seq1 = pF1KE3092.tfa, 786 bp
seq2 = pF1KE3092/gi568815589f_122170892.tfa (gi568815589f:122170892_122422614), 251723 bp

>pF1KE3092 786
>gi568815589f:122170892_122422614 (Chr9)

1-184  (100001-100184)   100% ->
185-340  (109552-109707)   100% ->
341-459  (114278-114396)   100% ->
460-551  (120858-120949)   100% ->
552-711  (142336-142495)   100% ->
712-786  (151649-151723)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTGGGATTAAAGTGCTTCCGCATGGTCCACCCTACCTTTCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTGGGATTAAAGTGCTTCCGCATGGTCCACCCTACCTTTCGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTATCTTGCAGCCTCTATCAGACCCGTTTCAGAAGTTACACTGAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTATCTTGCAGCCTCTATCAGACCCGTTTCAGAAGTTACACTGAAGACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCATGAAAGACAACATGGCCATAGGCAATACATGGCCTATTCAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCATGAAAGACAACATGGCCATAGGCAATACATGGCCTATTCAGCTGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAGTCCGCCATTTTGCTACCAAGAAAGCCAAAG         CCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100151 CCAGTCCGCCATTTTGCTACCAAGAAAGCCAAAGGTA...TAGCCAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGGACAGTCCCAAACCAGAGTGAATATTAATGCTGCCTTGGTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109559 GAAAGGACAGTCCCAAACCAGAGTGAATATTAATGCTGCCTTGGTTGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATAATCAACTTGGAAGAGGTGAATGAAGAAATGAAGTCTGTGATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109609 ATATAATCAACTTGGAAGAGGTGAATGAAGAAATGAAGTCTGTGATAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTCTCAAGGATAATTTCAATAAGACTCTCAATATAAGGACCTCACCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109659 GCTCTCAAGGATAATTTCAATAAGACTCTCAATATAAGGACCTCACCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341         GATCCCTTGACAAGATTGCTGTGGTAACTGCTGACGGGAAGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109709 TT...TAGGATCCCTTGACAAGATTGCTGTGGTAACTGCTGACGGGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGCTTTAAACCAGATTAGCCAGATCTCCATGAAGTCGCCACAGCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114320 TTGCTTTAAACCAGATTAGCCAGATCTCCATGAAGTCGCCACAGCTGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTGGTGAATATGGCCAGCTTCCCAGAG         TGTACAGCTGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114370 TTGGTGAATATGGCCAGCTTCCCAGAGGTA...CAGTGTACAGCTGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATCAAGGCTATAAGAGAAAGTGGAATGAATCTGAACCCAGAAGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120872 TATCAAGGCTATAAGAGAAAGTGGAATGAATCTGAACCCAGAAGTGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGACGCTAATTCGGGTACCCATTCCCCA         AGTAACCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 120922 GGACGCTAATTCGGGTACCCATTCCCCAGTA...CAGAGTAACCAGAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CACAGAGAAATGCTGGTGAAACTGGCCAAACAGAACACCAACAAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142349 CACAGAGAAATGCTGGTGAAACTGGCCAAACAGAACACCAACAAGGCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGACTCTTTACGGAAGGTTCGCACCAACTCAATGAACAAGCTGAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142399 AGACTCTTTACGGAAGGTTCGCACCAACTCAATGAACAAGCTGAAGAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCAAGGATACAGTCTCAGAGGACACCATTAGGCTAATAGAGAAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 142449 CCAAGGATACAGTCTCAGAGGACACCATTAGGCTAATAGAGAAACAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    712       ATCAGCCAAATGGCCGATGACACAGTGGCAGAACTGGACAGGCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142499 ...CAGATCAGCCAAATGGCCGATGACACAGTGGCAGAACTGGACAGGCA

    800     .    :    .    :    .    :
    756 TCTGGCAGTGAAGACCAAAGAACTCCTTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 151693 TCTGGCAGTGAAGACCAAAGAACTCCTTGGA