seq1 = pF1KE3196.tfa, 1410 bp
seq2 = pF1KE3196/gi568815581f_76285106.tfa (gi568815581f:76285106_76487583), 202478 bp

>pF1KE3196 1410
>gi568815581f:76285106_76487583 (Chr17)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-268  (100346-100549)   100% ->
269-421  (100880-101032)   100% ->
422-516  (101116-101210)   100% ->
517-632  (101288-101403)   100% ->
633-1410  (101701-102478)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCTCAAGTTCTGGGATTTTTACGCAGCTGGACTCCCCTCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCTCAAGTTCTGGGATTTTTACGCAGCTGGACTCCCCTCCCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAGCCCCGAGGG         GTCCAGCCGCCGCAGGGAATGACGCCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCAGCCCCGAGGGGTG...CAGGTCCAGCCGCCGCAGGGAATGACGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGCTCCTGCAGCCACGGCTCCGGGCGGGGAAGGCGAGCCCCACAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100373 GTGCTCCTGCAGCCACGGCTCCGGGCGGGGAAGGCGAGCCCCACAGCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTGCGACGCCCGCCTGGGCAGCACCGATAAGGAGCTGAAGGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100423 CCCTGCGACGCCCGCCTGGGCAGCACCGATAAGGAGCTGAAGGCAGGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCCGCCACGGGCAGCGCCCCCACAGCGCCAGGGACCCCCTGGCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100473 CGCCGCCACGGGCAGCGCCCCCACAGCGCCAGGGACCCCCTGGCAGCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCCGCGGGTCGAGGTTATGGATCCAG         CGGGCGGCCCCCGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100523 AGCCGCGGGTCGAGGTTATGGATCCAGGTT...CAGCGGGCGGCCCCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCGTGCTCCCGCGGCCCTGCCGCGTGCTGGTGCTGCTGAACCCGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100894 GGCGTGCTCCCGCGGCCCTGCCGCGTGCTGGTGCTGCTGAACCCGCGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGGCAAGGGCAAGGCCTTGCAGCTCTTCCGGAGTCACGTGCAGCCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100944 CGGCAAGGGCAAGGCCTTGCAGCTCTTCCGGAGTCACGTGCAGCCCCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGCTGAGGCTGAAATCTCCTTCACGCTGATGCTCACTG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100994 TGGCTGAGGCTGAAATCTCCTTCACGCTGATGCTCACTGGTG...CAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGGCGGAACCACGCGCGGGAGCTGGTGCGGTCGGAGGAGCTGGGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101118 CGGCGGAACCACGCGCGGGAGCTGGTGCGGTCGGAGGAGCTGGGCCGCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGACGCTCTGGTGGTCATGTCTGGAGACGGGCTGATGCACGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101168 GGACGCTCTGGTGGTCATGTCTGGAGACGGGCTGATGCACGAGGTG...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    517   GTGGTGAACGGGCTCATGGAGCGGCCTGACTGGGAGACCGCCATCCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101286 AGGTGGTGAACGGGCTCATGGAGCGGCCTGACTGGGAGACCGCCATCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGCCCCTGTGTAGCCTCCCAGCAGGCTCTGGCAACGCGCTGGCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 AAGCCCCTGTGTAGCCTCCCAGCAGGCTCTGGCAACGCGCTGGCAGCTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTGAACCATTATGCTGG         CTATGAGCAGGTCACCAATGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101386 CTTGAACCATTATGCTGGGTG...CAGCTATGAGCAGGTCACCAATGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCTCCTGACCAACTGCACGCTATTGCTGTGCCGCCGGCTGCTGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101724 ACCTCCTGACCAACTGCACGCTATTGCTGTGCCGCCGGCTGCTGTCACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGAACCTGCTGTCTCTGCACACGGCTTCGGGGCTGCGCCTCTTCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101774 ATGAACCTGCTGTCTCTGCACACGGCTTCGGGGCTGCGCCTCTTCTCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTCAGCCTGGCCTGGGGCTTCATTGCTGATGTGGACCTAGAGAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101824 GCTCAGCCTGGCCTGGGGCTTCATTGCTGATGTGGACCTAGAGAGTGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGTATCGGCGTCTGGGGGAGATGCGCTTCACTCTGGGCACCTTCCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101874 AGTATCGGCGTCTGGGGGAGATGCGCTTCACTCTGGGCACCTTCCTGCGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGGCAGCCCTGCGCACCTACCGCGGCCGACTGGCCTACCTCCCTGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101924 CTGGCAGCCCTGCGCACCTACCGCGGCCGACTGGCCTACCTCCCTGTAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AAGAGTGGGTTCCAAGACACCTGCCTCCCCCGTTGTGGTCCAGCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101974 AAGAGTGGGTTCCAAGACACCTGCCTCCCCCGTTGTGGTCCAGCAGGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CGGTAGATGCACACCTTGTGCCACTGGAGGAGCCAGTGCCCTCTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102024 CGGTAGATGCACACCTTGTGCCACTGGAGGAGCCAGTGCCCTCTCACTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACAGTGGTGCCCGACGAGGACTTTGTGCTAGTCCTGGCACTGCTGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102074 ACAGTGGTGCCCGACGAGGACTTTGTGCTAGTCCTGGCACTGCTGCACTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCACCTGGGCAGTGAGATGTTTGCTGCACCCATGGGCCGCTGTGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102124 GCACCTGGGCAGTGAGATGTTTGCTGCACCCATGGGCCGCTGTGCAGCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCGTCATGCATCTGTTCTACGTGCGGGCGGGAGTGTCTCGTGCCATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102174 GCGTCATGCATCTGTTCTACGTGCGGGCGGGAGTGTCTCGTGCCATGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTGCGCCTCTTCCTGGCCATGGAGAAGGGCAGGCATATGGAGTATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102224 CTGCGCCTCTTCCTGGCCATGGAGAAGGGCAGGCATATGGAGTATGAATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CCCCTACTTGGTATATGTGCCCGTGGTCGCCTTCCGCTTGGAGCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102274 CCCCTACTTGGTATATGTGCCCGTGGTCGCCTTCCGCTTGGAGCCCAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ATGGGAAAGGTGTGTTTGCAGTGGATGGGGAATTGATGGTTAGCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102324 ATGGGAAAGGTGTGTTTGCAGTGGATGGGGAATTGATGGTTAGCGAGGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GTGCAGGGCCAGGTGCACCCAAACTACTTCTGGATGGTCAGCGGTTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102374 GTGCAGGGCCAGGTGCACCCAAACTACTTCTGGATGGTCAGCGGTTGCGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGAGCCCCCGCCCAGCTGGAAGCCCCAGCAGATGCCACCGCCAGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102424 GGAGCCCCCGCCCAGCTGGAAGCCCCAGCAGATGCCACCGCCAGAAGAGC

   1450     .
   1406 CCTTA
        |||||
 102474 CCTTA