seq1 = pF1KE3168.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KE3168/gi568815589r_127821850.tfa (gi568815589r:127821850_128027193), 205344 bp

>pF1KE3168 573
>gi568815589r:127821850_128027193 (Chr9)

(complement)

1-41  (100001-100041)   100% ->
42-154  (101215-101327)   100% ->
155-308  (101934-102087)   100% ->
309-573  (105080-105344)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAGCGTCTTCTACCCCGCCGGCCGCATCTCCGAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 ATGCAGAGCGTCTTCTACCCCGCCGGCCGCATCTCCGAGAGGTG...CAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTATGACATCAAAGGCTGCGAGGTGAGCCGCTGGGTGGATCCCGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101215 GTATGACATCAAAGGCTGCGAGGTGAGCCGCTGGGTGGATCCCGCCCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGGCAGCCCCCTTGTTCTGGTGCTGAAGGACCTCAACTTTCAGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101265 AGGGCAGCCCCCTTGTTCTGGTGCTGAAGGACCTCAACTTTCAGGGCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCATCAACCTGG         GGCCCCAGCGGAGCTGGTTCCTCCGCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101315 ACCATCAACCTGGGTG...CAGGGCCCCAGCGGAGCTGGTTCCTCCGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATGGAACTGGATACCACCTTCCTCCGGGAGCTCAACGTGCTGGATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101962 GATGGAACTGGATACCACCTTCCTCCGGGAGCTCAACGTGCTGGATTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCTCCTGATAGCCTTCCAACGTCTCCACGAGGATGAGAGGGGCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102012 GCCTCCTGATAGCCTTCCAACGTCTCCACGAGGATGAGAGGGGCCCGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCAGCCTCATCTTCCGCACGGCCAG         GTCTGTGCAAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102062 AGCAGCCTCATCTTCCGCACGGCCAGGTG...CAGGTCTGTGCAAGGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAGAGCCCGGAAGAGTCGAGAGCCCAAAACCGCCGGCTGCTGCCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105095 ACAGAGCCCGGAAGAGTCGAGAGCCCAAAACCGCCGGCTGCTGCCCGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCCCAACGCCCTACACATCCTGGACGGGCCCGAGCAGCGCTATTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105145 CCCCCAACGCCCTACACATCCTGGACGGGCCCGAGCAGCGCTATTTCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCGTCGTGGATCTCGCCACAGTCTACGGGCTCCGCAAGCGGCTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105195 GGCGTCGTGGATCTCGCCACAGTCTACGGGCTCCGCAAGCGGCTGGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGTGGAAGACACTGCGCTACCCAGGCCGGACCTTCTCCACTGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105245 CCTGTGGAAGACACTGCGCTACCCAGGCCGGACCTTCTCCACTGTCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGGCTCGCTACGCCCGTCGCCTCTGCCAGTGGGTGGAGGCGCACACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105295 CGGCTCGCTACGCCCGTCGCCTCTGCCAGTGGGTGGAGGCGCACACGGAG