seq1 = pF1KE3137.tfa, 1044 bp
seq2 = pF1KE3137/gi568815588f_122880480.tfa (gi568815588f:122880480_123087500), 207021 bp

>pF1KE3137 1044
>gi568815588f:122880480_123087500 (Chr10)

1-216  (100001-100216)   100% ->
217-508  (102254-102545)   100% ->
509-707  (102793-102991)   98% ->
708-783  (105821-105896)   100% ->
784-877  (106390-106483)   100% ->
878-1044  (106855-107021)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGACCGCCGAGAACATCAGAGGAACCGGCAGCGACGGGCCGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGACCGCCGAGAACATCAGAGGAACCGGCAGCGACGGGCCGCGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACGAGGCCTCTGCGTCCTCTGTGGCCTCCCCGCGGCAGGAAAATCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACGAGGCCTCTGCGTCCTCTGTGGCCTCCCCGCGGCAGGAAAATCGACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCGCGCGCCCTCGCCCACCGGCTGCAGCAGGAGCAGGGTTGGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCGCGCGCCCTCGCCCACCGGCTGCAGCAGGAGCAGGGTTGGGCCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGTTGTCGCGTATGATGACGTCATGCCCGACGCGTTTCTCGCCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGTTGTCGCGTATGATGACGTCATGCCCGACGCGTTTCTCGCCGGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAGAGCGCGACCGGCG         CCATCCCAATGGAAATTGCTTCGAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100201 AAGAGCGCGACCGGCGGTC...TAGCCATCCCAATGGAAATTGCTTCGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAACTGTTGAAGTACCTGGAATACTTCTTGATGGCTGTCATTAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102279 AGGAACTGTTGAAGTACCTGGAATACTTCTTGATGGCTGTCATTAATGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGTCAGATGTCTGTCCCACCCAACAGGACTGAAGCCATGTGGGAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102329 TGTCAGATGTCTGTCCCACCCAACAGGACTGAAGCCATGTGGGAAGATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TATAACCTGCTTAAAGGATCAAGATCTGATATTTTCTGCAGCATTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102379 TATAACCTGCTTAAAGGATCAAGATCTGATATTTTCTGCAGCATTTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCAGTCTTGCTACCTCTTAACAAAAACTGCTGTTTCTAGACCTTTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102429 CCCAGTCTTGCTACCTCTTAACAAAAACTGCTGTTTCTAGACCTTTGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTGGTTTTGGATGACAATTTTTATTATCAGAGTATGAGATATGAAGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102479 TTGGTTTTGGATGACAATTTTTATTATCAGAGTATGAGATATGAAGTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAGCTGGCTCGGAAAT         ATTCATTGGGCTTTTGCCAGCTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>|||| |||||||||||||||||||
 102529 CCAGCTGGCTCGGAAATGTA...CAGATTCGTTGGGCTTTTGCCAGCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTTTAGATTGTCCTCTTGAGACCTGTTTACAGAGGAATGGCCAGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102817 TTTTAGATTGTCCTCTTGAGACCTGTTTACAGAGGAATGGCCAGAGGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAGGCACTGCCTCCTGAGACCATCCACCTGATGCGAAGAAAGCTAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 102867 CAGGCACTGCCTCCTGAGACCATCCACCTGATGGGAAGAAAGCTAGAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCCCAACCCTGAGAAAAATGCTTGGGAACACAACAGCCTCACAATTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102917 GCCCAACCCTGAGAAAAATGCTTGGGAACACAACAGCCTCACAATTCCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTCCAGCATGTGCTTCGGAGGCCAG         CCTGGAAGTGACTGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102967 GTCCAGCATGTGCTTCGGAGGCCAGGTA...TAGCCTGGAAGTGACTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTATTGCTCACTGCTTTGGAAAATCCAGTAAAATATGCTGAGGACAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105837 TTATTGCTCACTGCTTTGGAAAATCCAGTAAAATATGCTGAGGACAATAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGAACAAAAG         GACACAGACAGAATTATTTGTTCAACTAACA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105887 GGAACAAAAGGTA...TAGGACACAGACAGAATTATTTGTTCAACTAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTCTTCATAAAACTGATCAGACACTCCGAAGGATTGTATCTCAGACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106421 TTCTTCATAAAACTGATCAGACACTCCGAAGGATTGTATCTCAGACAATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAGGAAGCAAAAG         GTAATCAGGAAGCCTTCTCAGAGATGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106471 AAGGAAGCAAAAGGTA...AAGGTAATCAGGAAGCCTTCTCAGAGATGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ATTTAAGCAAAGATGGGTAAGAGCGAACCATGCAGCTATCTGGAGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106883 ATTTAAGCAAAGATGGGTAAGAGCGAACCATGCAGCTATCTGGAGGATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTCTAGGCAATGAACACATCAAGTGCAGAAGCGCAAAGGTTGGCTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106933 TTCTAGGCAATGAACACATCAAGTGCAGAAGCGCAAAGGTTGGCTGGTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .
   1006 CAGTGTTGCAGAATCGAGAAGAGGCCATTGAGCACGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106983 CAGTGTTGCAGAATCGAGAAGAGGCCATTGAGCACGGGG