seq1 = pF1KE3108.tfa, 831 bp
seq2 = pF1KE3108/gi568815589r_131425043.tfa (gi568815589r:131425043_131631174), 206132 bp

>pF1KE3108 831
>gi568815589r:131425043_131631174 (Chr9)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-268  (100530-100689)   100% ->
269-365  (101591-101687)   100% ->
366-508  (101905-102047)   100% ->
509-603  (102137-102231)   100% ->
604-652  (105198-105246)   100% ->
653-831  (105954-106132)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCGGCGGGAGGCGAAGACTGCGAGAGCCCCGCGCCGGAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCGGCGGGAGGCGAAGACTGCGAGAGCCCCGCGCCGGAGGCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGTCCGCACCAGCGGCCCTTCCTGATAGGGGTGAGCGGCGGCACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGTCCGCACCAGCGGCCCTTCCTGATAGGGGTGAGCGGCGGCACTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGAAG         TCGACCGTGTGTGAGAAGATCATGGAGTTGCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGAAGGTA...CAGTCGACCGTGTGTGAGAAGATCATGGAGTTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGACAGAACGAGGTGGAACAGCGGCAGCGGAAGGTGGTCATCCTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100563 GGACAGAACGAGGTGGAACAGCGGCAGCGGAAGGTGGTCATCCTGAGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACAGGTTCTACAAGGTCCTGACGGCAGAGCAGAAGGCCAAGGCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100613 GGACAGGTTCTACAAGGTCCTGACGGCAGAGCAGAAGGCCAAGGCCTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGGACAGTACAATTTTGACCATCCAG         ATGCCTTTGATAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100663 AAGGACAGTACAATTTTGACCATCCAGGTA...CAGATGCCTTTGATAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATTTGATGCACAGGACTCTGAAGAACATCGTGGAGGGCAAAACGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101605 GATTTGATGCACAGGACTCTGAAGAACATCGTGGAGGGCAAAACGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGCCGACCTATGATTTTGTGACACACTCAAG         GTTACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101655 GGTGCCGACCTATGATTTTGTGACACACTCAAGGTA...CAGGTTACCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGACCACGGTGGTCTACCCTGCGGACGTGGTTCTGTTTGAGGGCATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101913 AGACCACGGTGGTCTACCCTGCGGACGTGGTTCTGTTTGAGGGCATCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGTTCTACAGCCAGGAGATCCGGGACATGTTCCACCTGCGCCTCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101963 GTGTTCTACAGCCAGGAGATCCGGGACATGTTCCACCTGCGCCTCTTCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGACACCGACTCCGACGTCAGGCTGTCTCGAAGAG         TTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102013 GGACACCGACTCCGACGTCAGGCTGTCTCGAAGAGGTA...CAGTTCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGGACGTGCGCCGAGGGAGGGACCTGGAGCAGATTCTGACGCAGTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102143 GGGACGTGCGCCGAGGGAGGGACCTGGAGCAGATTCTGACGCAGTACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCTTCGTGAAGCCGGCCTTCGAGGAGTTCTGCCTGCCG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102193 ACCTTCGTGAAGCCGGCCTTCGAGGAGTTCTGCCTGCCGGTA...CAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AAAGAAGTATGCCGATGTGATCATCCCGCGAGGAGTGGACAATATGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105200 AAAGAAGTATGCCGATGTGATCATCCCGCGAGGAGTGGACAATATGGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    653       TTGCCATCAACCTGATCGTGCAGCACATCCAGGACATTCTGAAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105250 ...CAGTTGCCATCAACCTGATCGTGCAGCACATCCAGGACATTCTGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGTGACATCTGCAAATGGCACCGAGGAGGGTCCAATGGGCGGAGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105998 GGTGACATCTGCAAATGGCACCGAGGAGGGTCCAATGGGCGGAGCTACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCGGACCTTTTCTGAGCCAGGGGACCACCCTGGGATGCTGACCTCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106048 GCGGACCTTTTCTGAGCCAGGGGACCACCCTGGGATGCTGACCTCTGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .
    797 AACGGTCACATTTGGAGTCCAGCAGCAGACCCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106098 AACGGTCACATTTGGAGTCCAGCAGCAGACCCCAC