seq1 = pF1KE3101.tfa, 801 bp
seq2 = pF1KE3101/gi568815589r_14620093.tfa (gi568815589r:14620093_14822672), 202580 bp

>pF1KE3101 801
>gi568815589r:14620093_14822672 (Chr9)

(complement)

1-507  (100001-100507)   99% ->
508-801  (102287-102580)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATCTCCTCTTATTTCAGCTGCTGGTACTCCTGCCTCTAGGAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATCTCCTCTTATTTCAGCTGCTGGTACTCCTGCCTCTAGGAAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACATGGCACCAGGATGGCCGCCAGAATCAGAGTTCTCTTTCCCCCGTAC
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACACGGCACCAGGATGGCCGCCAGAATCAGAGTTCTCTTTCCCCCGTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGCCAAGGAATCAAAGAGAGCTTCCCACAGGCAACCATGAGGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTGCCAAGGAATCAAAGAGAGCTTCCCACAGGCAACCATGAGGAAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGAAGCCAGATCTGCTTGTCGCAGTGCCACACCTTGTAGGCACCAG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
 100151 GAGGAGAAGCCAGATCTGTTTGTCGCAGTGCCACACCTTGTAGCCACCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTGCAGGGGAAGGCCAGAGGCAGAGAGAGAAGATGCTGTCCAGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTGCAGGGGAAGGCCAGAGGCAGAGAGAGAAGATGCTGTCCAGATTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGGTTCTGGAAGAAGCCTGAGAGAGAAATGCATCCATCCAGGGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGGTTCTGGAAGAAGCCTGAGAGAGAAATGCATCCATCCAGGGACTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATAGTGAGCCCTTCCCACCTGGGACCCAGTCCCTCATCCAGCCGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATAGTGAGCCCTTCCCACCTGGGACCCAGTCCCTCATCCAGCCGATAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGAATGAAAATGGAGAAATCTCCTCTTCGGGAAGAAGCCAAGAAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGAATGAAAATGGAGAAATCTCCTCTTCGGGAAGAAGCCAAGAAATTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCACCACTTCATGTTCAGAAAAACTCCGGCTTCTCAGGGGGTCATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCACCACTTCATGTTCAGAAAAACTCCGGCTTCTCAGGGGGTCATCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCATCAAAAGCCATGAAGTACATTGGGAGACCTGCAGGACAGTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCATCAAAAGCCATGAAGTACATTGGGAGACCTGCAGGACAGTGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCCAG         ACTATAACCCACGAAGGCTGTGAAAAAATAGTTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100501 CAGCCAGGTA...TAGACTATAACCCACGAAGGCTGTGAAAAAGTAGTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTCAGAACAACCTTTGCTTTGGGAAATGCGGGTCTGTTCATTTTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102321 TTCAGAACAACCTTTGCTTTGGGAAATGCGGGTCTGTTCATTTTCCTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCGCGCAGCACTCCCATACCTCCTGCTCTCACTGTTTGCCTGCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102371 GCCGCGCAGCACTCCCATACCTCCTGCTCTCACTGTTTGCCTGCCAAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CACCACGATGCACTTGCCACTGAACTGCACTGAACTTTCCTCCGTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102421 CACCACGATGCACTTGCCACTGAACTGCACTGAACTTTCCTCCGTGATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGGTGGTGATGCTGGTGGAGGAGTGCCAGTGCAAGGTGAAGACGGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102471 AGGTGGTGATGCTGGTGGAGGAGTGCCAGTGCAAGGTGAAGACGGAGCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAAGATGGACACATCCTACATGCTGGCTCCCAGGATTCCTTTATCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102521 GAAGATGGACACATCCTACATGCTGGCTCCCAGGATTCCTTTATCCCAGG

    800     .    :
    792 AGTTTCAGCT
        ||||||||||
 102571 AGTTTCAGCT