Result of SIM4 for
pF1KE3368
seq1 = pF1KE3368.tfa, 3264 bp
seq2 = pF1KE3368/gi568815585r_20874873.tfa (gi568815585r:20874873_21146026), 271154 bp
>pF1KE3368 3264
>gi568815585r:20874873_21146026 (Chr13)
(complement)
1-342 (100001-100342) 100% ->
343-475 (154623-154755) 100% ->
476-1899 (156723-158146) 100% ->
1900-2482 (162221-162803) 100% ->
2483-2665 (164379-164561) 100% ->
2666-2772 (166230-166336) 100% ->
2773-3264 (170663-171154) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCA
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100001 ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCA
50 . : . : . : . : . :
51 GCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGGGTTAAAACAGCCATCCAAGTCTTCGG
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100051 GCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGGGTTAAAACAGCCATCCAAGTCTTCGG
100 . : . : . : . : . :
101 TTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCAAA
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100101 TTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCAAA
150 . : . : . : . : . :
151 GTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCAC
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100151 GTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCAC
200 . : . : . : . : . :
201 CCCAAAGTTCGGACCTTATCAGAAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCT
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100201 CCCAAAGTTCGGACCTTATCAGAAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCT
250 . : . : . : . : . :
251 TGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGTGAAC
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100251 TGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGTGAAC
300 . : . : . : . : . :
301 CGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
100301 CGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGTG...CA
350 . : . : . : . : . :
343 GAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGACTGGCAGCAGGAGCATCGAGG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154622 GGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGACTGGCAGCAGGAGCATCGAGG
400 . : . : . : . : . :
392 CCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAG
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154672 CCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAG
450 . : . : . : . : . :
442 CAGATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAG GAAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
154722 CAGATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGTG...CAGGAAAGGG
500 . : . : . : . : . :
483 GCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTTCGAAGGAACCGGCG
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156730 GCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTTCGAAGGAACCGGCG
550 . : . : . : . : . :
533 ATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCA
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156780 ATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCA
600 . : . : . : . : . :
583 AGCTTCGGCGCTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156830 AGCTTCGGCGCTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTA
650 . : . : . : . : . :
633 CGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCACGGGCCCGGCCACCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156880 CGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCACGGGCCCGGCCACCAGC
700 . : . : . : . : . :
683 ACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156930 ACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCA
750 . : . : . : . : . :
733 CACTTCCCGCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156980 CACTTCCCGCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCC
800 . : . : . : . : . :
783 TGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCAGCCCCTCCTTCCAGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157030 TGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCAGCCCCTCCTTCCAGAGCA
850 . : . : . : . : . :
833 AGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157080 AGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAG
900 . : . : . : . : . :
883 GGAGGACCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157130 GGAGGACCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCT
950 . : . : . : . : . :
933 CTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGCCGGTCCCGCGGCCCACCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157180 CTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGCCGGTCCCGCGGCCCACCAGC
1000 . : . : . : . : . :
983 TGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157230 TGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCG
1050 . : . : . : . : . :
1033 CAGAGCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157280 CAGAGCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGA
1100 . : . : . : . : . :
1083 ATTGGGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGGCCGGCTGCCACCCTGGCCCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157330 ATTGGGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGGCCGGCTGCCACCCTGGCCCGCC
1150 . : . : . : . : . :
1133 GGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157380 GGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTG
1200 . : . : . : . : . :
1183 GCCTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157430 GCCTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAG
1250 . : . : . : . : . :
1233 CCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTGGCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157480 CCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTGGCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCG
1300 . : . : . : . : . :
1283 CCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157530 CCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG
1350 . : . : . : . : . :
1333 AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157580 AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTC
1400 . : . : . : . : . :
1383 GCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCCTGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157630 GCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCCTGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCG
1450 . : . : . : . : . :
1433 CCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157680 CCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGCTG
1500 . : . : . : . : . :
1483 GGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157730 GGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCG
1550 . : . : . : . : . :
1533 GAGGTGCCCGCCTCCGCCCTACCCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157780 GAGGTGCCCGCCTCCGCCCTACCCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGT
1600 . : . : . : . : . :
1583 CGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157830 CGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAGCCTC
1650 . : . : . : . : . :
1633 CGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157880 CGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGC
1700 . : . : . : . : . :
1683 CAAGGGGGACAAAGGCGGAAAGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157930 CAAGGGGGACAAAGGCGGAAAGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCG
1750 . : . : . : . : . :
1733 TTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCACGCATC
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157980 TTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCACGCATC
1800 . : . : . : . : . :
1783 AAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGA
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158030 AAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGA
1850 . : . : . : . : . :
1833 GAATGTCATCAAAACCTACCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158080 GAATGTCATCAAAACCTACCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGG
1900 . : . : . : . : . :
1883 AGCAAGAAATGGCCAAA GCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAG
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158130 AGCAAGAAATGGCCAAAGTA...CAGGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAG
1950 . : . : . : . : . :
1924 GAGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTT
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162245 GAGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTT
2000 . : . : . : . : . :
1974 AAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCTATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGG
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162295 AAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCTATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGG
2050 . : . : . : . : . :
2024 GGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162345 GGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCAC
2100 . : . : . : . : . :
2074 GCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAA
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162395 GCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAA
2150 . : . : . : . : . :
2124 TCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCGAGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162445 TCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCGAGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACA
2200 . : . : . : . : . :
2174 ATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162495 ATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGCCTG
2250 . : . : . : . : . :
2224 TACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGAT
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162545 TACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGAT
2300 . : . : . : . : . :
2274 CCGGATGGAGGTCTTCCCTGAGCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162595 CCGGATGGAGGTCTTCCCTGAGCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGC
2350 . : . : . : . : . :
2324 TGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACCGAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162645 TGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACCGAGAC
2400 . : . : . : . : . :
2374 ATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162695 ATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCAC
2450 . : . : . : . : . :
2424 AGATTTCGGCCTCTGCACTGGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162745 AGATTTCGGCCTCTGCACTGGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATT
2500 . : . : . : . : . :
2474 ACCAGAAAG GGAGCCATGTCAGACAGGACAGCATGGAGCCC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
162795 ACCAGAAAGGTA...AAGGGAGCCATGTCAGACAGGACAGCATGGAGCCC
2550 . : . : . : . : . :
2515 AGCGACCTCTGGGATGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164411 AGCGACCTCTGGGATGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAA
2600 . : . : . : . : . :
2565 GACCCTAGAGCAGAGGGCGCGGAAGCAGCACCAGAGGTGCCTGGCACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164461 GACCCTAGAGCAGAGGGCGCGGAAGCAGCACCAGAGGTGCCTGGCACATT
2650 . : . : . : . : . :
2615 CACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGTGCTCCTCCGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164511 CACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGTGCTCCTCCGCAAA
2700 . : . : . : . : . :
2665 G GGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGAT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164561 GGTA...CAGGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGAT
2750 . : . : . : . : . :
2706 TCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCAGCCGCCCTTTTTGGCACCTACTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166270 TCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCAGCCGCCCTTTTTGGCACCTACTCCCA
2800 . : . : . : . : . :
2756 CAGAAACCCAGCTGAAG GTGATCAACTGGGAGAACACGCTC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
166320 CAGAAACCCAGCTGAAGGTA...CAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTC
2850 . : . : . : . : . :
2797 CACATTCCAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170687 CACATTCCAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCAC
2900 . : . : . : . : . :
2847 CAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTGGGGCGGAATGGGGCCGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170737 CAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTGGGGCGGAATGGGGCCGATG
2950 . : . : . : . : . :
2897 ACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170787 ACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATC
3000 . : . : . : . : . :
2947 CGGAAGCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170837 CGGAAGCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACAC
3050 . : . : . : . : . :
2997 CTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAAGCCCTTGGAACGATGCCAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170887 CTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAAGCCCTTGGAACGATGCCAGCG
3100 . : . : . : . : . :
3047 AAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170937 AAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCAT
3150 . : . : . : . : . :
3097 CCTGAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170987 CCTGAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAA
3200 . : . : . : . : . :
3147 TGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCCTTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171037 TGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCCTTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGG
3250 . : . : . : . : . :
3197 CTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171087 CTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGC
3300 . : .
3247 TGCCAGCCTGTGTACGTG
||||||||||||||||||
171137 TGCCAGCCTGTGTACGTG