTGTGATGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118621 AACCCAGTCCTTTTCCTGAGGGAACCGCTTCAAATGTGACTGTGATGCCA
1650 . : . : . : . : . :
1633 CCTGTTGCTGAAGCTCCAAACTATCAAGGACCACCACCACCCTACCCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118671 CCTGTTGCTGAAGCTCCAAACTATCAAGGACCACCACCACCCTACCCAAA
1700 . : . : . : . : . :
1683 ACATCTGCTGCACCAAAACCCATCTGTTCCTCCATACGAGTCAATCAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118721 ACATCTGCTGCACCAAAACCCATCTGTTCCTCCATACGAGTCAATCAGTA
1750 . : . : . : . : . :
1733 AGCCTAGCAAAGAGGATCAGCCAAGCTTGCCCAAGGAAGATGAGAGTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118771 AGCCTAGCAAAGAGGATCAGCCAAGCTTGCCCAAGGAAGATGAGAGTGAA
1800 . : . : . : . : . :
1783 AAGAGTTATGAAAATGTTGATAGTGGGGATAAAGAAAAGAAACAGATTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118821 AAGAGTTATGAAAATGTTGATAGTGGGGATAAAGAAAAGAAACAGATTAC
1850 . : . : . : . : . :
1833 AACTTCACCTATTACTGTTAGGAAAAACAAGAAAGATGAAGAGCGAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118871 AACTTCACCTATTACTGTTAGGAAAAACAAGAAAGATGAAGAGCGAAGGG
1900 . : . : . : . : . :
1883 AATCTCGTATTCAAAGTTATTCTCCTCAAGCATTTAAATTCTTTATGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118921 AATCTCGTATTCAAAGTTATTCTCCTCAAGCATTTAAATTCTTTATGGAG
1950 . : . : . : . : . :
1933 CAACATGTAGAAAATGTACTCAAATCTCATCAGCAGCGTCTACATCGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118971 CAACATGTAGAAAATGTACTCAAATCTCATCAGCAGCGTCTACATCGTAA
2000 . : . : . : . : . :
1983 AAAACAATTAGAGAATGAAATGATGCGG GTTGGATTATCTC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
119021 AAAACAATTAGAGAATGAAATGATGCGGGTA...TAGGTTGGATTATCTC
2050 . : . : . : . : . :
2024 AAGATGCCCAGGATCAAATGAGAAAGATGCTTTGCCAAAAAGAATCTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121683 AAGATGCCCAGGATCAAATGAGAAAGATGCTTTGCCAAAAAGAATCTAAT
2100 . : . : . : . : . :
2074 TACATCCGTCTTAAAAGGGCTAAAATGGACAAGTCTATGTTTGTGAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121733 TACATCCGTCTTAAAAGGGCTAAAATGGACAAGTCTATGTTTGTGAAGAT
2150 . : . : . : . : . :
2124 AAAGACACTAGGAATAGGAGCATTTGGTGAAGTCTGTCTAGCAAGAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121783 AAAGACACTAGGAATAGGAGCATTTGGTGAAGTCTGTCTAGCAAGAAAAG
2200 . : . : . : . : . :
2174 TAGATACTAAGGCTTTGTATGCAACAAAAACTCTTCGAAAGAAAGATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121833 TAGATACTAAGGCTTTGTATGCAACAAAAACTCTTCGAAAGAAAGATGTT
2250 . : . : . : . : . :
2224 CTTCTTCGAAATCAAGTCGCTCATGTTAAGGCTGAGAGAGATATCCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121883 CTTCTTCGAAATCAAGTCGCTCATGTTAAGGCTGAGAGAGATATCCTGGC
2300 . : . : . : . : . :
2274 TGAAGCTGACAATGAATGGGTAGTTCGTCTATATTATTCATTCCAAGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121933 TGAAGCTGACAATGAATGGGTAGTTCGTCTATATTATTCATTCCAAGATA
2350 . : . : . : . : . :
2324 AGGACAATTTATACTTTGTAATGGACTACATTCCTGGGGGTGATATGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121983 AGGACAATTTATACTTTGTAATGGACTACATTCCTGGGGGTGATATGATG
2400 . : . : . : . : . :
2374 AGCCTATTAATTAGAATGGGCATCTTTCCAGAAAGTCTGGCACGATTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122033 AGCCTATTAATTAGAATGGGCATCTTTCCAGAAAGTCTGGCACGATTCTA
2450 . : . : . : . : . :
2424 CATAGCAGAACTTACCTGTGCAGTTGAAAGTGTTCATAAAATGGGTTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122083 CATAGCAGAACTTACCTGTGCAGTTGAAAGTGTTCATAAAATGGGTTTTA
2500 . : . : . : . : . :
2474 TTCATAGAGATATTAAACCTGATAATATTTTGATTGATCGTGATGGTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122133 TTCATAGAGATATTAAACCTGATAATATTTTGATTGATCGTGATGGTCAT
2550 . : . : . : . : . :
2524 ATTAAATTGACTGACTTTGGCCTCTGCACTGGCTTCAGATGGACACACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122183 ATTAAATTGACTGACTTTGGCCTCTGCACTGGCTTCAGATGGACACACGA
2600 . : . : . : . : . :
2574 TTCTAAGTACTATCAGAGTG GTGACCATCCACGGCAAGATA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
122233 TTCTAAGTACTATCAGAGTGGTA...CAGGTGACCATCCACGGCAAGATA
2650 . : . : . : . : . :
2615 GCATGGATTTCAGTAATGAATGGGGGGATCCCTCAAGCTGTCGATGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125411 GCATGGATTTCAGTAATGAATGGGGGGATCCCTCAAGCTGTCGATGTGGA
2700 . : . : . : . : . :
2665 GACAGACTGAAGCCATTAGAGCGGAGAGCTGCACGCCAGCACCAGCGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125461 GACAGACTGAAGCCATTAGAGCGGAGAGCTGCACGCCAGCACCAGCGATG
2750 . : . : . : . : . :
2715 TCTAGCACATTCTTTGGTTGGGACTCCCAATTATATTGCACCTGAAGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125511 TCTAGCACATTCTTTGGTTGGGACTCCCAATTATATTGCACCTGAAGTGT
2800 . : . : . : . : . :
2765 TGCTACGAACAG GATACACACAGTTGTGTGATTGGTGGAGT
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
125561 TGCTACGAACAGGTA...TAGGATACACACAGTTGTGTGATTGGTGGAGT
2850 . : . : . : . : . :
2806 GTTGGTGTTATTCTTTTTGAAATGTTGGTGGGACAACCTCCTTTCTTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125790 GTTGGTGTTATTCTTTTTGAAATGTTGGTGGGACAACCTCCTTTCTTGGC
2900 . : . : . : . : . :
2856 ACAAACACCATTAGAAACACAAATGAAG GTTATCAACTGGC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
125840 ACAAACACCATTAGAAACACAAATGAAGGTA...AAGGTTATCAACTGGC
2950 . : . : . : . : . :
2897 AAACATCTCTTCACATTCCACCACAAGCTAAACTCAGTCCTGAAGCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139902 AAACATCTCTTCACATTCCACCACAAGCTAAACTCAGTCCTGAAGCTTCT
3000 . : . : . : . : . :
2947 GATCTTATTATTAAACTTTGCCGAGGACCCGAAGATCGCTTAGGCAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139952 GATCTTATTATTAAACTTTGCCGAGGACCCGAAGATCGCTTAGGCAAGAA
3050 . : . : . : . : . :
2997 TGGTGCTGATGAAATAAAAGCTCATCCATTTTTTAAAACAATTGACTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140002 TGGTGCTGATGAAATAAAAGCTCATCCATTTTTTAAAACAATTGACTTCT
3100 . : . : . : . : . :
3047 CCAGTGACCTGAGACAGCAGTCTGCTTCATACATTCCTAAAATCACACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140052 CCAGTGACCTGAGACAGCAGTCTGCTTCATACATTCCTAAAATCACACAC
3150 . : . : . : . : . :
3097 CCAACAGATACATCAAATTTTGATCCTGTTGATCCTGATAAATTATGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140102 CCAACAGATACATCAAATTTTGATCCTGTTGATCCTGATAAATTATGGAG
3200 . : . : . : . : . :
3147 TGATGATAACGAGGAAGAAAATGTAAATGACACTCTCAATGGATGGTATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140152 TGATGATAACGAGGAAGAAAATGTAAATGACACTCTCAATGGATGGTATA
3250 . : . : . : . : . :
3197 AAAATGGAAAGCATCCTGAACATGCATTCTATGAATTTACCTTCCGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140202 AAAATGGAAAGCATCCTGAACATGCATTCTATGAATTTACCTTCCGAAGG
3300 . : . : . : . : . :
3247 TTTTTTGATGACAATGGCTACCCATATAATTATCCGAAGCCTATTGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140252 TTTTTTGATGACAATGGCTACCCATATAATTATCCGAAGCCTATTGAATA
3350 . : . : . : . : . :
3297 TGAATACATTAATTCACAAGGCTCAGAGCAGCAGTCGGATGAAGATGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140302 TGAATACATTAATTCACAAGGCTCAGAGCAGCAGTCGGATGAAGATGATC
3400 . : . : . : . :
3347 AAAACACAGGCTCAGAGATTAAAAATCGCGATCTAGTATATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140352 AAAACACAGGCTCAGAGATTAAAAATCGCGATCTAGTATATGTT