seq1 = pF1KE3219.tfa, 1485 bp
seq2 = pF1KE3219/gi568815579r_56089830.tfa (gi568815579r:56089830_56293052), 203223 bp

>pF1KE3219 1485
>gi568815579r:56089830_56293052 (Chr19)

(complement)

1-384  (100001-100384)   100% ->
385-588  (101000-101203)   100% ->
589-739  (102066-102216)   99% ->
740-1485  (102478-103223)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAAATTGGACACTCTCATGGGGTCAGGGAGGACCCTGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAAATTGGACACTCTCATGGGGTCAGGGAGGACCCTGCAACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTGGGTCAGACACTCCACGGTCTGTGGCGTCCCCAGAAACTCAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTGGGTCAGACACTCCACGGTCTGTGGCGTCCCCAGAAACTCAACTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAATCACGACAGGAACCCTGAGACTTGGCACATGAATTTCAGGATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAATCACGACAGGAACCCTGAGACTTGGCACATGAATTTCAGGATGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTGCCCAGAGGAGTCGGACCCCATCCAGGCTCTGAGGAAACTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTGCCCAGAGGAGTCGGACCCCATCCAGGCTCTGAGGAAACTCACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGTGCCATCTGTGGCTGAGGCCCGACCTCCACACCAAAGAGCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGTGCCATCTGTGGCTGAGGCCCGACCTCCACACCAAAGAGCAGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACATGCTGGTGATGGAGCAGTTCATGATCTCCATGCCCCAGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACATGCTGGTGATGGAGCAGTTCATGATCTCCATGCCCCAGGAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGTCTTAGTCAAGGTGAACGGTGTGCAGAGCTGCAAAGACCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGTCTTAGTCAAGGTGAACGGTGTGCAGAGCTGCAAAGACCTGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGCTACGAAATAACAGAAGACCCAAGAAATGG         TCTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100351 CCTGCTACGAAATAACAGAAGACCCAAGAAATGGGTG...CAGTCTATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCAACTTGCTCGGCAAAGAATATCTTATGCTGAACTCAGATGTCGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101007 TCAACTTGCTCGGCAAAGAATATCTTATGCTGAACTCAGATGTCGAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCTGAAGCCCCCGCCAGTGTCAGAGATGATCCGAGAGACGTGTCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101057 GCTGAAGCCCCCGCCAGTGTCAGAGATGATCCGAGAGACGTGTCCAGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTGGGCCTCCTCTGTGAACCAGATGCATCCGGGGACAGGCCAGGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101107 GTGGGCCTCCTCTGTGAACCAGATGCATCCGGGGACAGGCCAGGCCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GAGAGCAGCAGATCCTGCCCAGGGTCGCTGCACTGTCCAGGAGGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101157 GAGAGCAGCAGATCCTGCCCAGGGTCGCTGCACTGTCCAGGAGGCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    589       GGAGAGGACTTTCTGCTACACAAGAGTATTGACATAACAGGTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 101207 ...CAGGGAGAGGACTTTCTGCTACACAAGAGTATTGACGTAACAGGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCCAAACTCTCCGAGACCCAAGCAGACCTTGGAGAAGGATCTGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102110 CCCAAACTCTCCGAGACCCAAGCAGACCTTGGAGAAGGATCTGAAGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACAGGGAAGAGAACCCAGGACTGTCATCCCCAGAGCCTCAGCTTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102160 ACAGGGAAGAGAACCCAGGACTGTCATCCCCAGAGCCTCAGCTTCCAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGTCCCA         ATCTGGTGAGAGCAAAGGAGGGGAAGGAACCCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102210 AGTCCCAGTG...CAGATCTGGTGAGAGCAAAGGAGGGGAAGGAACCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAAAAGAGCCTCTGTGGAAAATGTGGATGCTGACACACCTTCTGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102512 GAAAAGAGCCTCTGTGGAAAATGTGGATGCTGACACACCTTCTGCCTGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TTGTGGAGAGAGAAGCTTTGACTCACAGCGGGAACAGAGGAGATGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102562 TTGTGGAGAGAGAAGCTTTGACTCACAGCGGGAACAGAGGAGATGCTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AATCTGAGCAGTCCCAAAAGAAGCAAACCAGATGCCTCCTCCATTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102612 AATCTGAGCAGTCCCAAAAGAAGCAAACCAGATGCCTCCTCCATTTCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AGAAGAGCCTCAAGGAGAAGCCACACCTGTGGGCAACAGAGAATCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102662 AGAAGAGCCTCAAGGAGAAGCCACACCTGTGGGCAACAGAGAATCCCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GACAAGCTGAGATCAATCCAGTTCATTCCCCAGGCCCTGCGGGCCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102712 GACAAGCTGAGATCAATCCAGTTCATTCCCCAGGCCCTGCGGGCCCGGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGTCACCCAGATGGCCAAGAAGCCAAGGCCCTGCCACCCTTTGCATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 102762 AGTCACCCAGATGGCCAAGAAGCCAAGGCCCTGCCGCCCTTTGCATGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CGTGTGCAATAAATCATTTAAGTATTTTTCCCAGCTAAGCATCCACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102812 CGTGTGCAATAAATCATTTAAGTATTTTTCCCAGCTAAGCATCCACAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GGTCACACACAGGAGACAGACCCTTTCAATGTGATCTCTGTCGGAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102862 GGTCACACACAGGAGACAGACCCTTTCAATGTGATCTCTGTCGGAAGCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TTCTTGCAGCCCTCAGACCTCCGAGTTCACCAGCGAGTCCACACTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102912 TTCTTGCAGCCCTCAGACCTCCGAGTTCACCAGCGAGTCCACACTGGCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GAGGCCCTACATGTGTGACGTCTGCCAAAAGCGGTTCGCCCACGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102962 GAGGCCCTACATGTGTGACGTCTGCCAAAAGCGGTTCGCCCACGAGTCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCTTACAGGGCCACAAGAGGATCCACACCGGGGAGAGGCCGTTTAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103012 CCTTACAGGGCCACAAGAGGATCCACACCGGGGAGAGGCCGTTTAAATGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AAATACTGCAGCAAAGTTTTCAGCCACAAGGGGAACCTGAACGTTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103062 AAATACTGCAGCAAAGTTTTCAGCCACAAGGGGAACCTGAACGTTCACCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GCGCACCCACTCCGGAGAGAAGCCCTACAAATGTCCCACCTGTCAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103112 GCGCACCCACTCCGGAGAGAAGCCCTACAAATGTCCCACCTGTCAAAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CCTTCCGTCAGCTGGGGACATTCAAGCGTCACCTGAAAACACACCGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103162 CCTTCCGTCAGCTGGGGACATTCAAGCGTCACCTGAAAACACACCGGGAA

   1500     .    :
   1474 ACCACCTCCCAG
        ||||||||||||
 103212 ACCACCTCCCAG