seq1 = pF1KE3270.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KE3270/gi568815579r_38310043.tfa (gi568815579r:38310043_38522155), 212113 bp

>pF1KE3270 2019
>gi568815579r:38310043_38522155 (Chr19)

(complement)

1-23  (96065-96087)   100% ->
24-208  (100003-100187)   100% ->
209-316  (100956-101063)   100% ->
317-377  (101188-101248)   100% ->
378-509  (101894-102025)   100% ->
510-663  (102143-102296)   100% ->
664-837  (103592-103765)   100% ->
838-954  (104988-105104)   100% ->
955-1230  (107033-107308)   99% ->
1231-1311  (108682-108762)   100% ->
1312-1416  (108859-108963)   100% ->
1417-1535  (109107-109225)   100% ->
1536-1680  (109340-109484)   100% ->
1681-1717  (110775-110811)   100% ->
1718-1852  (110907-111041)   100% ->
1853-1965  (111158-111270)   100% ->
1966-2019  (112060-112113)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACAGAAAAGACAGTAAGAG         GAAGTCCCACCAGGAATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  96065 ATGAACAGAAAAGACAGTAAGAGGTG...CAGGAAGTCCCACCAGGAATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCGGAAAAATAGGAGGGCGAGGCCGGCCCCGCCAAGTGCGCCGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 CACCGGAAAAATAGGAGGGCGAGGCCGGCCCCGCCAAGTGCGCCGCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGACATGCCCCAGCCCTCGGGAAATCAGCAAGGTCATGGCTTCCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100071 AGACATGCCCCAGCCCTCGGGAAATCAGCAAGGTCATGGCTTCCATGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGGCCTGCTGAGTGAGGGCGGCTGCAGCGAAGATGAGCTGCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100121 CTGGGCCTGCTGAGTGAGGGCGGCTGCAGCGAAGATGAGCTGCTGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATGCATCCAGTCCTTCG         ATTCAGCTGGCAGCCTGTGCCACG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100171 ATGCATCCAGTCCTTCGGTA...CAGATTCAGCTGGCAGCCTGTGCCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGACCACATGCTCAACATGGTGCTGGCCATGCACAGCTGGGTGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100980 AGGACCACATGCTCAACATGGTGCTGGCCATGCACAGCTGGGTGCTGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCGCCGACCTGGCTGCCCGCCTGCTGACCTCAT         ACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101030 TCCGCCGACCTGGCTGCCCGCCTGCTGACCTCATATC...AATACCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCCACAGGGGACACCCAGGAGCTGAGACGGCTGCAGATCTGTCACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101195 GGCCACAGGGGACACCCAGGAGCTGAGACGGCTGCAGATCTGTCACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAG         GTACTGGCTGATGCGACACCCTGAGGTGATGCACCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101245 TCAGGTA...CAGGTACTGGCTGATGCGACACCCTGAGGTGATGCACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATCCCCAGCTAGAAGAAGTCATAGGTCGTTTCTGGGCCACCGTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101931 GATCCCCAGCTAGAAGAAGTCATAGGTCGTTTCTGGGCCACCGTGGCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGAGGGCAACTCAGCCCAGAGAAGACTGGGAGACTCTTCTGACCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101981 GGAGGGCAACTCAGCCCAGAGAAGACTGGGAGACTCTTCTGACCTGTG..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    510     CCTGAGCCCTGGTGGCCCTGGCCCCCCACTCCCAATGAGCAGCCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102031 .CAGCCTGAGCCCTGGTGGCCCTGGCCCCCCACTCCCAATGAGCAGCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGCCTGGGCAAAAAGCGCAAAGTGTCCTTGCTTTTCGACCACTTGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102189 GGCCTGGGCAAAAAGCGCAAAGTGTCCTTGCTTTTCGACCACTTGGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGGGGAGCTGGCTCAGCACCTCACCTACCTGGAGTTCCGGTCCTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102239 GGGGGAGCTGGCTCAGCACCTCACCTACCTGGAGTTCCGGTCCTTCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTATCACG         CCCCAGGACCTGCGGAGCTACGTTTTGCAGGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102289 CTATCACGGTG...CAGCCCCAGGACCTGCGGAGCTACGTTTTGCAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCAGTACGAGGCTGCCCGGCCCTGGAGGGCTCCGTAGGTCTCAGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103625 TCAGTACGAGGCTGCCCGGCCCTGGAGGGCTCCGTAGGTCTCAGCAACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CGTGTCCCGCTGGGTGCAGGTGATGGTGCTGAGCCGTCCCGGGCCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103675 CGTGTCCCGCTGGGTGCAGGTGATGGTGCTGAGCCGTCCCGGGCCCCTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCGTGCACAGGTGCTGGACAAGTTCATTCACGTGGCACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103725 AGCGTGCACAGGTGCTGGACAAGTTCATTCACGTGGCACAGGTG...TAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGGCTCCACCAGCTGCAGAATTTCAACACGCTGATGGCAGTCACAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104988 AGGCTCCACCAGCTGCAGAATTTCAACACGCTGATGGCAGTCACAGGGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTGTGTCACAGTGCCATCTCCAGACTCAAGGACTCCCATGCCCACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105038 CCTGTGTCACAGTGCCATCTCCAGACTCAAGGACTCCCATGCCCACCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCCCTGACAGCACCAAG         GCCCTCCTGGAGCTCACTGAGCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105088 GCCCTGACAGCACCAAGGTG...CAGGCCCTCCTGGAGCTCACTGAGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTTGCCTCCCACAACAACTACGCCCGCTACCGCCGCACCTGGGCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107057 CTTGCCTCCCACAACAACTACGCCCGCTACCGCCGCACCTGGGCTGGCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CGCGGGCTTCCGGCTGCCTGTACTGGGCGTGCACCTCAAGGACCTGGTGT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107107 CGCGGGTTTCCGGCTGCCTGTACTGGGCGTGCACCTCAAGGACCTGGTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCCTGCATGAGGCACAGCCCGACAGGTTGCCTGACGGCCGCCTGCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107157 CCCTGCATGAGGCACAGCCCGACAGGTTGCCTGACGGCCGCCTGCACCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCCAAGCTGAACAACCTCTACCTGCGGCTGCAGGAGCTGGTGGCCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107207 CCCAAGCTGAACAACCTCTACCTGCGGCTGCAGGAGCTGGTGGCCCTCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGGGCAGCATCCACCCTGCAGCGCCAATGAGGATCTGCTGCACCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107257 AGGGCAGCATCCACCCTGCAGCGCCAATGAGGATCTGCTGCACCTGCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CG         CTCTCCCTGGACCTCTTCTACACGGAAGACGAGATCTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107307 CGGTG...CAGCTCTCCCTGGACCTCTTCTACACGGAAGACGAGATCTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GAGCTTTCTTATGCCCGGGAGCCGCGTTGTCCCAAGAGCCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 108721 GAGCTTTCTTATGCCCGGGAGCCGCGTTGTCCCAAGAGCCTGGTG...CA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1312  CCACCCTCCCCCTTCAATGCACCTCTGGTGGTGGAGTGGGCCCCTGGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108858 GCCACCCTCCCCCTTCAATGCACCTCTGGTGGTGGAGTGGGCCCCTGGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGACACCCAAGCCGGACAGGGTCACACTGGGTCGGCATGTGGAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108908 TGACACCCAAGCCGGACAGGGTCACACTGGGTCGGCATGTGGAGCAGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTGGAG         TCTGTGTTCAAGAATTATGACCCTGAAGGCCGAGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108958 GTGGAGGTA...AAGTCTGTGTTCAAGAATTATGACCCTGAAGGCCGAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AACAATCTCTCAGGAGGACTTTGAGCGACTCTCGGGCAATTTTCCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109142 AACAATCTCTCAGGAGGACTTTGAGCGACTCTCGGGCAATTTTCCCTTCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCTGCCATGGGCTTCACCCACCCCCACGCCAGGG         GAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109192 CCTGCCATGGGCTTCACCCACCCCCACGCCAGGGGTA...CAGGAGAGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TCCTTCAGCAGAGAGGAGCTGACAGGGTACCTGCTCCGGGCCAGCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109347 TCCTTCAGCAGAGAGGAGCTGACAGGGTACCTGCTCCGGGCCAGCGCCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CTGCTCCAAGTTGGGCCTGGCCTTCCTGCACACCTTCCATGAGGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109397 CTGCTCCAAGTTGGGCCTGGCCTTCCTGCACACCTTCCATGAGGTCACCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TCCGAAAGCCTACCTTCTGCGACAGCTGCAGTGGCTTC         CTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 109447 TCCGAAAGCCTACCTTCTGCGACAGCTGCAGTGGCTTCGTG...CAGCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TGGGGTGTCACCAAGCAAGGCTACCGCTGTCGGG         AGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110778 TGGGGTGTCACCAAGCAAGGCTACCGCTGTCGGGGTG...CAGAGTGCGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GCTGTGTTGCCACAAACACTGCAGAGACCAGGTGAAGGTAGAATGTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110914 GCTGTGTTGCCACAAACACTGCAGAGACCAGGTGAAGGTAGAATGTAAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AGAGGCCAGGGGCCAAGGGCGATGCAGGACCCCCCGGAGCTCCTGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110964 AGAGGCCAGGGGCCAAGGGCGATGCAGGACCCCCCGGAGCTCCTGTCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TCCACACCAGCTCCCCATGCCAGCTGTG         GCTCCGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111014 TCCACACCAGCTCCCCATGCCAGCTGTGGTA...CAGGCTCCGAGGAAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TCACTCCTACACGCTATCCCTGGAGCCTGAGACTGGGTGCCAGCTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111171 TCACTCCTACACGCTATCCCTGGAGCCTGAGACTGGGTGCCAGCTTCGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATGCCTGGACCCAGACTGAATCCCCACACCCTTCCTGGGAAACAGATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111221 ATGCCTGGACCCAGACTGAATCCCCACACCCTTCCTGGGAAACAGATACG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966          GTCCCCTGCCCGGTGATGGACCCACCATCAACTGCATCCTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111271 GTG...CAGGTCCCCTGCCCGGTGATGGACCCACCATCAACTGCATCCTC

   2150     .    :
   2007 CAAGCTGGATTCC
        |||||||||||||
 112101 CAAGCTGGATTCC