seq1 = pF1KE3286.tfa, 2199 bp
seq2 = pF1KE3286/gi568815597r_185020022.tfa (gi568815597r:185020022_185256712), 236691 bp

>pF1KE3286 2199
>gi568815597r:185020022_185256712 (Chr1)

(complement)

1-235  (100001-100235)   100% ->
236-346  (104778-104888)   100% ->
347-460  (106221-106334)   100% ->
461-525  (109467-109531)   100% ->
526-655  (111145-111274)   100% ->
656-779  (112684-112807)   100% ->
780-859  (113277-113356)   100% ->
860-1109  (116491-116740)   100% ->
1110-1322  (117134-117346)   100% ->
1323-1513  (118917-119107)   100% ->
1514-1592  (127966-128044)   100% ->
1593-1759  (131603-131769)   100% ->
1760-1822  (132794-132856)   100% ->
1823-1949  (136204-136330)   100% ->
1950-2199  (136442-136691)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATATGGCGGAGGAGGAGCTGCTGCCCCTGGAGAAGGAGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAATATGGCGGAGGAGGAGCTGCTGCCCCTGGAGAAGGAGGAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGTGGCCCAGGTCCAGGTCCCGACCCCGGCCCGGGACTCGGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGTGGCCCAGGTCCAGGTCCCGACCCCGGCCCGGGACTCGGCTGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCAGCTCCGGCCCCGGATTCGGCTCTGGACTCGGCTCCGACTCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCAGCTCCGGCCCCGGATTCGGCTCTGGACTCGGCTCCGACTCCGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGCTCCAGCCCCAGCCCCTGCCCTGGCCCAGGCTCCGGCCCTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGGCTCCAGCCCCAGCCCCTGCCCTGGCCCAGGCTCCGGCCCTGTCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCCCTAGCCTCTGCCCCTGAGGAGGCTAAAAGCA         AGAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100201 GTCCCTAGCCTCTGCCCCTGAGGAGGCTAAAAGCAGTA...CAGAGAGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACATCTCAATTCAAAGGCAGCTTGCTGATCTAGAGAATTTAGCTTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104784 ACATCTCAATTCAAAGGCAGCTTGCTGATCTAGAGAATTTAGCTTTTGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACTGATGGAAATTTTGACTCTGCCAGCTCATTGAACTCAGATAATCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104834 ACTGATGGAAATTTTGACTCTGCCAGCTCATTGAACTCAGATAATCTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGCAG         GCAACAGACAGGCTTGTCCATTGTGCCCTAAGGAAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104884 TGCAGGTA...AAGGCAACAGACAGGCTTGTCCATTGTGCCCTAAGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AATTCAGAGCTTGTAATAGCCATAAGCTTCGTCGTCACCTCCAGAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106257 AATTCAGAGCTTGTAATAGCCATAAGCTTCGTCGTCACCTCCAGAATTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACTGGAAAGTCTCAGTTGAATTTGAAG         GTTACAGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106307 CACTGGAAAGTCTCAGTTGAATTTGAAGGTT...TAGGTTACAGGATGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCTGTCACTTACCTTGTCGACCAGTGAAACCAAACATTATTGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109480 CATCTGTCACTTACCTTGTCGACCAGTGAAACCAAACATTATTGGAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         ATAACCAGTAAAATGGGAGCCCATTATCATTGTATCATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109530 AGGTG...TAGATAACCAGTAAAATGGGAGCCCATTATCATTGTATCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGTTCAGCAACAATCACCAGAAGAACTGATATGCTAGGACATGTTAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111184 TGTTCAGCAACAATCACCAGAAGAACTGATATGCTAGGACATGTTAGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCACATGAATAAAGGAGAGACTAAATCTAGTTATATTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111234 CCACATGAATAAAGGAGAGACTAAATCTAGTTATATTGCAGGTA...TAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTTCCACTGCTAAACCACCTAAGGAAATTTTGAAAGAGGCAGACACGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112684 CTTCCACTGCTAAACCACCTAAGGAAATTTTGAAAGAGGCAGACACGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTACAAGTTTGTCCCAACTATTCTATACCTCAGAAAACAGATTCCTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112734 GTACAAGTTTGTCCCAACTATTCTATACCTCAGAAAACAGATTCCTATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TAACCCCAAAATGAAACTAAATCG         GCAGCTAATATTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112784 TAACCCCAAAATGAAACTAAATCGGTA...TAGGCAGCTAATATTCTGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CATTGGCTGCTTTGGCTGAGGAACGAAAACCTTTGGAATGTCTAGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113294 CATTGGCTGCTTTGGCTGAGGAACGAAAACCTTTGGAATGTCTAGATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTTGGAGCCACTG         GGATAATGGGATTACAGTGGGCAAAACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113344 TTTGGAGCCACTGGTA...AAGGGATAATGGGATTACAGTGGGCAAAACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCTTGGAAATGCAGTCAAAGTTACAATCAATGACTTGAATGAAAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116519 TCTTGGAAATGCAGTCAAAGTTACAATCAATGACTTGAATGAAAATTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGACACTGATTCAGGAAAACTGCCATTTAAACAAATTGAAAGTGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116569 TGACACTGATTCAGGAAAACTGCCATTTAAACAAATTGAAAGTGGTGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GACAGTAAGGAAAAGGAAAAGAGTGATGATATTCTTGAAGAAGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116619 GACAGTAAGGAAAAGGAAAAGAGTGATGATATTCTTGAAGAAGGAGAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAATCTTGGTAATATTAAGGTGACCAAAATGGATGCCAATGTACTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116669 AAATCTTGGTAATATTAAGGTGACCAAAATGGATGCCAATGTACTGATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATTTGAGATCTTTTGATTTCAT         ACATCTAGACCCTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 116719 ATTTGAGATCTTTTGATTTCATGTA...TAGACATCTAGACCCTTTTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACATCAGTGAATTATCTAGATTCTGCATTCAGAAATATAAGAAACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117153 ACATCAGTGAATTATCTAGATTCTGCATTCAGAAATATAAGAAACCTTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CATAGTGTCAGTGACTTCTACAGATATCAGTTCTTTATATGCCAAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117203 CATAGTGTCAGTGACTTCTACAGATATCAGTTCTTTATATGCCAAGGCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGCATGTTGCCCGGCGTCACTACGGATGTAACATTGTCCGAACTGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117253 AGCATGTTGCCCGGCGTCACTACGGATGTAACATTGTCCGAACTGAATAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TACAAGGAACTAGCAGCCAGAATTGTTGTAGCTGCAGTGGCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 117303 TACAAGGAACTAGCAGCCAGAATTGTTGTAGCTGCAGTGGCAAGGTA...

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1323    AGCTGCAGCCCGATGCAACAAAGGCATAGAAGTACTGTTTGCAGTGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118914 TAGAGCTGCAGCCCGATGCAACAAAGGCATAGAAGTACTGTTTGCAGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTCTGGAACATTTTGTGTTGGTAGTTGTGAGAGTTTTGAGGGGACCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118964 CTCTGGAACATTTTGTGTTGGTAGTTGTGAGAGTTTTGAGGGGACCTACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TCAGCAGATGAAACAGCCAAGAAGATTCAATACCTGATCCATTGTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119014 TCAGCAGATGAAACAGCCAAGAAGATTCAATACCTGATCCATTGTCAGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GTGTGAAGAGAGAATTTTTCAGAAGGATGGTAATATGGTAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 119064 GTGTGAAGAGAGAATTTTTCAGAAGGATGGTAATATGGTAGAAGGTA...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1514    AAAACCCATATAGACAGCTGCCTTGTAACTGTCATGGAAGCATGCCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127963 CAGAAAACCCATATAGACAGCTGCCTTGTAACTGTCATGGAAGCATGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GGAAAGACAGCAATAGAACTTGGACCTCTGTG         GTCAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128013 GGAAAGACAGCAATAGAACTTGGACCTCTGTGGTA...CAGGTCAAGTTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CCTTTTCAATACTGGATTCCTCAAAAGAATGCTATTTGAATCTCTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131612 CCTTTTCAATACTGGATTCCTCAAAAGAATGCTATTTGAATCTCTTCACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ATGGTTTGGATGACATTCAGACCCTAATAAAGACATTAATCTTTGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131662 ATGGTTTGGATGACATTCAGACCCTAATAAAGACATTAATCTTTGAATCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GAGTGTACGCCTCAAAGTCAGTTTTCAATTCATGCATCTTCAAATGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131712 GAGTGTACGCCTCAAAGTCAGTTTTCAATTCATGCATCTTCAAATGTCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CAAGCAAG         AAGAAAATGGTGTATTTATTAAAACTACAGATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 131762 CAAGCAAGGTG...TAGAAGAAAATGGTGTATTTATTAAAACTACAGATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACACCACAACAGATAATTACATTGCACAAG         GAAAGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 132827 ACACCACAACAGATAATTACATTGCACAAGGTA...CAGGAAAGAGAAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AGTAATGAAATGATCACAAATTTAGGCAAGAAGCAAAAGACTGATGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136215 AGTAATGAAATGATCACAAATTTAGGCAAGAAGCAAAAGACTGATGTCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TACTGAACATCCTCCCTTTTATTACAACATTCACAGACACAGCATTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136265 TACTGAACATCCTCCCTTTTATTACAACATTCACAGACACAGCATTAAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GAATGAATATGCCAAA         GTTAAAAAAGTTTTTGTGCTATTTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 136315 GAATGAATATGCCAAAGTA...CAGGTTAAAAAAGTTTTTGTGCTATTTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TCTCAAGCAGGCTTTCGAGTAAGCCGAACTCATTTTGACCCAATGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136467 TCTCAAGCAGGCTTTCGAGTAAGCCGAACTCATTTTGACCCAATGGGTGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 ACGCACAGATGCACCTCTGATGCAGTTTAAATCTATCCTTTTAAAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136517 ACGCACAGATGCACCTCTGATGCAGTTTAAATCTATCCTTTTAAAGTACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GCACCCCCACCTACACTGGAGGACAGTCAGAAAGCCATGTCCAGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136567 GCACCCCCACCTACACTGGAGGACAGTCAGAAAGCCATGTCCAGTCAGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 TCTGAAGATACAGTAACTGAAAGAGTTGAAATGTCAGTGAATGACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136617 TCTGAAGATACAGTAACTGAAAGAGTTGAAATGTCAGTGAATGACAAAGC

   2300     .    :    .    :    .
   2175 AGAAGCAAGTGGCTGCAGAAGATGG
        |||||||||||||||||||||||||
 136667 AGAAGCAAGTGGCTGCAGAAGATGG